Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489391
- Subject:
- NM_001318923.1
- Aligned Length:
- 1130
- Identities:
- 888
- Gaps:
- 106
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGACAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCCT 74
.|
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 75 GAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTCGGGC 148
|||.|| .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.||.|
Sbjct 3 GAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTTGGAC 63
Query 149 TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCAT---G 219
||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.||||| |
Sbjct 64 TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCATCTGG 137
Query 220 TACGTCAT----------------CCTCAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATATTTACATCTTTAACC 277
.|.|.||| |..||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 138 GAGGGCATTGAGGGGAACTGGAGACAGCAGGCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACATTTACATATTTAATC 211
Query 278 TGGCCCTGGCCGACACTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTCCTGGGCTTCTGGCCG 351
||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 212 TGGCACTGGCTGATACCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTTCTGGGCTTCTGGCCA 285
Query 352 TTTGGGAATGCGCTGTGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAGCACCTTCACCCTAAC 425
|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|.||
Sbjct 286 TTTGGGAATGCACTGTGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAGCACTTTCACTTTGAC 359
Query 426 TGCCATGAGTGTGGATCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCCGCACGTCCAGCAAAG 499
||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct 360 TGCCATGAGTGTAGACCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTCGGACATCCAGTAAAG 433
Query 500 CCCAGGCTGTCAATGTGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCCATCATGGGCTCGGCA 573
|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 434 CCCAGGCCGTTAATGTGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCCATCATGGGCTCAGCA 507
Query 574 CAGGTCGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTGGGGCCCGGTGTTTGC 647
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 508 CAAGTGGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTGGGGCCCTGTATTTGC 581
Query 648 CATCTGCATCTTCCTCTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATCCGGC 721
|||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 582 CATCTGCATCTTCCTTTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATTCGAC 655
Query 722 GGCTCCGTGGAGTCCGCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGCATCACTCGGCTGGTG 795
|.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 656 GACTTCGTGGTGTCCGGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGCATCACACGGCTGGTA 729
Query 796 CTGGTGGTAGTGGCTGTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGCCCAAGGGCTGGGGGT 869
|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||||.|||||.||
Sbjct 730 CTGGTAGTTGTGGCTGTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGTTCAAGGACTGGGTGT 803
Query 870 TCAGCCGAGCAGCGAGACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACGTCAACAGCTGCCTCA 943
||||||..|.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 804 TCAGCCAGGTAGTGAGACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATGTCAACAGTTGTCTCA 877
Query 944 ACCCCATCCTCTACGCCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGCTGTGCATCTGCCCTG 1017
|.|||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 878 ATCCCATTCTCTATGCTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGCTGTGCTTCTGCCCTG 951
Query 1018 CGCCGGGACGTGCAGGTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGGCCTGCAAGACCTCTG 1090
|.||||||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.||| .|||||||||||||
Sbjct 952 CACCGGGAGATGCAGGTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG-TTGCAAGACCTCTG 1024
Query 1091 AGACGGTACCGCGGCCCGCA 1110
||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1025 AGACAGTACCACGGCCGGCA 1044