Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489537
• Subject: XM_006716439.3
• Aligned Length: 3400
• Identities: 2579
• Gaps: 820

Alignment

Query    1  ATGAAGTATTCTTGCTGTGCTCTGGTTTTGGCTGTCCTGGGCACAGAATTGCTGGGAAGCCTCTGTTCGACTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTATTCTTGCTGTGCTCTGGTTTTGGCTGTCCTGGGCACAGAATTGCTGGGAAGCCTCTGTTCGACTGT  74

Query   75  CAGATCCCCGAGGTTCAGAGGACGGATACAGCAGGAACGAAAAAACATCCGACCCAACATTATTCTTGTGCTTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGATCCCCGAGGTTCAGAGGACGGATACAGCAGGAACGAAAAAACATCCGACCCAACATTATTCTTGTGCTTA  148

Query  149  CCGATGATCAAGATGTGGAGCTGGGGTCCCTGCAAGTCATGAACAAAACGAGAAAGATTATGGAACATGGGGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGATGATCAAGATGTGGAGCTGGGGTCCCTGCAAGTCATGAACAAAACGAGAAAGATTATGGAACATGGGGGG  222

Query  223  GCCACCTTCATCAATGCCTTTGTGACTACACCCATGTGCTGCCCGTCACGGTCCTCCATGCTCACCGGGAAGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCACCTTCATCAATGCCTTTGTGACTACACCCATGTGCTGCCCGTCACGGTCCTCCATGCTCACCGGGAAGTA  296

Query  297  TGTGCACAATCACAATGTCTACACCAACAACGAGAACTGCTCTTCCCCCTCGTGGCAGGCCATGCATGAGCCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGCACAATCACAATGTCTACACCAACAACGAGAACTGCTCTTCCCCCTCGTGGCAGGCCATGCATGAGCCTC  370

Query  371  GGACTTTTGCTGTATATCTTAACAACACTGGCTACAGAACAGCCTTTTTTGGAAAATACCTCAATGAATATAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACTTTTGCTGTATATCTTAACAACACTGGCTACAGAACAGCCTTTTTTGGAAAATACCTCAATGAATATAAT  444

Query  445  GGCAGCTACATCCCCCCTGGGTGGCGAGAATGGCTTGGATTAATCAAGAATTCTCGCTTCTATAATTACACTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCAGCTACATCCCCCCTGGGTGGCGAGAATGGCTTGGATTAATCAAGAATTCTCGCTTCTATAATTACACTGT  518

Query  519  TTGTCGCAATGGCATCAAAGAAAAGCATGGATTTGATTATGCAAAGGACTACTTCACAGACTTAATCACTAACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTGTCGCAATGGCATCAAAGAAAAGCATGGATTTGATTATGCAAAGGACTACTTCACAGACTTAATCACTAACG  592

Query  593  AGAGCATTAATTACTTCAAAATGTCTAAGAGAATGTATCCCCATAGGCCCGTTATGATGGTGATCAGCCACGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGCATTAATTACTTCAAAATGTCTAAGAGAATGTATCCCCATAGGCCCGTTATGATGGTGATCAGCCACGCT  666

Query  667  GCGCCCCACGGCCCCGAGGACTCAGCCCCACAGTTTTCTAAACTGTACCCCAATGCTTCCCAACACATAACTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCGCCCCACGGCCCCGAGGACTCAGCCCCACAGTTTTCTAAACTGTACCCCAATGCTTCCCAACACATAACTCC  740

Query  741  TAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACCAATGCTGCCCATCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACCAATGCTGCCCATCCACA  814

Query  815  TGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATGATTCTGTGGAGAGGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATGATTCTGTGGAGAGGCTG  888

Query  889  TATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCCGACCATGGTTACCATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCCGACCATGGTTACCATAT  962

Query  963  TGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGTGCCTTTTTTTATTCGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGTGCCTTTTTTTATTCGTG  1036

Query 1037  GTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGGCCCCCACGATCCTGGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGGCCCCCACGATCCTGGAT  1110

Query 1111  ATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTGGACCCAGAAAAGCCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTGGACCCAGAAAAGCCAGG  1184

Query 1185  TAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGAAAGAGGCAAATTTCTAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGAAAGAGGCAAATTTCTAC  1258

Query 1259  GTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATGAACGGGTCAAAGAACTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATGAACGGGTCAAAGAACTA  1332

