Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489511
- Subject:
- NM_207655.2
- Aligned Length:
- 3651
- Identities:
- 3083
- Gaps:
- 50
Alignment
Query 1 ATGCGACCCTCCGGGACGGCCGGGGCAGCGCTCCTGGCGCTGCTGGCTGCGCTCTGCCCGGCGAGTCGGGCTCT 74
|||||||||||.|||||.||..|..|..|.||.||||.|.|||||.|.|||||||||.|.||..||.||||..|
Sbjct 1 ATGCGACCCTCAGGGACCGCGAGAACCACACTGCTGGTGTTGCTGACCGCGCTCTGCGCCGCAGGTGGGGCGTT 74
Query 75 GGAGGAAAAGAAAGTTTGCCAAGGCACGAGTAACAAGCTCACGCAGTTGGGCACTTTTGAAGATCATTTTCTCA 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||.||..||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 75 GGAGGAAAAGAAAGTCTGCCAAGGCACAAGTAACAGGCTCACCCAACTGGGCACTTTTGAAGACCACTTTCTGA 148
Query 149 GCCTCCAGAGGATGTTCAATAACTGTGAGGTGGTCCTTGGGAATTTGGAAATTACCTATGTGCAGAGGAATTAT 222
||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 GCCTGCAGAGGATGTACAACAACTGTGAAGTGGTCCTTGGGAACTTGGAAATTACCTATGTGCAAAGGAATTAC 222
Query 223 GATCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCTGGTTATGTCCTCATTGCCCTCAACACAGTGGAGCGAAT 296
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 223 GACCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCCGGCTATGTCCTCATTGCCCTCAACACCGTGGAGAGAAT 296
Query 297 TCCTTTGGAAAACCTGCAGATCATCAGAGGAAATATGTAC--TACGAAAATTCCTATGCCTTAGCAGTCTTATC 368
.||||||||.|||||||||||||||||.|||| |||..| ||.|||||..|||||||||||||..||.|.||
Sbjct 297 CCCTTTGGAGAACCTGCAGATCATCAGGGGAA--ATGCTCTTTATGAAAACACCTATGCCTTAGCCATCCTGTC 368
Query 369 TAACTATGATGCAAATAAAACCGGACTGAAGGAGCTGCCCATGAGAAATTTACAGGAAATCCTGCATGGCGCCG 442
.|||||||...||||.|.|||.||.||.|.|||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||..|||.||.|
Sbjct 369 CAACTATGGGACAAACAGAACTGGGCTTAGGGAACTGCCCATGCGGAACTTACAGGAAATCCTGATTGGTGCTG 442
Query 443 TGCGGTTCAGCAACAACCCTGCCCTGTGCAACGTGGAGAGCATCCAGTGGCGGGACATAGTCAGCA----GTGA 512
||||.||||||||||||||...|||.|||||..||||.|..|||||||||.|||||||.||| || ||
Sbjct 443 TGCGATTCAGCAACAACCCCATCCTCTGCAATATGGATACTATCCAGTGGAGGGACATCGTC--CAAAACGT-- 512
Query 513 CTTTCTCAGCAACATGTCGATGGACTTCCAGAACCACCTGGGCAGCTGCCAAAAGTGTGATCCAAGCTGTCCCA 586
||||.|.|||||||||||.||||||||.||||.|||.|.|.||||.||||..||.|||||||||||||||||||
Sbjct 513 CTTTATGAGCAACATGTCAATGGACTTACAGAGCCATCCGAGCAGTTGCCCCAAATGTGATCCAAGCTGTCCCA 586
Query 587 ATGGGAGCTGCTGGGGTGCAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAACTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAGTGCTCC 660
||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 587 ATGGAAGCTGCTGGGGAGGAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAATTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAATGTTCC 660
Query 661 GGGCGCTGCCGTGGCAAGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAGTGTGCTGCAGGCTGCACAGGCCCCCGGGA 734
...|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 661 CATCGCTGTCGTGGCAGGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAATGTGCTGCGGGGTGTACAGGGCCCCGAGA 734
Query 735 GAGCGACTGCCTGGTCTGCCGCAAATTCCGAGACGAAGCCACGTGCAAGGACACCTGCCCCCCACTCATGCTCT 808
|||.|||||.||||||||||..||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 735 GAGTGACTGTCTGGTCTGCCAAAAGTTCCAAGATGAGGCCACATGCAAAGACACCTGCCCACCACTCATGCTGT 808
Query 809 ACAACCCCACCACGTACCAGATGGATGTGAACCCCGAGGGCAAATACAGCTTTGGTGCCACCTGCGTGAAGAAG 882
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 809 ACAACCCCACCACCTATCAGATGGATGTCAACCCTGAAGGGAAGTACAGCTTTGGTGCCACCTGTGTGAAGAAG 882
Query 883 TGTCCCCGTAATTATGTGGTGACAGATCACGGCTCGTGCGTCCGAGCCTGTGGGGCCGACAGCTATGAGATGGA 956
||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|||..|||.||..||||
Sbjct 883 TGCCCCCGAAACTACGTGGTGACAGATCATGGCTCATGTGTCCGAGCCTGTGGGCCTGACTACTACGAAGTGGA 956
Query 957 GGAAGACGGCGTCCGCAAGTGTAAGAAGTGCGAAGGGCCTTGCCGCAAAGTGTGTAACGGAATAGGTATTGGTG 1030
.|||||.|||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 957 AGAAGATGGCATCCGCAAGTGTAAAAAATGTGATGGGCCCTGTCGCAAAGTTTGTAATGGCATAGGCATTGGTG 1030
Query 1031 AATTTAAAGACTCACTCTCCATAAATGCTACGAATATTAAACACTTCAAAAACTGCACCTCCATCAGTGGCGAT 1104
|||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||..|||||||.||.||.
