Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489478
- Subject:
- XM_006540692.3
- Aligned Length:
- 2494
- Identities:
- 1524
- Gaps:
- 812
Alignment
Query 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
Query 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
Query 149 ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG 222
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 ATGGGAACCTCTTCCCTCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGCATCAACATTACG 222
Query 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGAGGCCTGCACACACTCAATGCTGTGGACAT 296
Query 297 GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG 370
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 GGAGCTCTACACGGGACTCCAGAAGCTGACCATCAAGAATTCTGGACTCCGGAACATCCAGCCCAGAGCCTTCG 370
Query 371 CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG 444
|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGAACCCCCACTTGCGTTATATAAACTTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCCTGGCAGCTCTTCCAG 444
Query 445 ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAG-TTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
||||||||.|||||||||||| || .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGCTGAGCCTTCGGGAATTG-AGACTGGAGCAGAACTTCTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
Query 518 TCTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTT 591
|.||||||||.|||||||||||...|||..|||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||.||.
Sbjct 518 TGTGGCAGGAACAGGGGGAGGCGCGGCTGGACAGCCAGAGCCTTTACTGCATCAGTGCTGATGGCTCCCAACTC 591
Query 592 CCTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACG 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 592 CCCCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGATCTCCCAGAGATCAGTGTGAGCCACGTCAACCTGACTGTCCG 665
Query 666 AGAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGAAGGAGACAATGCCGTGATCACTTGCAATGGCTCTGGCTCTCCTTTGCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
Query 740 GGCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTG 813
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 GGCTGCAGTCCATCAACACCCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTACATGCCATCAACTTGACCCTGGTG 813
Query 814 AATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AACGTGACGAGCGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
Query 888 TGTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCA 961
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 888 TGTTGCTCTCACTGTCTACTACCCTCCACGTGTGGTGAGCCTGGTGGAGCCTGAGGTACGCCTGGAACATTGCA 961
Query 962 TCGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCC 1035
|.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||
Sbjct 962 TTGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCGACACCCACGCTCCACTGGCTGTACAATGGACAGCCATTGAGGGAGTCC 1035
Query 1036 AAGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
||||||||.||..||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AAGATCATTCACATGGACTACTACCAGGAGGGGGAGGTCTCAGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
Query 1110 CTACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACT 1183
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110 CTACAACAATGGCAACTACACCCTCATTGCTAAGAATGCCCTGGGCACGGCCAACCAGACCATCAACGGCCACT 1183
Query 1184 TCCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGA---CGAAGTGAGTCCCACACCTCCT 1254
||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||||..| ||||| .||.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1184 TCCTGAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACAGATTTCTTTGAC---TTTGAGTCTGATGCGAGCCCTACACCTCCT 1254
Query 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTG 1328
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAGGAAGACACTTTTGGGGTGTCCATAGCAGTCGGACTTGCTGCCTTTGCCTG 1328
Query 1329 TGTCCTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCG 1402
.|||||..|||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329 CGTCCTTCTGGTGGTTCTCTTTATCATGATCAACAAGTATGGTCGCCGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCTG 1402
Query 1403 TGGCTGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCG 1476
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1403 TGGCTGTTATCAGTGGAGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCATCACATCAACCATGGCATCACTACACCATCA 1476
Query 1477 TCACTGGATGCCGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TCGTTGGATGCTGGGCCTGACACAGTGGTCATTGGCATGACCCGCATCCCAGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
Query 1551 CCGTCAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACACGTATGTGCAGCACATTAAGAGGAGAGACATCGTGCTGAAGC 1624
|||||||||.|||||.|||||||||||.||||| |||| || .|||||.||..||.||||.|
Sbjct 1551 CCGTCAGGGTCACAATTGCCACAAGCCAGACAC--ATGT--------TT-----CAGAGAAATTATGTTGAATC 1609
Query 1625 GAGAACTGGGTGAGGGAGCCTTT--GGAAAGGTCTTCCTGGCCGAGTGCTACAACCTCAGCCCGACCAAGGACA 1696
.|..| ||||||| |||.| ||||..||| |..|| ||||.|| ||
Sbjct 1610 CAATA-----------AGCCTTTCCGGACA----TTCCAAGCC---TCTTA-------------ACCATGG-CA 1651
Query 1697 -AGATGCTTGTGGCTGTGAAGGCCCTG------------AAGGATCCCACCCTGGCTGCCCGGAAGGATTTCCA 1757
..||| |||.||.|||.|| || ||||| |..|.||||| ||
Sbjct 1652 TCTATG-TTGAGGATGTCAA-----TGTTTATTTCAGCAAAGGA---CGTCATGGCT-----------TT---- 1701
Query 1758 GAGGGAGGCCGAGCTGCTCACCAACCTGCAGCATGAGCACATTGTCAAGTTCTATGGAGTGTGCGGCGATGGGG 1831
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 1832 ACCCCCTCATCATGGTCTTTGAATACATGAAGCATGGAGACCTGAATAAGTTCCTCAGGGCCCATGGGCCAGAT 1905
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 1906 GCAATGATCCTTGTGGATGGACAGCCACGCCAGGCCAAGGGTGAGCTGGGGCTCTCCCAAATGCTCCACATTGC 1979
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 1980 CAGTCAGATCGCCTCGGGTATGGTGTACCTGGCCTCCCAGCACTTTGTGCACCGAGACCTGGCCACCAGGAACT 2053
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2054 GCCTGGTTGGAGCGAATCTGCTAGTGAAGATTGGGGACTTCGGCATGTCCAGAGATGTCTACAGCACGGATTAT 2127
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2128 TACAGGGTGGGAGGACACACCATGCTCCCCATTCGCTGGATGCCTCCTGAAAGCATCATGTACCGGAAGTTCAC 2201
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2202 TACAGAGAGTGATGTATGGAGCTTCGGGGTGATCCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCATGGTTCC 2275
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2276 AACTCTCAAACACGGAGGTCATTGAGTGCATTACCCAAGGTCGTGTTTTGGAGCGGCCCCGAGTCTGCCCCAAA 2349
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2350 GAGGTGTACGATGTCATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCACAGCAGCGGTTGAACATCAAGGAGATCTACAA 2423
Sbjct 1702 -------------------------------------------------------------------------- 1701
Query 2424 AATCCTCCATGCTTTGGGGAAGGCCACCCCAATCTACCTGGACATTCTTGGC 2475
Sbjct 1702 ---------------------------------------------------- 1701
