Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489380
• Subject: NM_003109.1
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2334
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  74
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  53

Query   75  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGTGCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCACTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGTGCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCACTG  127

Query  149  GAGGAGGAGGGCAGGAGTCCCAGCCATCCCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACTTGCAGCAGAATTGAGTCACCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  GAGGAGGAGGGCAGGAGTCCCAGCCATCCCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACTTGCAGCAGAATTGAGTCACCC  201

Query  223  AATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGCCCGAGTCAGTCAGGGGGAACAGGTGAGCTTGACCTCACAGCCACACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  AATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGCCCGAGTCAGTCAGGGGGAACAGGTGAGCTTGACCTCACAGCCACACA  275

Query  297  ACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGGAACAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  ACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGGAACAGA  349

Query  371  GTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAGTATGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  GTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAGTATGTT  423

Query  445  GTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATATTCAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATATTCAGTA  497

Query  519  TCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAGTGCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  TCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAGTGCAGC  571

Query  593  AGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGTGGAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  AGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGTGGAGGC  645

Query  667  AACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGTACTCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  AACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGTACTCTC  719

Query  741  AGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCAACAGCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  AGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCAACAGCG  793

Query  815  TTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGTGGCTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGTGGCTCA  867

Query  889  CAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTCCTTTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  CAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTCCTTTTT  941

Query  963  CACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCAGTGGAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  CACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCAGTGGAT  1015

Query 1037  CATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTGAACATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  CATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTGAACATC  1089

Query 1111  CAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCAGACACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  CAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCAGACACA  1163

Query 1185  GCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAGCACCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  GCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAGCACCAT  1237

Query 1259  TGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCTGTTCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  TGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCTGTTCCA  1311

Query 1333  AACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCTACAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  AACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCTACAGCT  1385

Query 1407  GCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCTTGGGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  GCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCTTGGGGC  1459

Query 1481  AGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTCACTGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  AGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTCACTGTG  1533

Query 1555  AATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGGAATCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  AATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGGAATCCA  1607

Query 1629  GGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTGGTCTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  GGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTGGTCTCC  1681

Query 1703  ATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGATGCCCAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682  ATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGATGCCCAA  1755

Query 1777  CCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAGGGGCTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756  CCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAGGGGCTC  1829

Query 1851  GGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGACCTCTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1830  GGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGACCTCTC  1903

Query 1925  ACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGGAAACGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1904  ACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGGAAACGC  1977

Query 1999  TTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCCTGAGTG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978  TTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCCTGAGTG  2051

Query 2073  TCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAGGCCCAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052  TCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAGGCCCAG  2125

Query 2147  GTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCCACTCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126  GTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCCACTCCT  2199

Query 2221  TCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGCCAACAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200  TCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGCCAACAG  2273

Query 2295  TGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2355
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274  TGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2334