Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489368
- Subject:
- XM_011521517.2
- Aligned Length:
- 4102
- Identities:
- 2766
- Gaps:
- 1336
Alignment
Query 1 ATGAAGTCTGGCTCCGGAGGAGGGTCCCCGACCTCGCTGTGGGGGCTCCTGTTTCTCTCCGCCGCGCTCTCGCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGGCCGACGAGTGGAGAAATCTGCGGGCCAGGCATCGACATCCGCAACGACTATCAGCAGCTGAAGCGCCTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAACTGCACGGTGATCGAGGGCTACCTCCACATCCTGCTCATCTCCAAGGCCGAGGACTACCGCAGCTACCGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTCCCCAAGCTCACGGTCATTACCGAGTACTTGCTGCTGTTCCGAGTGGCTGGCCTCGAGAGCCTCGGAGACCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTTCCCCAACCTCACGGTCATCCGCGGCTGGAAACTCTTCTACAACTACGCCCTGGTCATCTTCGAGATGACCA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATCTCAAGGATATTGGGCTTTACAACCTGAGGAACATTACTCGGGGGGCCATCAGGATTGAGAAAAATGCTGAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CTCTGTTACCTCTCCACTGTGGACTGGTCCCTGATCCTGGATGCGGTGTCCAATAACTACATTGTGGGGAATAA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GCCCCCAAAGGAATGTGGGGACCTGTGTCCAGGGACCATGGAGGAGAAGCCGATGTGTGAGAAGACCACCATCA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 ACAATGAGTACAACTACCGCTGCTGGACCACAAACCGCTGCCAGAAAATGTGCCCAAGCACGTGTGGGAAGCGG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCGTGCACCGAGAACAATGAGTGCTGCCACCCCGAGTGCCTGGGCAGCTGCAGCGCGCCTGACAACGACACGGC 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CTGTGTAGCTTGCCGCCACTACTACTATGCCGGTGTCTGTGTGCCTGCCTGCCCGCCCAACACCTACAGGTTTG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 AGGGCTGGCGCTGTGTGGACCGTGACTTCTGCGCCAACATCCTCAGCGCCGAGAGCAGCGACTCCGAGGGGTTT 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 GTGATCCACGACGGCGAGTGCATGCAGGAGTGCCCCTCGGGCTTCATCCGCAACGGCAGCCAGAGCATGTACTG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CATCCCTTGTGAAGGTCCTTGCCCGAAGGTCTGTGAGGAAGAAAAGAAAACAAAGACCATTGATTCTGTTACTT 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 CTGCTCAGATGCTCCAAGGATGCACCATCTTCAAGGGCAATTTGCTCATTAACATCCGACGGGGGAATAACATT 1110
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1111 GCTTCAGAGCTGGAGAACTTCATGGGGCTCATCGAGGTGGTGACGGGCTACGTGAAGATCCGCCATTCTCATGC 1184
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1185 CTTGGTCTCCTTGTCCTTCCTAAAAAACCTTCGCCTCATCCTAGGAGAGGAGCAGCTAGAAGGGAATTACTCCT 1258
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1259 TCTACGTCCTCGACAACCAGAACTTGCAGCAACTGTGGGACTGGGACCACCGCAACCTGACCATCAAAGCAGGG 1332
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1333 AAAATGTACTTTGCTTTCAATCCCAAATTATGTGTTTCCGAAATTTACCGCATGGAGGAAGTGACGGGGACTAA 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGTACTTTGCTTTCAATCCCAAATTATGTGTTTCCGAAATTTACCGCATGGAGGAAGTGACGGGGACTAA 71
