Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000489556
Subject:
NM_008928.4
Aligned Length:
1042
Identities:
945
Gaps:
2

Alignment

Query    1  ATGGAGTCGCCCGCCTCGAGCCAGCCCGCCAGCATGCCCCAGTCCAAAGGAAAATCCAAGAGGAAGAAGGATCT  74
            |||||||||||||||.||||||.|||.||||||.||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||..|
Sbjct    1  ATGGAGTCGCCCGCCGCGAGCCCGCCGGCCAGCTTGCCTCAGACCAAAGGAAAATCCAAAAGGAAAAAGGACTT  74

Query   75  ACGGATATCCTGCATGTCCAAGCCACCCGCACCCAACCCCACACCCCCCCGGAACCTGGACTCCCGGACCTTCA  148
            |||||||||||||.|||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGGATATCCTGCGTGTCCAAGCCACCTGTGTCCAACCCCACACCCCCCCGGAACCTGGACTCCCGGACCTTCA  148

Query  149  TCACCATTGGAGACAGAAACTTTGAGGTGGAGGCTGATGACTTGGTGACCATCTCAGAACTGGGCCGTGGAGCC  222
            ||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  TCACTATCGGAGACAGAAACTTCGAAGTGGAGGCTGATGACTTGGTGACCATCTCAGAGCTGGGTCGTGGAGCC  222

Query  223  TATGGGGTGGTAGAGAAGGTGCGGCACGCCCAGAGCGGCACCATCATGGCCGTGAAGCGGATCCGGGCCACCGT  296
            |||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  TATGGGGTGGTAGAGAAAGTGCGGCATGCTCAGAGTGGTACCATCATGGCTGTCAAGCGCATCCGGGCCACAGT  296

Query  297  GAACTCACAGGAGCAGAAGCGGCTGCTCATGGACCTGGACATCAACATGCGCACGGTCGACTGTTTCTACACTG  370
            ||||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GAACACACAGGAGCAGAAACGTCTGCTTATGGACCTAGACATCAACATGCGCACGGTCGACTGCTTCTACACTG  370

Query  371  TCACCTTCTACGGGGCACTATTCAGAGAGGGAGACGTGTGGATCTGCATGGAGCTCATGGACACATCCTTGGAC  444
            ||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.
Sbjct  371  TCACCTTCTATGGTGCCCTCTTCAGAGAGGGGGATGTATGGATCTGCATGGAGCTCATGGACACTTCCCTGGAT  444

Query  445  AAGTTCTACCGGAAGGTGCTGGATAAAAACATGACAATTCCAGAGGACATCCTTGGGGAGATTGCTGTGTCTAT  518
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  AAGTTCTACCGGAAGGTGCTGGAGAAGAACATGAAAATTCCGGAAGACATCCTGGGGGAGATCGCTGTGTCTAT  518

Query  519  CGTGCGGGCCCTGGAGCATCTGCACAGCAAGCTGTCGGTGATCCACAGAGATGTGAAGCCCTCCAATGTCCTTA  592
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  CGTGCGGGCCCTGGAGCACCTGCATAGCAAGCTGTCTGTGATCCACAGAGATGTGAAGCCATCCAATGTCCTCA  592

Query  593  TCAACAAGGAGGGCCATGTGAAGATGTGTGACTTTGGCATCAGTGGCTACTTGGTGGACTCTGTGGCCAAGACG  666
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  593  TCAACAAGGAAGGGCATGTGAAGATGTGCGACTTTGGCATCAGTGGCTACCTGGTGGACTCTGTGGCAAAGACA  666

Query  667  ATGGATGCCGGCTGCAAGCCCTACATGGCCCCTGAGAGGATCAACCCAGAGCTGAACCAGAAGGGCTACAATGT  740
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGGATGCTGGCTGCAAGCCTTACATGGCCCCTGAGAGGATCAACCCTGAACTGAATCAGAAGGGCTACAATGT  740

Query  741  CAAGTCCGACGTCTGGAGCCTGGGCATCACCATGATTGAGATGGCCATCCTGCGGTTCCCTTACGAGTCCTGGG  814
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  CAAGTCTGATGTCTGGAGCCTCGGCATCACCATGATCGAGATGGCCATTCTGCGATTCCCTTATGAGTCTTGGG  814

Query  815  GGACCCCGTTCCAGCAGCTGAAGCAGGTGGTGGAGGAGCCGTCCCCCCAGCTCCCAGCCGACCGTTTCTCCCCC  888
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||..||||||||.
Sbjct  815  GCACACCGTTCCAGCAGCTGAAGCAGGTGGTGGAGGAGCCATCCCCACAGCTCCCAGCGGACCAGTTCTCCCCT  888

Query  889  GAGTTTGTGGACTTCACT-GCTCAGTGCCTGAGGAAGAACCCCGCAGAGCGTATGAGCTACCTGGAGCTGATGG  961
            |||||||||||||||||| || ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTTTGTGGACTTCACTAGC-CAGTGCCTAAGGAAGAACCCTGCAGAGCGCATGAGCTACCTGGAGCTGATGG  961

Query  962  AGCACCCCTTCTTCACCTTGCACAAAACCAAGAAGACGGACATTGCTGCCTTCGTGAAGGAGATCCTGGGAGAA  1035
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  962  AACACCCATTCTTCACCTTGCACAAAACTAAGAAGACAGACATTGCTGCCTTTGTGAAGGAGATCCTGGGAGAG  1035

Query 1036  GACTCA  1041
            ||.|||
Sbjct 1036  GATTCA  1041