Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489374
• Subject: XM_006525541.4
• Aligned Length: 1468
• Identities: 1335
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACCATCACCTGCACCCGATTCACAGAAGAGTACCAGCTCTTTGAGGAACTGGGAAAGGGAGCCTTCTC  74

Query   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGGTGCGCAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGTCAGGAGTATGCTGCCAAGATTATCAACACCAAGAAGCTTT  148

Query  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGCGTGAGGCCCGCATCTGCCGCTTGTTGAAGCACCCCAATATCGTCCGA  222

Query  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCATGACAGCATCTCCGAGGAGGGGCACCACTACCTTATCTTCGATCTGGTTACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296

Query  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  AGACATTGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAAGCTGATGCCAGCCACTGTATCCAGCAGATCTTGGAGGCTGTGC  370

Query  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TACACTGTCACCAGATGGGGGTGGTGCATCGTGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCGAAGCTCAAG  444

Query  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGCTGCTGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518

Query  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592
            .||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CGCAGGGACACCTGGATACCTCTCCCCAGAAGTGCTGAGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCCGTGGACCTGTGGG  592

Query  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666
            |.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCTGTGGCGTCATCCTGTATATCTTGCTGGTTGGGTATCCCCCGTTCTGGGATGAAGACCAGCATCGCCTGTAC  666

Query  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATCT  740
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGATCAAAGCTGGTGCCTATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACCGTCACCCCAGAAGCCAAGGATCT  740

Query  741  GATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCCTTAAGCACCCCTGGATCT  814
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  GATCAATAAGATGCTGACCATCAACCCGTCCAAACGCATCACGGCCGCTGAGGCTCTCAAGCACCCATGGATCT  814

Query  815  CGCACCGCTCCACCGTGGCATCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAGG  888
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCACCGCTCCACCGTGGCCTCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAGG  888

Query  889  AGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAAA  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  AGGAAACTGAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGCGGAGGAAA  962

Query  963  CAAGAAGAGCGATGGTGTGAA---------------------------------GGAATCCTCAGAGAGCACCA  1003
            ||||||||.||||||||||||                                 ||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  CAAGAAGAACGATGGTGTGAAGAAAAGAAAGTCCAGTTCCAGCGTTCAGTTAATGGAATCTTCTGAGAGCACCA  1036

Query 1004  ACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTGCGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAA  1077
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  ACACCACCATTGAGGACGAAGACACCAAAGTGCGCAAACAGGAAATTATCAAAGTGACAGAGCAGCTGATCGAA  1110

Query 1078  GCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACACGAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGC  1151
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  GCCATAAGCAATGGAGACTTTGAGTCCTACACGAAGATGTGCGACCCTGGAATGACAGCCTTTGAACCAGAGGC  1184

Query 1152  CCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCCATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGC  1225
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGGGAACCTGGTGGAGGGCCTGGACTTTCATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGC  1258

Query 1226  CCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATCCACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGC  1299
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CCGTGCACACCACCATCCTGAACCCTCACATCCACCTGATGGGTGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTATATCCGC  1332

Query 1300  ATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCCACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCG  1373
            |||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1333  ATCACTCAGTACCTGGATGCAGGCGGCATACCCCGCACGGCCCAGTCAGAGGAGACCCGCGTCTGGCACCGCAG  1406

Query 1374  GGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAGATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCACG  1435
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||. 
Sbjct 1407  GGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACAGATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCGCAT-  1467