Query 1407 AGGGCGCCAAAGCAAAGGGGACATAAACACCAGGAACAACGGGGAGAGAGCCTCCTGTGAAAGTGACGTCCTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 AGGGCGCCAAAGCAAAGGGGACATAAACACCAGGAACAACGGGGAGAGAGCCTCCTGTGAAAGTGACGTCCTGC 145
Query 1481 ATTTCACCTCCACCACCACGTCGAAGAATCGCATCATCATAACCTGGCACCGGTACCGGCCCCCTGACTACAGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 ATTTCACCTCCACCACCACGTCGAAGAATCGCATCATCATAACCTGGCACCGGTACCGGCCCCCTGACTACAGG 219
Query 1555 GATCTCATCAGCTTCACCGTTTACTACAAGGAAGCACCCTTTAAGAATGTCACAGAGTATGATGGGCAGGATGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 GATCTCATCAGCTTCACCGTTTACTACAAGGAAGCACCCTTTAAGAATGTCACAGAGTATGATGGGCAGGATGC 293
Query 1629 CTGCGGCTCCAACAGCTGGAACATGGTGGACGTGGACCTCCCGCCCAACAAGGACGTGGAGCCCGGCATCTTAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CTGCGGCTCCAACAGCTGGAACATGGTGGACGTGGACCTCCCGCCCAACAAGGACGTGGAGCCCGGCATCTTAC 367
Query 1703 TACATGGGCTGAAGCCCTGGACTCAGTACGCCGTTTACGTCAAGGCTGTGACCCTCACCATGGTGGAGAACGAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TACATGGGCTGAAGCCCTGGACTCAGTACGCCGTTTACGTCAAGGCTGTGACCCTCACCATGGTGGAGAACGAC 441
Query 1777 CATATCCGTGGGGCCAAGAGTGAGATCTTGTACATTCGCACCAATGCTTCAGTTCCTTCCATTCCCTTGGACGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 CATATCCGTGGGGCCAAGAGTGAGATCTTGTACATTCGCACCAATGCTTCAGTTCCTTCCATTCCCTTGGACGT 515
Query 1851 TCTTTCAGCATCGAACTCCTCTTCTCAGTTAATCGTGAAGTGGAACCCTCCCTCTCTGCCCAACGGCAACCTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TCTTTCAGCATCGAACTCCTCTTCTCAGTTAATCGTGAAGTGGAACCCTCCCTCTCTGCCCAACGGCAACCTGA 589
Query 1925 GTTACTACATTGTGCGCTGGCAGCGGCAGCCTCAGGACGGCTACCTTTACCGGCACAATTACTGCTCCAAAGAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GTTACTACATTGTGCGCTGGCAGCGGCAGCCTCAGGACGGCTACCTTTACCGGCACAATTACTGCTCCAAAGAC 663
Query 1999 AAAATCCCCATCAGGAAGTATGCCGACGGCACCATCGACATTGAGGAGGTCACAGAGAACCCCAAGACTGAGGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AAAATCCCCATCAGGAAGTATGCCGACGGCACCATCGACATTGAGGAGGTCACAGAGAACCCCAAGACTGAGGT 737
Query 2073 GTGTGGTGGGGAGAAAGGGCCTTGCTGCGCCTGCCCCAAAACTGAAGCCGAGAAGCAGGCCGAGAAGGAGGAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GTGTGGTGGGGAGAAAGGGCCTTGCTGCGCCTGCCCCAAAACTGAAGCCGAGAAGCAGGCCGAGAAGGAGGAGG 811
Query 2147 CTGAATACCGCAAAGTCTTTGAGAATTTCCTGCACAACTCCATCTTCGTGCCCAGACCTGAAAGGAAGCGGAGA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CTGAATACCGCAAAGTCTTTGAGAATTTCCTGCACAACTCCATCTTCGTGCCCAGACCTGAAAGGAAGCGGAGA 885
Query 2221 GATGTCATGCAAGTGGCCAACACCACCATGTCCAGCCGAAGCAGGAACACCACGGCCGCAGACACCTACAACAT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GATGTCATGCAAGTGGCCAACACCACCATGTCCAGCCGAAGCAGGAACACCACGGCCGCAGACACCTACAACAT 959