Sbjct 1031 AATTTAAAGACACACTCTCCATAAATGCTACAAACATCAAACACTTCAAATACTGCACTGCCATCAGCGGGGAC 1104
Query 1105 CTCCACATCCTGCCGGTGGCATTTAGGGGTGACTCCTTCACACATACTCCTCCTCTGGATCCACAGGAACTGGA 1178
||.|||||||||||.|||||.||||.|||.||.||.|||||.|..|||||||||||.||.||||..|||||.||
Sbjct 1105 CTTCACATCCTGCCAGTGGCCTTTAAGGGGGATTCTTTCACGCGCACTCCTCCTCTAGACCCACGAGAACTAGA 1178
Query 1179 TATTCTGAAAACCGTAAAGGAAATCACAGGGTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGAAAACAGGACGGACCTCC 1252
.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1179 AATTCTAAAAACCGTAAAGGAAATAACAGGCTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGATAACTGGACTGACCTCC 1252
Query 1253 ATGCCTTTGAGAACCTAGAAATCATACGCGGCAGGACCAAGCAACATGGTCAGTTTTCTCTTGCAGTCGTCAGC 1326
||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||..||
Sbjct 1253 ATGCTTTCGAGAACCTAGAAATAATACGTGGCAGAACAAAGCAACATGGTCAGTTTTCTTTGGCGGTCGTTGGC 1326
Query 1327 CTGAACATAACATCCTTGGGATTACGCTCCCTCAAGGAGATAAGTGATGGAGATGTGATAATTTCAGGAAACAA 1400
||||||||.|||||..||||..|.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||..
Sbjct 1327 CTGAACATCACATCACTGGGGCTGCGTTCCCTCAAGGAGATCAGTGATGGGGATGTGATCATTTCTGGAAACCG 1400
Query 1401 AAATTTGTGCTATGCAAATACAATAAACTGGAAAAAACTGTTTGGGACCTCCGGTCAGAAAACCAAAATTATAA 1474
||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||..||..|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1401 AAATTTGTGCTACGCAAACACAATAAACTGGAAAAAACTCTTCGGGACACCCAATCAGAAAACCAAAATCATGA 1474
Query 1475 GCAACAGAGGTGAAAACAG-CTGCAAGGCCACAGG----CCAGGTCTGCCATGCCTTGTGCTCCCCCGAGGGCT 1543
.||||||||.|||.|| || |||||||||| | |||.||||||.||.|.||.||||||.|.||.||||
Sbjct 1475 ACAACAGAGCTGAGAA-AGACTGCAAGGCC----GTGAACCACGTCTGCAATCCTTTATGCTCCTCGGAAGGCT 1543
Query 1544 GCTGGGGCCCGGAGCCCAGGGACTGCGTCTCTTGCCGGAATGTCAGCCGAGGCAGGGAATGCGTGGACAAGTGC 1617
||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||||.|||.||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1544 GCTGGGGCCCTGAGCCCAGGGACTGTGTCTCCTGCCAGAATGTGAGCAGAGGCAGGGAGTGCGTGGAGAAATGC 1617
Query 1618 AACCTTCTGGAGGGTGAGCCAAGGGAGTTTGTGGAGAACTCTGAGTGCATACAGTGCCACCCAGAGTGCCTGCC 1691
|||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1618 AACATCCTGGAGGGGGAACCAAGGGAGTTTGTGGAAAATTCTGAATGCATCCAGTGCCATCCAGAATGTCTGCC 1691
Query 1692 TCAGGCCATGAACATCACCTGCACAGGACGGGGACCAGACAACTGTATCCAGTGTGCCCACTACATTGACGGCC 1765
.||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1692 CCAGGCCATGAACATCACCTGTACAGGCAGGGGACCAGACAACTGCATCCAGTGTGCCCACTACATTGATGGCC 1765
