Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489366
• Subject: NM_019939.2
• Aligned Length: 1621
• Identities: 1466
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGCAGCAAGTCTTGGAAAACCTTACGGAGCTGCCCTCGTCTACTGGAGCAGAAGAAATAGACCTAATTTTCCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCAAGTTTTGGAAAACCTTACAGAGCTGCCCTCATCTACAGGAGCAGAGGAGATAGACCTAATTTTCCT  74

Query   75  CAAGGGAATTATGGAGAATCCTATTGTAAAATCACTTGCTAAGGCTCATGAGAGGCTAGAAGATTCCAAACTAG  148
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||
Sbjct   75  CAAGGGGATTATGGAGAATCCTATTGTGAAGTCACTTGCTAAGGCTCATGAGAGACTTGAAGATTCAAAGTTAG  148

Query  149  AAGCTGTCAGTGACAATAACTTGGAATTAGTCAATGAAATTCTTGAAGACATCACTCCTCTAATAAATGTGGAT  222
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|.|||||||
Sbjct  149  AAGCTGTGAGTGACAATAACTTGGAATTAGTGAATGAAATTCTTGAAGATATCACTCCTCTGATTAGTGTGGAT  222

Query  223  GAAAATGTGGCAGAATTGGTTGGTATACTCAAAGAACCTCACTTCCAGTCACTGTTGGAGGCCCATGATATTGT  296
            ||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAATGTGGCAGAGCTAGTTGGGATACTCAAGGAGCCTCACTTCCAGTCGCTCCTGGAGGCCCATGATATTGT  296

Query  297  GGCATCAAAGTGTTATGATTCACCTCCATCAAGCCCAGAAATGAATAATTCTTCTATCAATAATCAGTTATTAC  370
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||   |||.|
Sbjct  297  GGCATCAAAGTGTTATGATTCGCCTCCTTCCAGCCCAGAAATGAATATTCCTTCTCTCAATAATCA---ATTGC  367

Query  371  CAGTAGATGCCATTCGTATTCTTGGTATTCACAAAAGAGCTGGGGAACCACTGGGTGTGACATTTAGGGTTGAA  444
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||||||
Sbjct  368  CAGTAGATGCCATCCGTATTCTCGGTATTCACAAAAAAGCTGGAGAGCCATTGGGTGTAACATTTAGAGTTGAA  441

Query  445  AATAATGATCTGGTAATTGCCCGAATCCTCCATGGGGGAATGATAGATCGACAAGGTCTACTTCATGTGGGAGA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  442  AATAATGATCTGGTAATCGCCCGAATCCTTCATGGAGGAATGATAGATCGACAAGGTCTGCTTCACGTGGGAGA  515

Query  519  TATAATTAAAGAAGTCAATGGCCATGAGGTTGGAAATAATCCAAAGGAATTACAAGAATTACTGAAAAATATTA  592
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  516  TATCATTAAGGAAGTCAATGGTCATGAGGTTGGAAACAATCCAAAGGAATTACAAGAATTATTGAAAAATATTA  589

Query  593  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATCTTACCAAGTTATAGAGATACCATTACTCCTCAACAGGTATTTGTGAAGTGT  666
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  590  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATTTTACCAAGTTACAGAGATACTATTACTCCTCAGCAGGTATTTGTCAAGTGT  663

Query  667  CATTTTGATTATAATCCATACAATGACAACCTAATACCTTGCAAAGAAGCAGGATTGAAGTTTTCCAAAGGAGA  740
            |||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||||
Sbjct  664  CATTTTGATTATAATCCATTCAATGATAACCTGATACCCTGCAAAGAAGCAGGACTAAAATTTTCCAAAGGAGA  737

Query  741  AATTCTTCAGATTGTAAATAGAGAAGATCCAAATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTAAAAGAGGGAGGAAGCGCTG  814
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  738  AATTCTTCAGATTGTAAACAGAGAAGACCCAAATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTGAAAGAGGGAGGAAGTGCTG  811

