Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489380
• Subject: NM_001251825.2
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2211
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  74

Query   75  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGTGCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCACTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGTGCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCACTG  148

Query  149  GAGGAGGAGGGCAGGAGTCCCAGCCATCCCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACTTGCAGCAGAATTGAGTCACCC  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct  149  GAGGAGGAGGG---------------------------------------------------------------  159

Query  223  AATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGCCCGAGTCAGTCAGGGGGAACAGGTGAGCTTGACCTCACAGCCACACA  296
                                                                                      
Sbjct  160  --------------------------------------------------------------------------  159

Query  297  ACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGGAACAGA  370
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  -------CAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGGAACAGA  226

Query  371  GTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAGTATGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  GTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAGTATGTT  300

Query  445  GTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATATTCAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATATTCAGTA  374

Query  519  TCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAGTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAGTGCAGC  448

Query  593  AGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGTGGAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  AGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGTGGAGGC  522

Query  667  AACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGTACTCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  AACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGTACTCTC  596

Query  741  AGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCAACAGCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  AGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCAACAGCG  670

Query  815  TTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGTGGCTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  TTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGTGGCTCA  744

Query  889  CAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTCCTTTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  CAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTCCTTTTT  818

Query  963  CACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCAGTGGAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  CACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCAGTGGAT  892

Query 1037  CATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTGAACATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  CATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTGAACATC  966

Query 1111  CAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCAGACACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  CAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCAGACACA  1040

Query 1185  GCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAGCACCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  GCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAGCACCAT  1114

Query 1259  TGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCTGTTCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  TGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCTGTTCCA  1188

Query 1333  AACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCTACAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCTACAGCT  1262

Query 1407  GCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCTTGGGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCTTGGGGC  1336

Query 1481  AGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTCACTGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  AGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTCACTGTG  1410

Query 1555  AATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGGAATCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  AATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGGAATCCA  1484

Query 1629  GGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTGGTCTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTGGTCTCC  1558

Query 1703  ATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGATGCCCAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  ATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGATGCCCAA  1632

Query 1777  CCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAGGGGCTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  CCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAGGGGCTC  1706

Query 1851  GGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGACCTCTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  GGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGACCTCTC  1780

Query 1925  ACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGGAAACGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  ACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGGAAACGC  1854

Query 1999  TTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCCTGAGTG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  TTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCCTGAGTG  1928

Query 2073  TCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAGGCCCAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  TCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAGGCCCAG  2002

Query 2147  GTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCCACTCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  GTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCCACTCCT  2076

Query 2221  TCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGCCAACAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  TCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGCCAACAG  2150

Query 2295  TGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2355
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151  TGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2211