Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489431
• Subject: XM_006713490.2
• Aligned Length: 1536
• Identities: 1160
• Gaps: 375

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGGACAGCTCTCACAGAAAGAGACGCTGGTCACCCTGTTTGACAATCGGACGTGGGTCCGCCAGGGCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGTGGAGGAGCTAGAACCACCCAGCACCTCACAGGCCTGGAACCCACCACGTGCCAACGTCTTCCTCACCCTGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCATCTTCATTCTCATGAAGTTCTGGATGTCTGCACTGGCCACCACCATCCCAGTTCCCTGTGGGGCCTTCATG  222

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCTGCCTGGTTCCCAGATGGAAT  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGTCTTTGTCATTGGAGCAGCATTTGGGCGTCTGGTGGGTGAAAGCATGGCTGCCTGGTTCCCAGATGGAAT  296

Query   27  TCATACGGACAGCAGCACCTACCGGATTGTGCCTGGGGGCTACGCTGTGGTCGGGGCAGCTGCGCTGGCAGGAG  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATACGGACAGCAGCACCTACCGGATTGTGCCTGGGGGCTACGCTGTGGTCGGGGCAGCTGCGCTGGCAGGAG  370

Query  101  CGGTGACACACACAGTGTCCACGGCTGTGATCGTGTTCGAGCTCACAGGCCAGATTGCCCACATCCTGCCTGTC  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTGACACACACAGTGTCCACGGCTGTGATCGTGTTCGAGCTCACAGGCCAGATTGCCCACATCCTGCCTGTC  444

Query  175  ATGATCGTCGTCATCCTGGCCAACGCTGTCGCCCAGAGTCTGCAGCCCTCCCTCTATGACAGCATCATCCGAAT  248
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGATCGCCGTCATCCTGGCCAACGCTGTCGCCCAGAGTCTGCAGCCCTCCCTCTATGACAGCATCATCCGAAT  518

Query  249  CAAGAAACTGCCCTACCTGCCTGAGCTCGGCTGGGGCCGCCACCAGCAGTACCGGGTGCGTGTGGAGGACATCA  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAAACTGCCCTACCTGCCTGAGCTCGGCTGGGGCCGCCACCAGCAGTACCGGGTGCGTGTGGAGGACATCA  592

Query  323  TGGTGCGGGATGTTCCCCATGTGGCCCTCAGCTGCACCTTCCGGGACCTGCGTTTGGCACTGCACAGGACCAAG  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGCGGGATGTTCCCCATGTGGCCCTCAGCTGCACCTTCCGGGACCTGCGTTTGGCACTGCACAGGACCAAG  666

Query  397  GGCCGAATGCTGGCCCTAGTGGAGTCCCCTGAGTCCATGATTCTGCTGGGCTCCATCGAGCGTTCACAGGTGGT  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCGAATGCTGGCCCTAGTGGAGTCCCCTGAGTCCATGATTCTGCTGGGCTCCATCGAGCGTTCACAGGTGGT  740

Query  471  GGCATTGTTGGGGGCCCAGCTGAGCCCAGCCCGCCGGCGGCAGCACATGCAGGAGCGCAGAGCCACCCAGACCT  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCATTGTTGGGGGCCCAGCTGAGCCCAGCCCGCCGGCGGCAGCACATGCAGGAGCGCAGAGCCACCCAGACCT  814

Query  545  CTCCACTATCTGATCAGGAGGGTCCCCCTACCCCTGAGGCTTCTGTCTGCTTCCAGGTGAACACAGAAGACTCA  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCACTATCTGATCAGGAGGGTCCCCCTACCCCTGAGGCTTCTGTCTGCTTCCAGGTGAACACAGAAGACTCA  888

Query  619  GCCTTCCCAGCAGCCCGGGGGGAGACCCACAAGCCCCTAAAGCCTGCACTCAAGAGGGGGCCCAGTGTCACCAG  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCTTCCCAGCAGCCCGGGGGGAGACCCACAAGCCCCTAAAGCCTGCACTCAAGAGGGGGCCCAGTGTCACCAG  962

Query  693  GAACCTCGGAGAGAGTCCCACAGGGAGCGCAGAGTCGGCAGGCATCGCCCTCCGGAGCCTCTTCTGTGGCAGTC  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAACCTCGGAGAGAGTCCCACAGGGAGCGCAGAGTCGGCAGGCATCGCCCTCCGGAGCCTCTTCTGTGGCAGTC  1036

Query  767  CACCCCCTGAGGCTGCTTCGGAGAAGTTGGAATCCTGTGAGAAGCGCAAGCTGAAGCGTGTCCGAATCTCCCTG  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCCCCTGAGGCTGCTTCGGAGAAGTTGGAATCCTGTGAGAAGCGCAAGCTGAAGCGTGTCCGAATCTCCCTG  1110

Query  841  GCAAGTGACGCGGACCTGGAAGGCGAGATGAGCCCTGAAG----------------------------------  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 1111  GCAAGTGACGCGGACCTGGAAGGCGAGATGAGCCCTGAAGAGATTCTGGAGTGGGAGGAGCAGCAACTAGATGA  1184

Query  881  -----------------------------------------------------------------------AGA  883
                                                                                   |||
Sbjct 1185  ACCTGTCAACTTCAGTGACTGCAAAATTGATCCTGCTCCCTTCCAGCTGGTGGAGCGGACCTCTTTGCACAAGA  1258

Query  884  CTCACACTATCTTCTCACTGCTGGGAGTGGACCATGCTTATGTCACCAGTATTGGCAGACTCATTGGAATCGTT  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCACACTATCTTCTCACTGCTGGGAGTGGACCATGCTTATGTCACCAGTATTGGCAGACTCATTGGAATCGTT  1332

Query  958  ACTCTAAAGGAGCTCCGGAAGGCCATCGAGGGCTCTGTCACAGCACAGGGTGTGAAAGTCCGGCCGCCCCTCGC  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCTAAAGGAGCTCCGGAAGGCCATCGAGGGCTCTGTCACAGCACAGGGTGTGAAAGTCCGGCCGCCCCTCGC  1406

Query 1032  CAGCTTCCGAGACAGTGCCACCAGCAGCAGTGACACGGAGACCACTGAGGTGCATGCACTCTGGGGGCCCCACT  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGCTTCCGAGACAGTGCCACCAGCAGCAGTGACACGGAGACCACTGAGGTGCATGCACTCTGGGGGCCCCACT  1480

Query 1106  CCCGTCATGGCCTCCCCCGGGAGGGCAGCCCTTCCGACAGCGACGACAAATGCCAA  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCGTCATGGCCTCCCCCGGGAGGGCAGCCCTTCCGACAGCGACGACAAATGCCAA  1536