Query  815  GTCTCATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAGAGAAAGGCATTTGTTAGAAGAGACTGGGACAATTCAGGACCT  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||.
Sbjct  812  GTCTGATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAGAGAAAGGCATTTGTTCGCCGAGACTGGGACAATTCAGGACCC  885

Query  889  TTTTGTGGAACTATAAGTAGCAAAAAAAAGAAAAAGATGATGTATCTCACAACCAGAAATGCAGAATTTGATCG  962
            |||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  886  TTTTGTGGAACTATAAGCAACAAGAAAAAGAAAAAGATGATGTACCTCACAACCAGGAATGCAGAGTTTGATCG  959

Query  963  TCATGAAATCCAGATATATGAGGAGGTAGCCAAAATGCCTCCCTTCCAGAGAAAAACATTAGTATTGATAGGAG  1036
            |||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  960  TCATGAAATTCAGATCTATGAGGAAGTAGCAAAAATGCCACCCTTCCAACGGAAAACGTTAGTTTTGATCGGAG  1033

Query 1037  CTCAAGGTGTAGGCCGAAGAAGCTTGAAAAACAGGTTCATAGTATTGAATCCCACTAGATTTGGAACTACGGTG  1110
            ||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||.||||||
Sbjct 1034  CTCAAGGTGTGGGCAGAAGGAGCTTGAAAAACAGGTTCATAGTACTGAATCCTGCTAGATTTGGAACAACGGTG  1107

Query 1111  CCATTTACTTCACGGAAACCAAGGGAAGATGAAAAAGATGGCCAGGCATATAAGTTTGTGTCACGATCTGAGAT  1184
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1108  CCATTTACTTCACGGAAGCCAAGAGAAGACGAAAAGGATGGACAAGCATATAAATTTGTGTCCCGATCAGAGAT  1181

Query 1185  GGAAGCAGATATTAAAGCTGGAAAGTATTTGGAACATGGGGAATATGAAGGAAATCTCTATGGAACCAAAATTG  1258
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1182  GGAAGCAGATATTAAGGCTGGGAAGTATTTGGAGCATGGGGAGTACGAAGGAAACCTGTATGGAACCAAGATCG  1255

Query 1259  ATTCTATTCTTGAGGTTGTCCAAACTGGACGGACTTGCATTCTGGATGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTATTG  1332
            |.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1256  ACTCTATTCTCGAGGTTGTCCAGACTGGGCGGACTTGCATTTTGGACGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTGTTA  1329

Query 1333  AGGACATCAGAGTTTATGCCCTATGTGGTATTTATTGCGGCTCCGGAGCTAGAGACGTTACGTGCCATGCACAA  1406
            |||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1330  AGGACTTCTGAATTCATGCCTTATGTGGTGTTTATTGCTGCTCCAGAGCTAGAGACCTTGCGTGCCATGCACAA  1403

Query 1407  GGCTGTGGTGGATGCAGGAATCACTACCAAGCTTCTGACCGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTG  1480
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GGCTGTGGTGGATGCGGGAATCACCACCAAGCTTTTGACGGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTG  1477

Query 1481  CACGGATTCAGAGAGCATACAACCACTATTTTGATTTGATCATCATAAATGATAATCTAGACAAAGCCTTTGAA  1554
            |.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1478  CCCGAATTCAGAGAGCATACAACCACTACTTTGATTTGATCATCGTAAATGACAATCTAGACAAAGCCTTTGAG  1551

Query 1555  AAACTGCAAACTGCCATAGAGAAACTGAGAATGGAACCACAGTGGGTCCCAATCAGCTGGGTTTACG  1621
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||| 
Sbjct 1552  AAACTACAAACTGCCATTGAGAAACTGAGGATGGAGCCACAGTGGGTCCCAATTAGCTGGGTGTAC-  1617