Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489471
- Subject:
- NM_001363657.2
- Aligned Length:
- 1160
- Identities:
- 900
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG 74
|||||||.||||||...|||||||.|.||.||.|||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCG 74
Query 75 ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA 148
.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||..|.|||||.|
Sbjct 75 CTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCTCAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACA 148
Query 149 GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA 222
|||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||||||||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||||.
Sbjct 149 GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTTCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTG 222
Query 223 GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA 296
||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct 223 GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA 296
Query 297 AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA 369
.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||
Sbjct 297 GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA 369
Query 370 GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT 443
||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 370 GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT 443
Query 444 TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG 517
|||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 444 TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG 517
Query 518 CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC 591
|||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 518 CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC 591
Query 592 CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAA 665
||.||.||||||||||||||.|||||.||..|.|||||.||.||||||||.|||||||||||| |.||
Sbjct 592 CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAA 658
Query 666 AA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCA 732
|| |.||.|||||.||.|..||..|||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 659 AAGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCA 732
Query 733 TGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATA 806
|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||..
Sbjct 733 TGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACT 806
Query 807 TAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGG 880
.|.|||....|||||||||||.|||..|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 807 CACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAG 880
Query 881 CAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACAC 954
|.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.
Sbjct 881 CCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCAT 954
Query 955 CCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGA 1028
||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||
Sbjct 955 CCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGA 1028
Query 1029 TGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCA 1102
||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.|
Sbjct 1029 TGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTA 1102
Query 1103 AGAATGGAGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAG 1152
|.|||||.||..||...||.|||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1103 AAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGCACAGGTGCAGCAG 1152