Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489380
• Subject: NM_013672.2
• Aligned Length: 2361
• Identities: 2162
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAGTGACAGCTGTGGTGAAGATTGAAAAAGATGTTGGTGGCAATAA  74

Query   75  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGT---GCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCA  145
            ||||||.|..||.||||||||.|||   ||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGGGTAGCGGCAATGGTGGCGGTGCCGCCTTTTCTCAGACTCGAAGCAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCA  148

Query  146  ---CTGGAGGAGGAGGGCAGGAGTCCCAGCCATCCCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACTTGCAGCAGAATTGAG  216
               .|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GTGGTGGCGGAGGAGGGCAGGAATCCCAGCCATCTCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACCTGCAGCAGAATTGAG  222

Query  217  TCACCCAATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGCCCGAGTCAGTCAGGGGGAACAGGTGAGCTTGACCTCACAGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  TCACCCAATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGTCCGAGTCAGTCAGGGGGCACAGGTGAACTTGACCTCACAGC  296

Query  291  CACACAACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGG  364
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCACAACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGG  370

Query  365  AACAGAGTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAG  438
            ||||||||||||.||||||||||||||||         ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACAGAGTGGCAACAGTACCAATGGCAGC---------GAGTCTTCCAAGAACCGCACAGTCTCTGGTGGGCAG  435

Query  439  TATGTTGTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATAT  512
            ||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  436  TATGTTGTGGCTGCTACCCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGTCTCCCTGGAGTAATGCCTAATAT  509

Query  513  TCAGTATCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  TCAGTATCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACTGTTGATGGGCAGCAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAG  583

Query  587  TGCAGCAGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGT  660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||||||||
Sbjct  584  TGCAGCAGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATCATCCCAAATAGAGGAAGT  657

Query  661  GGAGGCAACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGT  734
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  658  GGGGGCAACATTATTGCTGCTATGCCAAATCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTTCAAGGCCTTGCTAATAATGT  731

Query  735  ACTCTCAGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCA  808
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  GCTCTCAGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCA  805

Query  809  ACAGCGTTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGT  882
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  806  ACAGCGTTTCTGCAGCTACCCTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGGCACTATCAGCAGCTCTGGATCCCAGGAGAGC  879

Query  883  GGCTCACAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTC  956
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  880  AGCTCACAGCCTGTCACCTCAGGGACTGCCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTGTCATCACAAGCTAGTTCCAGCTC  953

Query  957  CTTTTTCACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCA  1030
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  954  CTTTTTTACCAATGCCAATAGTTATTCAACAACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACCAGCA  1027

Query 1031  GTGGATCATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTG  1104
            ||||.|||||||||||.|..||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1028  GTGGCTCATCAGGGACTAGTTCTCAAGGCCAGACGCCCCAGAGGGTTGGTGGGCTACAAGGGTCTGATTCTCTG  1101

Query 1105  AACATCCAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCA  1178
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||.|.|.|||||.|||||.||||||||||..|||||
Sbjct 1102  AACATCCAGCAGAACCAGACATCAGGAGGCTCGCTGCAAGGAAGTCAGCAGAAAGAGGGAGAGCAAAGTCAGCA  1175

Query 1179  GACACAGCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAG  1252
            |||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1176  GACACAGCAACAACAAATCCTTATTCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGAGGACAAGCTCTTCAGGCCCTTCAAGCAG  1249

Query 1253  CACCATTGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCT  1326
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CACCATTGTCCGGACAGACCTTCACAACTCAAGCTATTTCCCAGGAAACCCTTCAGAACCTCCAGCTTCAGGCT  1323

Query 1327  GTTCCAAACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCT  1400
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1324  GTTCAAAACTCTGGTCCCATCATCATTCGGACACCAACCGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACCCT  1397

Query 1401  ACAGCTGCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCT  1474
            .|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1398  TCAGCTGCAGAATCTTCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAGACAATCACCTTGGCCCCTATGCAGGGTGTTTCCT  1471

Query 1475  TGGGGCAGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTC  1548
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  TGGGGCAGACTAGCAGCAGTAATACCACCCTAACACCCATTGCCTCAGCTGCCTCCATTCCTGCTGGCACAGTC  1545

Query 1549  ACTGTGAATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGG  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  ACTGTGAATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGG  1619

Query 1623  AATCCAGGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTG  1696
            .|||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1620  GATCCAGGTGCACCAGCTTCCAGGCCTGCCTTTGGCTATAGCAAACACCCCAGGTGATCATGGAACTCAACTTG  1693

Query 1697  GTCTCCATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGAT  1770
            ||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||   ||||||||.||.|||.|.|||
Sbjct 1694  GTCTTCATGGATCTGGTGGTGATGGGATACATGATGAGACAGCAGGTGGA---GAAGGAGAGAATAGCTCTGAT  1764

Query 1771  GCCCAACCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAG  1844
            ..||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1765  CTCCAACCCCAAGCTGGACGCAGGACTCGTCGGGAAGCATGTACATGCCCCTATTGCAAAGACAGTGAGGGAAG  1838

Query 1845  GGGCTCGGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGA  1918
            .|.|||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1839  AGCCTCAGGAGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCACATTTGTCACATCCAAGGATGCGGCAAAGTATATGGCAAGA  1912

Query 1919  CCTCTCACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGG  1992
            ||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1913  CCTCACATCTCCGAGCACACTTGCGCTGGCATACAGGGGAGAGGCCATTCATGTGTAATTGGTCATATTGTGGG  1986

Query 1993  AAACGCTTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCC  2066
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  AAGCGCTTTACACGTTCGGACGAGCTTCAGAGACATAAACGTACACATACAGGAGAGAAGAAATTTGCCTGCCC  2060

Query 2067  TGAGTGTCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAG  2140
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2061  TGAGTGCCCTAAGCGTTTCATGAGGAGTGATCACCTGTCAAAGCATATCAAGACTCACCAGAACAAGAAGGGAG  2134

Query 2141  GCCCAGGTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCC  2214
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||
Sbjct 2135  GCCCAGGTGTAGCCCTGAGTGTGGGCACATTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAA------GGCACTGCC  2202

Query 2215  ACTCCTTCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGC  2288
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2203  ACTCCTTCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGTATTGCCCGTCTTGC  2276

Query 2289  CAACAGTGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2355
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2277  CAACAGTGGCATCAACGTCATGCAGGTGACAGAGCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGTTTC  2343