Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489471
• Subject: XM_006714269.3
• Aligned Length: 1274
• Identities: 900
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74

Query    1  ----------------------------------------ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATA  34
                                                    |||||||.||||||...|||||||.|.||.||.|
Sbjct   75  TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA  148

Query   35  GTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACGATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCT  108
            ||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT  222

Query  109  CAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAAGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATT  182
            ||.||.|||||.||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||
Sbjct  223  CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296

Query  183  TCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTAGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAA  256
            ||||||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct  297  TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370

Query  257  TTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGAAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTC  330
            ||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.
Sbjct  371  TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG  444

Query  331  ATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAGATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGA  403
            ||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  445  ATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAA  517

Query  404  TGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATTCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTA  477
            ||.|||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct  518  TGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTC  591

Query  478  AAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGCCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCC  551
            ||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct  592  AAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCC  665

Query  552  TTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCCTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTAT  625
            .|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct  666  ATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGT  739

Query  626  GGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATAT  692
            ||||.||.||||||||.||||||||||||       |.||||       |.||.|||||.||.|..||..||||
Sbjct  740  GGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAAAAGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATAT  806

Query  693  TGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAG  766
            |||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  807  TGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAG  880

Query  767  TAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTC  840
            ||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||....|||||||||||.|||..|||.|||
Sbjct  881  TAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTC  954

Query  841  CCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGA  914
            |||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  955  CCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGA  1028

Query  915  TGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAG  988
            ..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||
Sbjct 1029  CCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAG  1102

Query  989  CAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAA  1062
            ..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1103  TGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAA  1176

Query 1063  TTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGGAGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTT  1136
            .|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||.||..||...||.|||||.|||||||.
Sbjct 1177  CTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTC  1250

Query 1137  AGCACAGGTGCAGCAG  1152
            ||||||||||||||||
Sbjct 1251  AGCACAGGTGCAGCAG  1266