Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489514
- Subject:
- XM_006532409.2
- Aligned Length:
- 1243
- Identities:
- 945
- Gaps:
- 140
Alignment
Query 1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA 74
||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.||||| |||
Sbjct 1 ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA 50
Query 75 TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA 148
| |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct 51 T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC 115
Query 149 CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGCT 222
|||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 116 CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGCC 189
Query 223 GAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGT 296
||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.
Sbjct 190 GAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGC 263
Query 297 CAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGA 364
| |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||| ||||||
Sbjct 264 C------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGA 331
Query 365 TCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACC 438
||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 332 TCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACC 405
Query 439 CCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCC 511
.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 406 ACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCC 478
Query 512 CCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAG 585
|||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 479 CCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAG 552
Query 586 AAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCC 659
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 553 AAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCC 626
Query 660 CATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGA 733
||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 627 CATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCA 700
Query 734 AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAA 807
||
Sbjct 701 AG------------------------------------------------------------------------ 702
Query 808 CACGTCCCGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGG 881
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 703 ---------------------GTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGG 755
Query 882 CTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGG 955
|||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 756 CTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGG 829
Query 956 ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAA 1029
||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 830 ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAA 903
Query 1030 ACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCC 1103
||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 904 ACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACC 977
Query 1104 AGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCATGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACT 1177
.|||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 978 CGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACT 1051
Query 1178 CGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG 1236
|.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1052 CACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG 1110