Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489391
• Subject: NM_001318922.1
• Aligned Length: 1145
• Identities: 892
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGACAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCCT  74
                                                                                    .|
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query   75  GAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTCGGGC  148
            |||.||             .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.||.|
Sbjct    3  GAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTTGGAC  63

Query  149  TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCATGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct   64  TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCATGTAT  137

Query  223  GTCATCCT----------------------------------CAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATA  262
            ||||||||                                  ||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  138  GTCATCCTCAGCTGGGAGGGCATTGAGGGGAACTGGAGACAGCAGGCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACA  211

Query  263  TTTACATCTTTAACCTGGCCCTGGCCGACACTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTC  336
            |||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  212  TTTACATATTTAATCTGGCACTGGCTGATACCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTT  285

Query  337  CTGGGCTTCTGGCCGTTTGGGAATGCGCTGTGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAG  410
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  286  CTGGGCTTCTGGCCATTTGGGAATGCACTGTGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAG  359

Query  411  CACCTTCACCCTAACTGCCATGAGTGTGGATCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCC  484
            |||.|||||..|.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct  360  CACTTTCACTTTGACTGCCATGAGTGTAGACCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTC  433

Query  485  GCACGTCCAGCAAAGCCCAGGCTGTCAATGTGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCC  558
            |.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct  434  GGACATCCAGTAAAGCCCAGGCCGTTAATGTGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCC  507

Query  559  ATCATGGGCTCGGCACAGGTCGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTG  632
            |||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||
Sbjct  508  ATCATGGGCTCAGCACAAGTGGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTG  581

Query  633  GGGCCCGGTGTTTGCCATCTGCATCTTCCTCTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACA  706
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||
Sbjct  582  GGGCCCTGTATTTGCCATCTGCATCTTCCTTTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACA  655

Query  707  GCCTCATGATCCGGCGGCTCCGTGGAGTCCGCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGC  780
            ||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  656  GCCTCATGATTCGACGACTTCGTGGTGTCCGGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGC  729

Query  781  ATCACTCGGCTGGTGCTGGTGGTAGTGGCTGTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGC  854
            |||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||.
Sbjct  730  ATCACACGGCTGGTACTGGTAGTTGTGGCTGTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGT  803

Query  855  CCAAGGGCTGGGGGTTCAGCCGAGCAGCGAGACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACG  928
            .|||||.|||||.||||||||..|.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  804  TCAAGGACTGGGTGTTCAGCCAGGTAGTGAGACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATG  877

Query  929  TCAACAGCTGCCTCAACCCCATCCTCTACGCCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGC  1002
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct  878  TCAACAGTTGTCTCAATCCCATTCTCTATGCTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGC  951

Query 1003  TGTGCATCTGCCCTGCGCCGGGACGTGCAGGTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGG  1075
            |||||.||||||||||.||||||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.|||
Sbjct  952  TGTGCTTCTGCCCTGCACCGGGAGATGCAGGTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG  1025

Query 1076  CCTGCAAGACCTCTGAGACGGTACCGCGGCCCGCA  1110
             .|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1026  -TTGCAAGACCTCTGAGACAGTACCACGGCCGGCA  1059