Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489391
• Subject: NM_001318920.1
• Aligned Length: 1115
• Identities: 937
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGACAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCC-  73
            ||||||.|||||||.||.||.||.|||||||||||..|.||.|.|||||||.||||.||.||||||||.|||| 
Sbjct    1  ATGGAGTCCCTCTTTCCTGCCCCATTCTGGGAGGTCTTGTATGGCAGCCACTTTCAAGGGAACCTGTCTCTCCT  74

Query   74  ---TGAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTC  144
               ||||.||             .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct   75  AAATGAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTT  135

Query  145  GGGCTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCAT  218
            ||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  136  GGACTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCAT  209

Query  219  GTACGTCATCCTCAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATATTTACATCTTTAACCTGGCCCTGGCCGACA  292
                           |||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  210  ---------------GCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACATTTACATATTTAATCTGGCACTGGCTGATA  268

Query  293  CTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTCCTGGGCTTCTGGCCGTTTGGGAATGCGCTG  366
            |.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  269  CCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTTCTGGGCTTCTGGCCATTTGGGAATGCACTG  342

Query  367  TGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAGCACCTTCACCCTAACTGCCATGAGTGTGGA  440
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||.||
Sbjct  343  TGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAGCACTTTCACTTTGACTGCCATGAGTGTAGA  416

Query  441  TCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCCGCACGTCCAGCAAAGCCCAGGCTGTCAATG  514
            .||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  417  CCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTCGGACATCCAGTAAAGCCCAGGCCGTTAATG  490

Query  515  TGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCCATCATGGGCTCGGCACAGGTCGAGGATGAA  588
            |||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  491  TGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCCATCATGGGCTCAGCACAAGTGGAGGATGAA  564

Query  589  GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTGGGGCCCGGTGTTTGCCATCTGCATCTTCCT  662
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTGGGGCCCTGTATTTGCCATCTGCATCTTCCT  638

Query  663  CTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATCCGGCGGCTCCGTGGAGTCC  736
            .||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct  639  TTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATTCGACGACTTCGTGGTGTCC  712

Query  737  GCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGCATCACTCGGCTGGTGCTGGTGGTAGTGGCT  810
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  713  GGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGCATCACACGGCTGGTACTGGTAGTTGTGGCT  786

Query  811  GTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGCCCAAGGGCTGGGGGTTCAGCCGAGCAGCGA  884
            |||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||||.|||||.||||||||..|.||.||
Sbjct  787  GTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGTTCAAGGACTGGGTGTTCAGCCAGGTAGTGA  860

Query  885  GACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACGTCAACAGCTGCCTCAACCCCATCCTCTACG  958
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  861  GACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATGTCAACAGTTGTCTCAATCCCATTCTCTATG  934

Query  959  CCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGCTGTGCATCTGCCCTGCGCCGGGACGTGCAG  1032
            |.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||.||||||..|||||
Sbjct  935  CTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGCTGTGCTTCTGCCCTGCACCGGGAGATGCAG  1008

Query 1033  GTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGGCCTGCAAGACCTCTGAGACGGTACCGCGGC  1105
            ||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.||| .|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1009  GTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG-TTGCAAGACCTCTGAGACAGTACCACGGC  1081

Query 1106  CCGCA  1110
            |.|||
Sbjct 1082  CGGCA  1086