Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489380
• Subject: XM_017316523.1
• Aligned Length: 2361
• Identities: 2141
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGAGCGACCAAGATCACTCCATGGATGAAATGACAGCTGTGGTGAAAATTGAAAAAGGAGTTGGTGGCAATAA  74
                                 |||||||||.||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGGATGAAGTGACAGCTGTGGTGAAGATTGAAAAAGATGTTGGTGGCAATAA  53

Query   75  TGGGGGCAATGGTAATGGTGGTGGT---GCCTTTTCACAGGCTCGAAGTAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCA  145
            ||||||.|..||.||||||||.|||   ||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  TGGGGGTAGCGGCAATGGTGGCGGTGCCGCCTTTTCTCAGACTCGAAGCAGCAGCACAGGCAGTAGCAGCAGCA  127

Query  146  ---CTGGAGGAGGAGGGCAGGAGTCCCAGCCATCCCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACTTGCAGCAGAATTGAG  216
               .|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  128  GTGGTGGCGGAGGAGGGCAGGAATCCCAGCCATCTCCTTTGGCTCTGCTGGCAGCAACCTGCAGCAGAATTGAG  201

Query  217  TCACCCAATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGCCCGAGTCAGTCAGGGGGAACAGGTGAGCTTGACCTCACAGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  202  TCACCCAATGAGAACAGCAACAACTCCCAGGGTCCGAGTCAGTCAGGGGGCACAGGTGAACTTGACCTCACAGC  275

Query  291  CACACAACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGG  364
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  CGCACAACTTTCACAGGGTGCCAATGGCTGGCAGATCATCTCTTCCTCCTCTGGGGCTACCCCTACCTCAAAGG  349

Query  365  AACAGAGTGGCAGCAGTACCAATGGCAGCAATGGCAGTGAGTCTTCCAAGAATCGCACAGTCTCTGGTGGGCAG  438
            ||||||||||||.||||||||||||||||         ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  350  AACAGAGTGGCAACAGTACCAATGGCAGC---------GAGTCTTCCAAGAACCGCACAGTCTCTGGTGGGCAG  414

Query  439  TATGTTGTGGCTGCCGCTCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGACTACCTGGAGTGATGCCTAATAT  512
            ||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  415  TATGTTGTGGCTGCTACCCCCAACTTACAGAACCAGCAAGTTCTGACAGGTCTCCCTGGAGTAATGCCTAATAT  488

Query  513  TCAGTATCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACCGTTGATGGGCAACAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  TCAGTATCAAGTAATCCCACAGTTCCAGACTGTTGATGGGCAGCAGCTGCAGTTTGCTGCCACTGGGGCCCAAG  562

Query  587  TGCAGCAGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATTATCACAAATCGAGGAAGT  660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||||||||
Sbjct  563  TGCAGCAGGATGGTTCTGGTCAAATACAGATCATACCAGGTGCAAACCAACAGATCATCCCAAATAGAGGAAGT  636

Query  661  GGAGGCAACATCATTGCTGCTATGCCAAACCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTCCAAGGCCTGGCTAATAATGT  734
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  637  GGGGGCAACATTATTGCTGCTATGCCAAATCTACTCCAGCAGGCTGTCCCCCTTCAAGGCCTTGCTAATAATGT  710

Query  735  ACTCTCAGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCA  808
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  GCTCTCAGGACAGACTCAGTATGTGACCAATGTACCAGTGGCCCTGAATGGGAACATCACCTTGCTACCTGTCA  784

Query  809  ACAGCGTTTCTGCAGCTACCTTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGTCACGATCAGCAGCTCTGGGTCCCAGGAGAGT  882
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  785  ACAGCGTTTCTGCAGCTACCCTGACTCCCAGCTCTCAGGCAGGCACTATCAGCAGCTCTGGATCCCAGGAGAGC  858

Query  883  GGCTCACAGCCTGTCACCTCAGGGACTACCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTATCATCACAAGCCAGTTCCAGCTC  956
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  859  AGCTCACAGCCTGTCACCTCAGGGACTGCCATCAGTTCTGCCAGCTTGGTGTCATCACAAGCTAGTTCCAGCTC  932

Query  957  CTTTTTCACCAATGCCAATAGCTACTCAACTACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACTACCA  1030
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  933  CTTTTTTACCAATGCCAATAGTTATTCAACAACTACTACCACCAGCAACATGGGAATTATGAACTTTACCAGCA  1006

Query 1031  GTGGATCATCAGGGACCAACTCTCAAGGCCAGACACCCCAGAGGGTCAGTGGGCTACAGGGGTCTGATGCTCTG  1104
            ||||.|||||||||||.|..||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1007  GTGGCTCATCAGGGACTAGTTCTCAAGGCCAGACGCCCCAGAGGGTTGGTGGGCTACAAGGGTCTGATTCTCTG  1080

Query 1105  AACATCCAGCAAAACCAGACATCTGGAGGCTCATTGCAAGCAGGCCAGCAAAAAGAAGGAGAGCAAAACCAGCA  1178
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||.|.|.|||||.|||||.||||||||||..|||||
Sbjct 1081  AACATCCAGCAGAACCAGACATCAGGAGGCTCGCTGCAAGGAAGTCAGCAGAAAGAGGGAGAGCAAAGTCAGCA  1154