Query 1333  TGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGCATTGAGGATACATCTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGCATTGAGGATACATCTGG  1406

Query 1407  CAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAGCACGCGGAACCTCTACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAGCACGCGGAACCTCTACG  1480

Query 1481  CTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTGCCAGCAGAAGCCAAAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTGCCAGCAGAAGCCAAAGA  1554

Query 1555  AAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTTGTCCATACTCGGCAGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTTGTCCATACTCGGCAGAC  1628

Query 1629  ACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGAAGAAGAATTGCAAGTGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGAAGAAGAATTGCAAGTGT  1702

Query 1703  TGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATCTCCAGGCTTCCAGTGGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATCTCCAGGCTTCCAGTGGT  1776

Query 1777  GGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACTGTCCGAGTGACACACAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACTGTCCGAGTGACACACAA  1850

Query 1851  GTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGCCAGAGCGTGGAAGGACC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGCCAGAGCGTGGAAGGACC  1924

Query 1925  ATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAAGAGAAGTGAGAGGACAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAAGAGAAGTGAGAGGACAT  1998

Query 1999  CTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAAGAGAAAGGTGTAAAAAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAAGAGAAAGGTGTAAAAAA  2072

Query 2073  GCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGATAGCAAACTGCAACTTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGATAGCAAACTGCAACTTT  2146

Query 2147  TCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGAAGGGGGAAGAGTGCAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGAAGGGGGAAGAGTGCAGC  2220

Query 2221  CTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTCTGGAACCTGGGATCTTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTCTGGAACCTGGGATCTTT  2294

Query 2295  CTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGAGACGCATAATTTTCTTT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGAGACGCATAATTTTCTTT  2368

Query 2369  TCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATCAGCTCACAAATACAGTG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATCAGCTCACAAATACAGTG  2442

Query 2443  CACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGAAGCTGTCAAGGATATAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGAAGCTGTCAAGGATATAA  2516

Query 2517  GCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGGAAATAAAGATGGAGGAAGCTATGACCTACACAGAGGAC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  ||||||
Sbjct 2517  GCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTT----------------------------------GAGGAC  2556

Query 2591  AGTTATGGGATGGATGGGAAGGTG--------------------------------------------------  2614
            |||||||||||||||||||||||.                                                  
Sbjct 2557  AGTTATGGGATGGATGGGAAGGTTAATCAGCCCCGTCTCACTGCAGACATCAACTGGCAAGGCCTAGAGGAGCT  2630

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 2631  ACACAGTGTGAATGAAAACATCTATGAGTACAGACAAAACTACAGACTTAGTCTGGTGGACTGGACTAATTACT  2704

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 2705  TGAAGGATTTAGATAGAGTATTTGCACTGCTGAAGAGTCACTATGAGCAAAATAAAACAAATAAGACTCAAACT  2778

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 2779  GCTCAAAGTGACGGGTTCTTGGTTGTCTCTGCTGAGCACGCTGTGTCAATGGAGATGGCCTCTGCTGACTCAGA  2852

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 2853  TGAAGACCCAAGGCATAAGGTTGGGAAAACACCTCATTTGACCTTGCCAGCTGACCTTCAAACCCTGCATTTGA  2926

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 2927  ACCGACCAACATTAAGTCCAGAGAGTAAACTTGAATGGAATAACGACATTCCAGAAGTTAATCATTTGAATTCT  3000

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 3001  GAACACTGGAGAAAAACCGAAAAATGGACGGGGCATGAAGAGACTAATCATCTGGAAACCGATTTCAGTGGCGA  3074

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 3075  TGGCATGACAGAGCTAGAGCTCGGGCCCAGCCCCAGGCTGCAGCCCATTCGCAGGCACCCGAAAGAACTTCCCC  3148

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 3149  AGTATGGTGGTCCTGGAAAGGACATTTTTGAAGATCAACTATATCTTCCTGTGCATTCCGATGGAATTTCAGTT  3222

Query 2615  --------------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                      
Sbjct 3223  CATCAGATGTTCACCATGGCCACCGCAGAACACCGAAGTAATTCCAGCATAGCGGGGAAGATGTTGACCAAGGT  3296

Query 2615  ----------------------------------------------------------------------  2614
                                                                                  
Sbjct 3297  GGAGAAGAATCACGAAAAGGAGAAGTCACAGCACCTAGAAGGCAGCGCCTCCTCTTCACTCTCCTCTGAT  3366