Query 1766 CCCACTGCGTCAAGACCTGCCCGGCAGGAGTCATGGGAGAAAACAACACCCTGGTCTGGAAGTACGCAGACGCC 1839
|.|||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1766 CACACTGTGTCAAGACCTGCCCAGCTGGCATCATGGGAGAGAACAACACTCTGGTCTGGAAGTATGCAGATGCC 1839
Query 1840 GGCCATGTGTGCCACCTGTGCCATCCAAACTGCACCTACGGATGCACTGGGCCAGGTCTTGAAGGCTGT----- 1908
....||||.||||||||.|||||..|.|||||.|||||.|||||..||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1840 AATAATGTCTGCCACCTATGCCACGCCAACTGTACCTATGGATGTGCTGGGCCAGGTCTTCAAGGATGTGAAGT 1913
Query 1909 ----CCAACGAATGGGCCTAAGATCCCGTCCATCGCCACTGGGATGGTGGGGGCCCTCCTCTTGCTGCTGGTGG 1978
|||.| ||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|.|||||||||..|..||||||
Sbjct 1914 GTGGCCATC---TGGGCCAAAGATACCATCTATTGCCACTGGGATTGTGGGTGGCCTCCTCTTCATAGTGGTGG 1984
Query 1979 TGGCCCTGGGGATCGGCCTCTTCATGCGAAGGCGCCACATCGTTCGGAAGCGCACGCTGCGGAGGCTGCTGCAG 2052
|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||..|.|||||.||.
Sbjct 1985 TGGCCCTTGGGATTGGCCTATTCATGCGAAGACGTCACATTGTTCGAAAGCGTACACTACGCCGCCTGCTTCAA 2058
Query 2053 GAGAGGGAGCTTGTGGAGCCTCTTACACCCAGTGGAGAAGCTCCCAACCAAGCTCTCTTGAGGATCTTGAAGGA 2126
|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.|||||||||.||.|||||
Sbjct 2059 GAGAGAGAGCTCGTGGAACCTCTCACACCCAGCGGAGAAGCTCCAAACCAAGCCCACTTGAGGATATTAAAGGA 2132
Query 2127 AACTGAATTCAAAAAGATCAAAGTGCTGGGCTCCGGTGCGTTCGGCACGGTGTATAAGGGACTCTGGATCCCAG 2200
|||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2133 AACAGAATTCAAAAAGATCAAAGTTCTGGGTTCGGGAGCATTTGGCACAGTGTATAAGGGTCTCTGGATCCCAG 2206
Query 2201 AAGGTGAGAAAGTTAAAATTCCCGTCGCTATCAAG---------GAACCAACATCTCCGAAAGCCAACAAGGAA 2265
|||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||| |||.|.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2207 AAGGTGAGAAAGTAAAAATCCCGGTGGCCATCAAGGAGTTAAGAGAAGCCACATCTCCAAAAGCCAACAAAGAA 2280
Query 2266 ATCCTCGATGAAGCCTACGTGATGGCCAGCGTGGACAACCCCCACGTGTGCCGCCTGCTGGGCATCTGCCTCAC 2339
|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2281 ATCCTTGACGAAGCCTATGTGATGGCTAGTGTGGACAACCCTCATGTATGCCGCCTCCTGGGCATCTGTCTGAC 2354
Query 2340 CTCCACCGTGCAACTCATCACGCAGCTCATGCCCTTCGGCTGCCTCCTGGACTATGTCCGGGAACACAAAGACA 2413
||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2355 CTCCACTGTCCAGCTCATTACACAGCTCATGCCCTACGGTTGCCTCCTGGACTACGTCCGAGAACACAAGGACA 2428
Query 2414 ATATTGGCTCCCAGTACCTGCTCAACTGGTGTGTGCAGATCGCAAAGGGCATGAACTACTTGGAGGACCGTCGC 2487
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||.||.
