Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489543
- Subject:
- XM_017019830.2
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 1211
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTTGTACAAAAAAGCAGGCACCATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC 52
Query 149 CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA 126
Query 223 TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG 200
Query 297 CAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACATAATGACAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 CAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACATAATGACAAAG 274
Query 371 AACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAAACGCAAAGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 AACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAAACGCAAAGAA 348
Query 445 AGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTAGAAGCAGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTAGAAGCAGGGA 422
Query 519 GCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGGAAGAAATCGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 GCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGGAAGAAATCGA 496
Query 593 GATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAGGCATAGGACT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAGGCATAGGACT 570
Query 667 AGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAAGATTTAGCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAAGATTTAGCAG 644
Query 741 AAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACGTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAGGAAGCTTTAG 814
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 AAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACCTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAGGAAGCTTTAG 718
Query 815 CTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACAAAAACAACAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACAAAAACAACAA 792
Query 889 GAAATAGCTGCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCATCAGGAACACAAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 GAAATAGCTGCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCATCAGGAACACAAGT 866
Query 963 AACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAGACAGGAATAGCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 AACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAGACAGGAATAGCTG 940
Query 1037 TTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAAAAGGAAAATGCTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 TTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAAAAGGAAAATGCTT 1014
Query 1111 TGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATTTTGGAAACAAGGA 1184
||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 TGGCAGGGCAAGAAAGAAGG------------------------------------------------------ 1034
Query 1185 CCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGCTCAGTTGATGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 ------------------------------------GAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGCTCAGTTGATGAAG 1072
Query 1259 AAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGAAATGGCAAGATCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 AAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGAAATGGCAAGATCA 1146
Query 1333 CAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATGCAGTT 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 CAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATGCAGTT 1212