Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489543
- Subject:
- XM_011538689.1
- Aligned Length:
- 1411
- Identities:
- 1112
- Gaps:
- 296
Alignment
Query 1 ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTTGTACAAAAAAGCAGGCACCATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAA--AAC--------ACAGGAGCC 286
|||| .||||| ||| |
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGA--TAAGAACCAACTTCTTCTTA-------- 24
Query 287 GGAGCAGAAGCAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACAT 360
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 -----------AAACAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACAT 87
Query 361 AATGACAAAGAACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAA 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 AATGACAAAGAACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAA 161
Query 435 ACGCAAAGAAAGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTA 508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 ACGCAAAGAAAGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTA 235
Query 509 GAAGCAGGGAGCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGG 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GAAGCAGGGAGCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGG 309
Query 583 AAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAG 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 AAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAG 383
Query 657 GCATAGGACTAGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAA 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 GCATAGGACTAGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAA 457
Query 731 GATTTAGCAGAAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACGTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAG 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 GATTTAGCAGAAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACCTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAG 531
Query 805 GAAGCTTTAGCTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACA 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 GAAGCTTTAGCTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACA 605
Query 879 AAAACAACAAGAAATAGCT---GCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCAT 949
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 AAAACAACAAGAAATAGCTGCAGCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCAT 679
Query 950 CAGGAACACAAGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAG 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 CAGGAACACAAGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAG 753
Query 1024 ACAGGAATAGCTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAA 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 ACAGGAATAGCTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAA 827
Query 1098 AAGGAAAATGCTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATT 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 AAGGAAAATGCTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATT 901
Query 1172 TTGGAAACAAGGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGC 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 TTGGAAACAAGGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGC 975
Query 1246 TCAGTTGATGAAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 TCAGTTGATGAAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGA 1049
Query 1320 AATGGCAAGATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATG 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 AATGGCAAGATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATG 1123
Query 1394 CAGTT 1398
|||||
Sbjct 1124 CAGTT 1128