Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489543
- Subject:
- XM_017019831.1
- Aligned Length:
- 1423
- Identities:
- 1135
- Gaps:
- 287
Alignment
Query 1 ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTTGTACAAAAAAGCAGGCACCATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG 34
Query 297 CAAAG----------------------AGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAG 348
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 35 CAAAGAGAACCAACTTCTTCTTAAAACAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAG 108
Query 349 TCTGAGGAACATAATGACAAAGAACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGA 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TCTGAGGAACATAATGACAAAGAACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGA 182
Query 423 GGACAGGCACAAACGCAAAGAAAGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGAC 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 GGACAGGCACAAACGCAAAGAAAGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGAC 256
Query 497 GCCATCGTAGTAGAAGCAGGGAGCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGA 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 GCCATCGTAGTAGAAGCAGGGAGCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGA 330
Query 571 AGCAGAGAGAGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAG 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 AGCAGAGAGAGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAG 404
Query 645 ATCAAGACACAGGCATAGGACTAGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 ATCAAGACACAGGCATAGGACTAGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTG 478
Query 719 AAAAGCCGAGAAGATTTAGCAGAAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACGTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCA 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 AAAAGCCGAGAAGATTTAGCAGAAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACCTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCA 552
Query 793 ATGGATGCACAGGAAGCTTTAGCTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAAT 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 ATGGATGCACAGGAAGCTTTAGCTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAAT 626
Query 867 GGTTGAAAAACAAAAACAACAAGAAATAGCT---GCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTG 937
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GGTTGAAAAACAAAAACAACAAGAAATAGCTGCAGCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTG 700
Query 938 CCCTGTTGGCATCAGGAACACAAGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAA 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 CCCTGTTGGCATCAGGAACACAAGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAA 774
Query 1012 GCTTTGGCAGAGACAGGAATAGCTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GCTTTGGCAGAGACAGGAATAGCTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGA 848
Query 1086 ACAAGAGAAAAAAAGGAAAATGCTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGG 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 ACAAGAGAAAAAAAGGAAAATGCTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGG 922
Query 1160 AAAAATTGAATTTTGGAAACAAGGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAA 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 AAAAATTGAATTTTGGAAACAAGGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAA 996
Query 1234 GCTGGATGTAGCTCAGTTGATGAAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 GCTGGATGTAGCTCAGTTGATGAAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGA 1070
Query 1308 TGCTCAGTATGAAATGGCAAGATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGC 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TGCTCAGTATGAAATGGCAAGATCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGC 1144
Query 1382 GAGGAATGGATGCAGTT 1398
|||||||||||||||||
Sbjct 1145 GAGGAATGGATGCAGTT 1161