Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000489471
Subject:
XM_017008445.2
Aligned Length:
1284
Identities:
740
Gaps:
366

Alignment

Query    1  ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA  296
                  |||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||
Sbjct    1  ------ATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA  68

Query  297  AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA  369
            .||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||
Sbjct   69  GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTA  141

Query  370  GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT  443
            ||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  142  GACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTAT  215

Query  444  TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG  517
            |||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  216  TCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGG  289

Query  518  CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC  591
            |||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  290  CCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC  363

Query  592  CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAA  665
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  364  CTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAA  437

Query  666  AATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  438  AATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAG  511

Query  740  AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT  813
            ||||||||||||||.|||||||.||||||||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||.
Sbjct  512  AATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTC  585

Query  814  GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA  887
            ...|||||||||||.|||..|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  586  CCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA  659

Query  888  TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA  961
            .|||||.||.||.|||||.||.||.||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||
Sbjct  660  CTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACA  733

Query  962  TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG  1035
            ||||.|||||||||||.||..|.||||..||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.
Sbjct  734  TCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGA  807

Query 1036  GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG  1109
            |||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||
Sbjct  808  GAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGG  881

Query 1110  AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAG-------------------------------  1152
            .||..||...||.|||||.|||||||     ||||||||||||                               
Sbjct  882  TGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTT-----CAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTC  950

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct  951  GTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCT  1024

Query 1153  --------------------------  1152
                                      
Sbjct 1025  CGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  1050