Query 2295 CACCGACCCGGAAGAGCTGGAGACAGAGTACCCTTTCTTTGAGAGCAGAGTGGATAACAAGGAGAGAACTGTCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CACCGACCCGGAAGAGCTGGAGACAGAGTACCCTTTCTTTGAGAGCAGAGTGGATAACAAGGAGAGAACTGTCA 1033
Query 2369 TTTCTAACCTTCGGCCTTTCACATTGTACCGCATCGATATCCACAGCTGCAACCACGAGGCTGAGAAGCTGGGC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TTTCTAACCTTCGGCCTTTCACATTGTACCGCATCGATATCCACAGCTGCAACCACGAGGCTGAGAAGCTGGGC 1107
Query 2443 TGCAGCGCCTCCAACTTCGTCTTTGCAAGGACTATGCCCGCAGAAGGAGCAGATGACATTCCTGGGCCAGTGAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 TGCAGCGCCTCCAACTTCGTCTTTGCAAGGACTATGCCCGCAGAAGGAGCAGATGACATTCCTGGGCCAGTGAC 1181
Query 2517 CTGGGAGCCAAGGCCTGAAAACTCCATCTTTTTAAAGTGGCCGGAACCTGAGAATCCCAATGGATTGATTCTAA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CTGGGAGCCAAGGCCTGAAAACTCCATCTTTTTAAAGTGGCCGGAACCTGAGAATCCCAATGGATTGATTCTAA 1255
Query 2591 TGTATGAAATAAAATACGGATCACAAGTTGAGGATCAGCGAGAATGTGTGTCCAGACAGGAATACAGGAAGTAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 TGTATGAAATAAAATACGGATCACAAGTTGAGGATCAGCGAGAATGTGTGTCCAGACAGGAATACAGGAAGTAT 1329
Query 2665 GGAGGGGCCAAGCTAAACCGGCTAAACCCGGGGAACTACACAGCCCGGATTCAGGCCACATCTCTCTCTGGGAA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GGAGGGGCCAAGCTAAACCGGCTAAACCCGGGGAACTACACAGCCCGGATTCAGGCCACATCTCTCTCTGGGAA 1403
Query 2739 TGGGTCGTGGACAGATCCTGTGTTCTTCTATGTCCAGGCCAAAACAGGATATGAAAACTTCATCCATCTGATCA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 TGGGTCGTGGACAGATCCTGTGTTCTTCTATGTCCAGGCCAAAACAGGATATGAAAACTTCATCCATCTGATCA 1477
Query 2813 TCGCTCTGCCCGTCGCTGTCCTGTTGATCGTGGGAGGGTTGGTGATTATGCTGTACGTCTTCCATAGAAAGAGA 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TCGCTCTGCCCGTCGCTGTCCTGTTGATCGTGGGAGGGTTGGTGATTATGCTGTACGTCTTCCATAGAAAGAGA 1551
Query 2887 AATAACAGCAGGCTGGGGAATGGAGTGCTGTATGCCTCTGTGAACCCGGAGTACTTCAGCGCTGCTGATGTGTA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AATAACAGCAGGCTGGGGAATGGAGTGCTGTATGCCTCTGTGAACCCGGAGTACTTCAGCGCTGCTGATGTGTA 1625
Query 2961 CGTTCCTGATGAGTGGGAGGTGGCTCGGGAGAAGATCACCATGAGCCGGGAACTTGGGCAGGGGTCGTTTGGGA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CGTTCCTGATGAGTGGGAGGTGGCTCGGGAGAAGATCACCATGAGCCGGGAACTTGGGCAGGGGTCGTTTGGGA 1699
Query 3035 TGGTCTATGAAGGAGTTGCCAAGGGTGTGGTGAAAGATGAACCTGAAACCAGAGTGGCCATTAAAACAGTGAAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TGGTCTATGAAGGAGTTGCCAAGGGTGTGGTGAAAGATGAACCTGAAACCAGAGTGGCCATTAAAACAGTGAAC 1773
Query 3109 GAGGCCGCAAGCATGCGTGAGAGGATTGAGTTTCTCAACGAAGCTTCTGTGATGAAGGAGTTCAATTGTCACCA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GAGGCCGCAAGCATGCGTGAGAGGATTGAGTTTCTCAACGAAGCTTCTGTGATGAAGGAGTTCAATTGTCACCA 1847
Query 3183 TGTGGTGCGATTGCTGGGTGTGGTGTCCCAAGGCCAGCCAACACTGGTCATCATGGAACTGATGACACGGGGCG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TGTGGTGCGATTGCTGGGTGTGGTGTCCCAAGGCCAGCCAACACTGGTCATCATGGAACTGATGACACGGGGCG 1921
