Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489471
• Subject: XM_017320888.2
• Aligned Length: 1287
• Identities: 896
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGAGCAGAAGCAAGCGT-GACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAAC  73
            |||||||.||||||| || ||||||.|.||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|
Sbjct    1  ATGAGCAAAAGCAAG-GTGGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGC  73

Query   74  GATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAA  147
            |.||.|||||..|.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.
Sbjct   74  GCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCTCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGAC  147

Query  148  AGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCT  221
            ||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||.||||||.||||.|||.|.|||||
Sbjct  148  AGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCT  221

Query  222  AGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAG  295
            .||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||.||||||.|.||.|
Sbjct  222  GGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGG  295

Query  296  AAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA  369
            |.||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  296  AGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTGATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTG  369

Query  370  GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT  443
            ||.||.||..|.|||||.|||.|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  370  GACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGATGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCAT  443

Query  444  TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG  517
            .||..||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||..||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  444  CCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGG  517

Query  518  CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC  591
            |||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  518  CCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCGTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC  591

Query  592  CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAA  665
            ||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct  592  CTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATGGTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAA  665

Query  666  AATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTG  739
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  666  AATCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAG  739

Query  740  AATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTT  813
            |.||||||||||||.||||.||.|||||.||.|..|||||.||.||..|.||.||.||.||.|||...|.|||.
Sbjct  740  AGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTC  813

Query  814  GAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGA  887
            ...||.|||||.||.|||..|||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  814  CCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGA  887

Query  888  TTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACA  961
            ||||||.||.||.|||.|.||.||.||..||.|.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct  888  TTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACA  961

Query  962  TCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGG  1035
            ||||.||.|||||.||.||..||||||..||.||.||.||.||..||||...|||.||||||.|.|||||||||
Sbjct  962  TCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGG  1035

Query 1036  GAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGG  1109
            ||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||.||.|||||.||.|||.|||..||.||||..||.||||||||
Sbjct 1036  GAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGG  1109

Query 1110  ---AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAG----------------------------  1152
               |||.|.|   ||.||||||||.||||     ||||||||||||                            
Sbjct 1110  CGTAGTCAAA---GGCCAGCCCTCGCCTT-----CAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATC  1175

Query 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152
                                                                                      
Sbjct 1176  CTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGG  1249

Query 1153  -----------------------------  1152
                                         
Sbjct 1250  CCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1278