Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489556
• Subject: XM_006533368.3
• Aligned Length: 1042
• Identities: 704
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGGAGTCGCCCGCCTCGAGCCAGCCCGCCAGCATGCCCCAGTCCAAAGGAAAATCCAAGAGGAAGAAGGATCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACGGATATCCTGCATGTCCAAGCCACCCGCACCCAACCCCACACCCCCCCGGAACCTGGACTCCCGGACCTTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCACCATTGGAGACAGAAACTTTGAGGTGGAGGCTGATGACTTGGTGACCATCTCAGAACTGGGCCGTGGAGCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TATGGGGTGGTAGAGAAGGTGCGGCACGCCCAGAGCGGCACCATCATGGCCGTGAAGCGGATCCGGGCCACCGT  296
                                                         |||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGGCTGTCAAGCGCATCCGGGCCACAGT  29

Query  297  GAACTCACAGGAGCAGAAGCGGCTGCTCATGGACCTGGACATCAACATGCGCACGGTCGACTGTTTCTACACTG  370
            ||||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   30  GAACACACAGGAGCAGAAACGTCTGCTTATGGACCTAGACATCAACATGCGCACGGTCGACTGCTTCTACACTG  103

Query  371  TCACCTTCTACGGGGCACTATTCAGAGAGGGAGACGTGTGGATCTGCATGGAGCTCATGGACACATCCTTGGAC  444
            ||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.
Sbjct  104  TCACCTTCTATGGTGCCCTCTTCAGAGAGGGGGATGTATGGATCTGCATGGAGCTCATGGACACTTCCCTGGAT  177

Query  445  AAGTTCTACCGGAAGGTGCTGGATAAAAACATGACAATTCCAGAGGACATCCTTGGGGAGATTGCTGTGTCTAT  518
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  178  AAGTTCTACCGGAAGGTGCTGGAGAAGAACATGAAAATTCCGGAAGACATCCTGGGGGAGATCGCTGTGTCTAT  251

Query  519  CGTGCGGGCCCTGGAGCATCTGCACAGCAAGCTGTCGGTGATCCACAGAGATGTGAAGCCCTCCAATGTCCTTA  592
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  252  CGTGCGGGCCCTGGAGCACCTGCATAGCAAGCTGTCTGTGATCCACAGAGATGTGAAGCCATCCAATGTCCTCA  325

Query  593  TCAACAAGGAGGGCCATGTGAAGATGTGTGACTTTGGCATCAGTGGCTACTTGGTGGACTCTGTGGCCAAGACG  666
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  326  TCAACAAGGAAGGGCATGTGAAGATGTGCGACTTTGGCATCAGTGGCTACCTGGTGGACTCTGTGGCAAAGACA  399

Query  667  ATGGATGCCGGCTGCAAGCCCTACATGGCCCCTGAGAGGATCAACCCAGAGCTGAACCAGAAGGGCTACAATGT  740
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  400  ATGGATGCTGGCTGCAAGCCTTACATGGCCCCTGAGAGGATCAACCCTGAACTGAATCAGAAGGGCTACAATGT  473

Query  741  CAAGTCCGACGTCTGGAGCCTGGGCATCACCATGATTGAGATGGCCATCCTGCGGTTCCCTTACGAGTCCTGGG  814
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  474  CAAGTCTGATGTCTGGAGCCTCGGCATCACCATGATCGAGATGGCCATTCTGCGATTCCCTTATGAGTCTTGGG  547

Query  815  GGACCCCGTTCCAGCAGCTGAAGCAGGTGGTGGAGGAGCCGTCCCCCCAGCTCCCAGCCGACCGTTTCTCCCCC  888
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||..||||||||.
Sbjct  548  GCACACCGTTCCAGCAGCTGAAGCAGGTGGTGGAGGAGCCATCCCCACAGCTCCCAGCGGACCAGTTCTCCCCT  621

Query  889  GAGTTTGTGGACTTCACT-GCTCAGTGCCTGAGGAAGAACCCCGCAGAGCGTATGAGCTACCTGGAGCTGATGG  961
            |||||||||||||||||| || ||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  GAGTTTGTGGACTTCACTAGC-CAGTGCCTAAGGAAGAACCCTGCAGAGCGCATGAGCTACCTGGAGCTGATGG  694

Query  962  AGCACCCCTTCTTCACCTTGCACAAAACCAAGAAGACGGACATTGCTGCCTTCGTGAAGGAGATCCTGGGAGAA  1035
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  695  AACACCCATTCTTCACCTTGCACAAAACTAAGAAGACAGACATTGCTGCCTTTGTGAAGGAGATCCTGGGAGAG  768

Query 1036  GACTCA  1041
            ||.|||
Sbjct  769  GATTCA  774