Sbjct 2429 ACATTGGCTCCCAGTACCTCCTCAACTGGTGTGTGCAGATTGCAAAGGGCATGAACTACCTGGAAGATCGGCGT 2502
Query 2488 TTGGTGCACCGCGACCTGGCAGCCAGGAACGTACTGGTGAAAACACCGCAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG 2561
|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 TTGGTGCACCGTGACTTGGCAGCCAGGAATGTACTGGTGAAGACACCACAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG 2576
Query 2562 GCTGGCCAAACTGCTGGGTGCGGAAGAGAAAGAATACCATGCAGAAGGAGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG 2635
|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 GCTGGCCAAACTGCTTGGTGCTGAAGAGAAAGAATATCATGCCGAGGGGGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG 2650
Query 2636 CATTGGAATCAATTTTACACAGAATCTATACCCACCAGAGTGATGTCTGGAGCTACGGGGTGACCGTTTGGGAG 2709
|.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 2651 CTTTGGAATCAATTTTACACCGAATTTATACACACCAAAGTGATGTCTGGAGCTATGGTGTCACTGTGTGGGAA 2724
Query 2710 TTGATGACCTTTGGATCCAAGCCATATGACGGAATCCCTGCCAGCGAGATCTCCTCCATCCTGGAGAAAGGAGA 2783
.|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2725 CTGATGACCTTTGGGTCCAAGCCTTATGATGGAATCCCAGCAAGTGACATCTCATCCATCCTAGAGAAAGGAGA 2798
Query 2784 ACGCCTCCCTCAGCCACCCATATGTACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGACGCAG 2857
.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2799 GCGCCTTCCACAGCCACCTATCTGCACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGATGCTG 2872
Query 2858 ATAGTCGCCCAAAGTTCCGTGAGTTGATCATCGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCCCAGCGCTACCTTGTC 2931
||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2873 ATAGCCGCCCAAAGTTCCGAGAGTTGATTCTTGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCACAGCGCTACCTTGTT 2946
Query 2932 ATTCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGTCCTACAGACTCCAACTTCTACCGTGCCCTGATGGATGAAGA 3005
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2947 ATCCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGCCCTACAGACTCCAACTTTTACCGAGCCCTGATGGATGAAGA 3020
Query 3006 AGACATGGACGACGTGGTGGATGCCGACGAGTACCTCATCCCACAGCAGGGCTTCTTCAGCAGCCCCTCCACGT 3079
.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 3021 GGACATGGAGGATGTAGTTGATGCTGATGAGTATCTTATCCCACAGCAAGGCTTCTTCAACAGCCCGTCCACGT 3094
Query 3080 CACGGACTCCCCTCCTGAGCTCTCTGAGTGCAACCAGCAACAATTCCACCGTGGCTTGCATTGATAGAAATGGG 3153
|..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 3095 CGAGGACTCCCCTCTTGAGTTCTCTGAGTGCAACTAGCAACAATTCCACTGTGGCTTGCATTAATAGAAATGGG 3168
Query 3154 CTGCAAAGCTGTCCCATCAAGGAAGACAGCTTCTTGCAGCGATACAGCTCAGACCCCACAGGCGCCTTGACTGA 3227
|||||.|...||||.||||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.||
Sbjct 3169 ------AGCTGCCGTGTCAAAGAAGACGCCTTCTTGCAGCGGTACAGCTCCGACCCCACAGGTGCTGTAACAGA 3236
Query 3228 GGACAGCATAGACGACACCTTCCTCCCAGTGCCTGAATACATAAACCAGTCCGTTCCCAAAAAGGCCCGCTGGA 3301
|||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||..|||||||.||.|||||| ||.|||||.||.||.
Sbjct 3237 GGACAACATAGATGACGCATTCCTCCCTGTACCTGAATATGTAAACCAATCTGTTCCC-AAGAGGCCAGCAGGC 3309
Query 3302 TCTGTGCAGAATCCTGTCTATCACAATCAGCCTCTGAACCCCGCGCCCAGCAGAGACCCACACTACCAGGACCC 3375
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||..|.|||||||..||.||.||..|.||
Sbjct 3310 TCTGTGCAGAACCCTGTCTATCACAATCAGCCCCTGCATCCAGCTCCTGGAAGAGACCTGCATTATCAAAATCC 3383
Query 3376 CCACAGCACTGCAGTGGGCAACCCCGAGTATCTCAACACTGTCCAGCCCACCTGTGTCAACAGCACATTCGACA 3449
||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||.|||..||....||..|||
Sbjct 3384 CCACAGCAATGCAGTGGGCAACCCTGAGTATCTCAACACTGCCCAGCCTACCTGTCTCAGTAGTGGGTTTAACA 3457
Query 3450 GCCCTGCCCACTGGGCCCAGAAAGGCAGCCACCAAATTAGCCTGGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTT 3523
|||||||.|.||||..||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3458 GCCCTGCACTCTGGATCCAGAAAGGCAGTCACCAAATGAGCCTAGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTC 3531
Query 3524 CCCAAGGAAGCCAAGCCAAATGGCATCTTTAAGGGCTCCACAGCTGAAAATGCAGAATACCTAAGGGTCGCGCC 3597
|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||
Sbjct 3532 CCCAAGGAAACCAAGCCAAATGGCATATTTAAGGGCCCCACAGCTGAAAATGCAGAGTACCTACGGGTGGCACC 3605
Query 3598 ACAAAGCAGTGAATTTATTGGAGCA 3622
.|.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 3606 TCCAAGCAGTGAGTTTATTGGAGCA 3630