Query 3257 ATCTCAAAAGTTATCTCCGGTCTCTGAGGCCAGAAATGGAGAATAATCCAGTCCTAGCACCTCCAAGCCTGAGC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 ATCTCAAAAGTTATCTCCGGTCTCTGAGGCCAGAAATGGAGAATAATCCAGTCCTAGCACCTCCAAGCCTGAGC 1995
Query 3331 AAGATGATTCAGATGGCCGGAGAGATTGCAGACGGCATGGCATACCTCAACGCCAATAAGTTCGTCCACAGAGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 AAGATGATTCAGATGGCCGGAGAGATTGCAGACGGCATGGCATACCTCAACGCCAATAAGTTCGTCCACAGAGA 2069
Query 3405 CCTTGCTGCCCGGAATTGCATGGTAGCCGAAGATTTCACAGTCAAAATCGGAGATTTTGGTATGACGCGAGATA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CCTTGCTGCCCGGAATTGCATGGTAGCCGAAGATTTCACAGTCAAAATCGGAGATTTTGGTATGACGCGAGATA 2143
Query 3479 TCTATGAGACAGACTATTACCGGAAAGGAGGGAAAGGGCTGCTGCCCGTGCGCTGGATGTCTCCTGAGTCCCTC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 TCTATGAGACAGACTATTACCGGAAAGGAGGGAAAGGGCTGCTGCCCGTGCGCTGGATGTCTCCTGAGTCCCTC 2217
Query 3553 AAGGATGGAGTCTTCACCACTTACTCGGACGTCTGGTCCTTCGGGGTCGTCCTCTGGGAGATCGCCACACTGGC 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 AAGGATGGAGTCTTCACCACTTACTCGGACGTCTGGTCCTTCGGGGTCGTCCTCTGGGAGATCGCCACACTGGC 2291
Query 3627 CGAGCAGCCCTACCAGGGCTTGTCCAACGAGCAAGTCCTTCGCTTCGTCATGGAGGGCGGCCTTCTGGACAAGC 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 CGAGCAGCCCTACCAGGGCTTGTCCAACGAGCAAGTCCTTCGCTTCGTCATGGAGGGCGGCCTTCTGGACAAGC 2365
Query 3701 CAGACAACTGTCCTGACATGCTGTTTGAACTGATGCGCATGTGCTGGCAGTATAACCCCAAGATGAGGCCTTCC 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 CAGACAACTGTCCTGACATGCTGTTTGAACTGATGCGCATGTGCTGGCAGTATAACCCCAAGATGAGGCCTTCC 2439
Query 3775 TTCCTGGAGATCATCAGCAGCATCAAAGAGGAGATGGAGCCTGGCTTCCGGGAGGTCTCCTTCTACTACAGCGA 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 TTCCTGGAGATCATCAGCAGCATCAAAGAGGAGATGGAGCCTGGCTTCCGGGAGGTCTCCTTCTACTACAGCGA 2513
Query 3849 GGAGAACAAGCTGCCCGAGCCGGAGGAGCTGGACCTGGAGCCAGAGAACATGGAGAGCGTCCCCCTGGACCCCT 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 GGAGAACAAGCTGCCCGAGCCGGAGGAGCTGGACCTGGAGCCAGAGAACATGGAGAGCGTCCCCCTGGACCCCT 2587
Query 3923 CGGCCTCCTCGTCCTCCCTGCCACTGCCCGACAGACACTCAGGACACAAGGCCGAGAACGGCCCCGGCCCTGGG 3996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 CGGCCTCCTCGTCCTCCCTGCCACTGCCCGACAGACACTCAGGACACAAGGCCGAGAACGGCCCCGGCCCTGGG 2661
Query 3997 GTGCTGGTCCTCCGCGCCAGCTTCGACGAGAGACAGCCTTACGCCCACATGAACGGGGGCCGCAAGAACGAGCG 4070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 GTGCTGGTCCTCCGCGCCAGCTTCGACGAGAGACAGCCTTACGCCCACATGAACGGGGGCCGCAAGAACGAGCG 2735
Query 4071 GGCCTTGCCGCTGCCCCAGTCTTCGACCTGCG 4102
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 GGCCTTGCCGCTGCCCCAGTCTTCGACCTGC- 2766
