Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489480
- Subject:
- NM_010717.3
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1707
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCTGTGTG 74
Query 75 TGCAAGCTGCGGCCAGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACTGCT 148
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 75 TGCGAGCTGTGGCCAGAGGATCTATGACGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAATGCTGACTGGCATGCAGACTGCT 148
Query 149 TCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAG 222
|||||||.||.||.||.||.|.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACCAGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAG 222
Query 223 GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 223 GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGGTGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGC 296
Query 297 TGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCT 370
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 297 TGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTGCCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCT 370
Query 371 ACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAG 444
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct 371 ACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCCAGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAA 444
Query 445 CAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCA 518
||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||
Sbjct 445 CAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCCCACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCA 518
Query 519 TGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACA 592
||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 519 TGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCCTCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACA 592
Query 593 CCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGG 666
|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 CTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGACCCAGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGG 666
Query 667 ATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAG 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 ATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGTGCCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAG 740
Query 741 CCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCC 814
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||
Sbjct 741 CCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCCATGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCC 814
Query 815 CCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGC 888
||||||||||.||||...|.|||||||||||..||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAGGCAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGC 888
Query 889 TGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTC 962
|||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACTAGCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTC 962
Query 963 TGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGG 1036
.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 963 CGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAATCTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGG 1036
Query 1037 GCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTG 1110
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037 GCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACACACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTT 1110
Query 1111 ATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAA 1184
||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 ATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCTCAAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAA 1184
Query 1185 CGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAAGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCA 1258
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACAAGCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATCAAGGGCGGCA 1258
Query 1259 CGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATC 1332
|.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259 CCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCCAGTACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATT 1332
Query 1333 GCATCAGGGATGGCCTACCTTCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCG 1406
||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 GCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCG 1406
Query 1407 CGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGG 1480
.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|
Sbjct 1407 TGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAG 1480
Query 1481 GCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCT 1554
.|.|.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481 ACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGAAGCGGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCA 1554
Query 1555 GAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCAT 1628
|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1555 GAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAGGTGGACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTAT 1628
Query 1629 CGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGG 1702
||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||
Sbjct 1629 CGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCCCCGCACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGG 1702
Query 1703 ACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAG 1776
||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1703 ACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTTTCTTCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAA 1776
Query 1777 AAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACT 1850
|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||.||.|.||.|||||||||||
Sbjct 1777 AAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGGCTAGAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACT 1850
Query 1851 GGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCC 1924
|||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||
Sbjct 1851 GGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTTCTGGGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCC 1924
Query 1925 ACCCTGAGGTCCCCGAC 1941
||||.||||||||.|||
Sbjct 1925 ACCCCGAGGTCCCTGAC 1941