Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489391
• Subject: NM_001318919.1
• Aligned Length: 1202
• Identities: 951
• Gaps: 106

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGACAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCC-  73
            ||||||.|||||||.||.||.||.|||||||||||..|.||.|.|||||||.||||.||.||||||||.|||| 
Sbjct    1  ATGGAGTCCCTCTTTCCTGCCCCATTCTGGGAGGTCTTGTATGGCAGCCACTTTCAAGGGAACCTGTCTCTCCT  74

Query   74  ---TGAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTC  144
               ||||.||             .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct   75  AAATGAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTT  135

Query  145  GGGCTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCAT  218
            ||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  136  GGACTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCAT  209

Query  219  GTACGTCATCCTCAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATATTTACATCTTTAACCTGGCCCTGGCCGACA  292
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  210  GTATGTCATCCTCAGGCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACATTTACATATTTAATCTGGCACTGGCTGATA  283

Query  293  CTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTCCTGGGCTTCTGGCCGTTTGGGAATGCGCTG  366
            |.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  284  CCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTTCTGGGCTTCTGGCCATTTGGGAATGCACTG  357

Query  367  TGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAGCACCTTCACCCTAACTGCCATGAGTGTGGA  440
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||.||
Sbjct  358  TGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAGCACTTTCACTTTGACTGCCATGAGTGTAGA  431

Query  441  TCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCCGCACGTCCAGCAAAGCCCAGGCTGTCAATG  514
            .||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  432  CCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTCGGACATCCAGTAAAGCCCAGGCCGTTAATG  505

Query  515  TGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCCATCATGGGCTCGGCACAGGTCGAGGATGAA  588
            |||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  506  TGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCCATCATGGGCTCAGCACAAGTGGAGGATGAA  579

Query  589  GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTGGGGCCCGGTGTTTGCCATCTGCATCTTCCT  662
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  580  GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTGGGGCCCTGTATTTGCCATCTGCATCTTCCT  653

Query  663  CTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATCCGGCGGCTCCGTGGAGTCC  736
            .||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct  654  TTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATTCGACGACTTCGTGGTGTCC  727

Query  737  GCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGCATCACTCGGCTGGTGCTGGTGGTAGTGGCT  810
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  728  GGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGCATCACACGGCTGGTACTGGTAGTTGTGGCT  801

Query  811  GTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGCCCAAGGGCTGGGGGTTCAGCCGAGCAGCGA  884
            |||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||||.|||||.||||||||..|.||.||
Sbjct  802  GTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGTTCAAGGACTGGGTGTTCAGCCAGGTAGTGA  875

Query  885  GACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACGTCAACAGCTGCCTCAACCCCATCCTCTACG  958
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  876  GACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATGTCAACAGTTGTCTCAATCCCATTCTCTATG  949

Query  959  CCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGCTGTGCATCTGCCCTGCGCCGGGACGTGCAG  1032
            |.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||.||||||..|||||
Sbjct  950  CTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGCTGTGCTTCTGCCCTGCACCGGGAGATGCAG  1023

Query 1033  GTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGGCCTGCAAGACCTCTGAGACGGTACCGCGGC  1105
            ||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.||| .|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1024  GTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG-TTGCAAGACCTCTGAGACAGTACCACGGC  1096

Query 1106  CCGCA---------------------------------------------------------------------  1110
            |.|||                                                                     
Sbjct 1097  CGGCATGACTAGGCGTGGACCTGCCCATGGTGCCTGTCAGTCCACAGAGCCCATCTACACCCAACACGGAGCTC  1170

Query 1111  ------------------  1110
                              
Sbjct 1171  ACACAGGTCACTGCTCTC  1188