Query 1179  GACACAGCAGCAACAAATTCTTATCCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGGGGACAGGCCCTCCAGGCCCTCCAAGCAG  1252
            |||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1155  GACACAGCAACAACAAATCCTTATTCAGCCTCAGCTAGTTCAAGGAGGACAAGCTCTTCAGGCCCTTCAAGCAG  1228

Query 1253  CACCATTGTCAGGGCAGACCTTTACAACTCAAGCCATCTCCCAGGAAACCCTCCAGAACCTCCAGCTTCAGGCT  1326
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  CACCATTGTCCGGACAGACCTTCACAACTCAAGCTATTTCCCAGGAAACCCTTCAGAACCTCCAGCTTCAGGCT  1302

Query 1327  GTTCCAAACTCTGGTCCCATCATCATCCGGACACCAACAGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACTCT  1400
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1303  GTTCAAAACTCTGGTCCCATCATCATTCGGACACCAACCGTGGGGCCCAATGGACAGGTCAGTTGGCAGACCCT  1376

Query 1401  ACAGCTGCAGAACCTCCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAAACAATCACCTTAGCCCCAATGCAGGGTGTTTCCT  1474
            .|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1377  TCAGCTGCAGAATCTTCAAGTTCAGAACCCACAAGCCCAGACAATCACCTTGGCCCCTATGCAGGGTGTTTCCT  1450

Query 1475  TGGGGCAGACCAGCAGCAGCAACACCACTCTCACACCCATTGCCTCAGCTGCTTCCATTCCTGCTGGCACAGTC  1548
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  TGGGGCAGACTAGCAGCAGTAATACCACCCTAACACCCATTGCCTCAGCTGCCTCCATTCCTGCTGGCACAGTC  1524

Query 1549  ACTGTGAATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGG  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  ACTGTGAATGCTGCTCAACTCTCCTCCATGCCAGGCCTCCAGACCATTAACCTCAGTGCATTGGGTACTTCAGG  1598

Query 1623  AATCCAGGTGCACCCAATTCAAGGCCTGCCGTTGGCTATAGCAAATGCCCCAGGTGATCATGGAGCTCAGCTTG  1696
            .|||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1599  GATCCAGGTGCACCAGCTTCCAGGCCTGCCTTTGGCTATAGCAAACACCCCAGGTGATCATGGAACTCAACTTG  1672

Query 1697  GTCTCCATGGGGCTGGTGGTGATGGAATACATGATGACACAGCAGGTGGAGAGGAAGGAGAAAACAGCCCAGAT  1770
            ||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||   ||||||||.||.|||.|.|||
Sbjct 1673  GTCTTCATGGATCTGGTGGTGATGGGATACATGATGAGACAGCAGGTGGA---GAAGGAGAGAATAGCTCTGAT  1743

Query 1771  GCCCAACCCCAAGCCGGTCGGAGGACCCGGCGGGAAGCATGCACCTGCCCCTACTGTAAAGACAGTGAAGGAAG  1844
            ..||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1744  CTCCAACCCCAAGCTGGACGCAGGACTCGTCGGGAAGCATGTACATGCCCCTATTGCAAAGACAGTGAGGGAAG  1817

Query 1845  GGGCTCGGGGGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCATATTTGCCACATCCAAGGCTGTGGGAAAGTGTATGGCAAGA  1918
            .|.|||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1818  AGCCTCAGGAGATCCTGGCAAAAAGAAACAGCACATTTGTCACATCCAAGGATGCGGCAAAGTATATGGCAAGA  1891

Query 1919  CCTCTCACCTGCGGGCACACTTGCGCTGGCATACAGGCGAGAGGCCATTTATGTGTACCTGGTCATACTGTGGG  1992
            ||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1892  CCTCACATCTCCGAGCACACTTGCGCTGGCATACAGGGGAGAGGCCATTCATGTGTAATTGGTCATATTGTGGG  1965

Query 1993  AAACGCTTCACACGTTCGGATGAGCTACAGAGGCACAAACGTACACACACAGGTGAGAAGAAATTTGCCTGCCC  2066
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1966  AAGCGCTTTACACGTTCGGACGAGCTTCAGAGACATAAACGTACACATACAGGAGAGAAGAAATTTGCCTGCCC  2039

Query 2067  TGAGTGTCCTAAGCGCTTCATGAGGAGTGACCACCTGTCAAAACATATCAAGACCCACCAGAATAAGAAGGGAG  2140
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2040  TGAGTGCCCTAAGCGTTTCATGAGGAGTGATCACCTGTCAAAGCATATCAAGACTCACCAGAACAAGAAGGGAG  2113

Query 2141  GCCCAGGTGTAGCTCTGAGTGTGGGCACTTTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAAGGCAGTGGCACTGCC  2214
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||
Sbjct 2114  GCCCAGGTGTAGCCCTGAGTGTGGGCACATTGCCCCTGGACAGTGGGGCAGGTTCAGAA------GGCACTGCC  2181

Query 2215  ACTCCTTCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGCATTGCCCGTCTTGC  2288
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2182  ACTCCTTCAGCCCTTATTACCACCAATATGGTAGCCATGGAGGCCATCTGTCCAGAGGGTATTGCCCGTCTTGC  2255

Query 2289  CAACAGTGGCATCAACGTCATGCAGGTGGCAGATCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGCTTC  2355
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2256  CAACAGTGGCATCAACGTCATGCAGGTGACAGAGCTGCAGTCCATTAATATCAGTGGCAATGGTTTC  2322