Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489543
• Subject: NM_001005525.2
• Aligned Length: 1402
• Identities: 1172
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTTGTACAAAAAAGCAGGCACCATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC  148
                                  ||||||||||.|||||||||.|||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGGCGGCTATTGATACAGAACGAGATGGATTAGCCCTAGAAAAGACATCAC  52

Query  149  CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA  222
            |.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct   53  CGGATAGAGAAAAGAAAAAAGAGCAGTCAGATATATCTATTTCTCCTAGAGCCTCAAAACATCATTATTCAAGG  126

Query  223  TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAAT-GAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAA  295
            ||..|.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|| ||||||||    |||||||||||||||||||
Sbjct  127  TCGAGGTCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAATCAGATGATGGAAGGAAG----CACAGGAGCCGGAGCAGAA  196

Query  296  GCAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACATAATGACAAA  369
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  197  GCAAAGAGGGAAGAAGACATGAGTCCAAAGATAAGTCCTCTAAGAGACACAAGTCTGAGGAGCACAATGACAAA  270

Query  370  GAACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAAACGCAAAGA  443
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  271  GAACATTCTTCTGACAAAGGAAGAGAGCGATTAAATTCATCTGAGAATGGTGAGGACAGACATAAACGCAAAGA  344

Query  444  AAGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTAGAAGCAGGG  517
            |||.|||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  345  AAGGAAGTCATCACGGGGCAGAAGTCACTCAAGGTCTAGATCGCGTGAAAGGCGCCATCGCAGTAGAAGCAGGG  418

Query  518  AGCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGGAAGAAATCG  591
            |..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||..||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  419  AAAGGAAGAAGTCTCGATCGAGGAGTAGGGATCGGAAAAAGTCTCGATCCAGAAGCAGAGACAGGAAGAAGTCA  492

Query  592  AGATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAGGCATAGGAC  665
            |||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||..||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  493  AGATCTAGAAGCAGGGATAGGAAACGAAGGATCAGAACTCGTTCCCGATCCAGATCCAGACACAGGCATAGGAC  566

Query  666  TAGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAAGATTTAGCA  739
            ||||||||||||.||..||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  567  TAGAAGCAGGAGCAGATCAAGGAGTCGAAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAACCAAGAAGATTTAGCA  640

Query  740  GAAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACGTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAGGAAGCTTTA  813
            ||||..||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..||
Sbjct  641  GAAGCCTAAGCCGGACACCTAGTCCACCTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGACGCTCAAGAAGCACTA  714

Query  814  GCTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACAAAAACAACA  887
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  715  GCTAGGAGATTAGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAACGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAGCAGAAACAACA  788

Query  888  AGAAATAGCT---GCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCATCAGGAACAC  958
            ||||||.|||   |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  789  AGAAATGGCTGCAGCAGCTGCAGCCACTGGAGGTTCAGTTCTTAATGTTGCTGCACTGTTGGCATCAGGAACGC  862

Query  959  AAGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAGACAGGAATA  1032
            |.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  863  AGGTTACTCCTCAGATAGCTATGGCAGCTCAAATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCCTTGGCAGAGACTGGCATA  936

Query 1033  GCTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAAAAGGAAAAT  1106
            ||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  937  GCAGTGCCCAGCTACTACAACCCAGCAGCTGTGAATCCAATGAAGTTTGCTGAGCAAGAGAAAAAGAGGAAAAT  1010

Query 1107  GCTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATTTTGGAAACA  1180
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1011  GCTCTGGCAAGGCAAGAAAGAAGGCGACAAATCTCAGTCTGCTGAAATCTGGGAAAAATTAAATTTTGGAAACA  1084

Query 1181  AGGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGCTCAGTTGAT  1254
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1085  AGGACCAAAATGTCAAATTTAGAAAGTTAATGGGCATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGCTGTAGCTCCGTTGAT  1158

Query 1255  GAAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGAAATGGCAAG  1328
            |||||||||||.||||||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  GAAGAAAGTTATAAGACTTTAAAGCAACAAGAAGAAGTTTTTCGCAATCTTGATGCTCAGTATGAAATGGCAAG  1232

Query 1329  ATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATGCAGTT  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1233  ATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGTGGAATGGATACAGTT  1302