Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489471
- Subject:
- XM_006534950.4
- Aligned Length:
- 1277
- Identities:
- 883
- Gaps:
- 136
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACCTTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Query 1 ----------------------------------------ATGAGCAGAAGCAAGCGT-GACAACAATTTTTAT 33
|||||||.||||||| || ||||||.|.||.||.
Sbjct 75 TAAACACGTGGATGTGTCATCTATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAG-GTGGACAACCAGTTCTAC 147
Query 34 AGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACGATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGC 107
|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||..|.||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 148 AGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCGCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGC 221
Query 108 TCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAAGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCAT 181
|||.||||||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.|
Sbjct 222 TCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCT 295
Query 182 TTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTAGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATA 255
|.|||||.||.|||||.||||||.||||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 296 TCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATT 369
Query 256 ATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGAAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCT 329
|||.||.|.||.||||||||.|||||.||||||.|.||.||.||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||
Sbjct 370 ATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACT 443
Query 330 CATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAGATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGA 403
.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||..|.|||||.|||.|.||.||.||||
Sbjct 444 GATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGA 517
Query 404 TGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATTCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTA 477
||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||..||||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 518 TGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTC 591
Query 478 AAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGCCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCC 551
||.|||||||||||..||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 592 AAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCC 665
Query 552 TTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCCTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTAT 625
.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct 666 GTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGT 739
Query 626 GGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATAT 692
||||.||.||||||||.|||||||||||||| |||| |.||.||.||.||.|..||..||||
Sbjct 740 GGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATAT 806
Query 693 TGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAG 766
|||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||.||||.||.||||
Sbjct 807 TGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAG 880
Query 767 TAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTC 840
|.||.|..|||||.||.||..|.||.||.||.||.|||...|.|||....||.|||||.||.|||..|||.|||
Sbjct 881 TCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTC 954
Query 841 CCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGA 914
|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||.||
Sbjct 955 CCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGA 1028
Query 915 TGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAG 988
..||.|.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||..||||||
Sbjct 1029 CCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAG 1102
Query 989 CAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAA 1062
..||.||.||.||.||..||||...|||.||||||.|.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1103 TGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAA 1176
Query 1063 TTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG---AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCC 1133
.|.||.||.|||||.||.|||.|||..||.||||..||.|||||||| |||.|.| ||.||||||||.||
Sbjct 1177 CTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAA---GGCCAGCCCTCGCC 1247
Query 1134 TTTAGCACAGGTGCAGCAG 1152
||.||||||||||||||||
Sbjct 1248 TTCAGCACAGGTGCAGCAG 1266