Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489480
- Subject:
- NM_001305875.1
- Aligned Length:
- 1979
- Identities:
- 1635
- Gaps:
- 100
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAG--GAAGCGAGTTG---CCC 69
|||| ||||| .|.||.|| | |||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGG----GGAAGCTTAGGCCAG--GCCACCC 26
Query 70 GTGTG----TGCA-------AG---CTGCGGCCAGAGGATCT----ATGATG--GCCAGTACCTCCAGGCCCTG 123
.||.| |.|| || ||.|||.||||| || |.|||| ||||| ||| .|||||||
Sbjct 27 ATGGGCTCCTCCAGACCTCCAGAGTCTCCGGACAGAG---CTGCAGAGGATGCAGCCAG--CCT--TGGCCCTG 93
Query 124 AACGCGGACTGGCACGCAGACT-------------GCTTCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACC 184
| ||..|.|.|||.|.|| ||| |.|||.||.||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct 94 A-----GAAGGACCCGCTGCCTCCACCTCCGTGGGGCT--AAGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACC 160
Query 185 AGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGG 258
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 161 AGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGG 234
Query 259 TGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTG 332
|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 235 TGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTG 308
Query 333 CCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGC 406
||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 309 CCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCTACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCC 382
Query 407 ACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCC 480
|.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 383 AGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAACAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCC 456
Query 481 CACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCC 554
|||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 457 CACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCATGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCC 530
Query 555 GCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCGGGCTGCATGA 628
.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 531 TCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACACTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGACCCAGGCTGCATGA 604
Query 629 GCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTG 702
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 605 GCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGTG 678
Query 703 CCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCA 776
||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 679 CCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCCA 752
Query 777 CGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGG 850
.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||||||||||||.||||...|.|||||||||||..|||
Sbjct 753 TGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCCCCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAGG 826
Query 851 CGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTG 924
|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||.
Sbjct 827 CAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACTA 900
Query 925 GGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCAT 998
|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 901 GCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCCGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAAT 974
Query 999 CTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACAC 1072
|||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 975 CTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGGGCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACAC 1048
Query 1073 ACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTC 1146
||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1049 ACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTTATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCTC 1122
Query 1147 AAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAA 1220
||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1123 AAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAACGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACAA 1196
Query 1221 GAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGT 1294
|.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1197 GCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATCAAGGGCGGCACCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCCAGT 1270
Query 1295 ACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTTCACTCCATGAACATC 1368
||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1271 ACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATTGCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAACATC 1344
Query 1369 ATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCT 1442
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1345 ATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCGTGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGGGCT 1418
Query 1443 GGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGC 1516
|||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|.|.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1419 GGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAGACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGAAGC 1492
Query 1517 GCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTG 1590
|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1493 GGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCAGAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAGGTG 1566
Query 1591 GATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCG 1664
||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1567 GACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTATCGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCCCCG 1640
Query 1665 CACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCT 1738
|||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1641 CACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGGACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTTTCT 1714
Query 1739 TCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTG 1812
||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1715 TCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAAAAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGGCTA 1788
Query 1813 GAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTG 1886
||.||.||.|||||||||.||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.|||||
Sbjct 1789 GAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACTGGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTTCTG 1862
Query 1887 GGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC 1941
|||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1863 GGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCCACCCCGAGGTCCCTGAC 1917