Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489572
- Subject:
- NM_022983.4
- Aligned Length:
- 1065
- Identities:
- 902
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCACATGGACTTTTTTTATAATAGGAGCAACACTGATACTGTCGATGACTG 74
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|..||.||.||
Sbjct 1 ATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCGCATGGACTTTTTCTACAACAGGAGCAACACAGACACAGCGGACGAGTG 74
Query 75 GACAGGAACAAAGCTTGTGATTGTTTTGTGTGTTGGGACGTTTTTCTGCCTGTTTATTTTTTTTTCTAATTCTC 148
||||||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 75 GACAGGGACAAAGCTTGTGATCGTCCTGTGCGTGGGGACGTTCTTCTGCCTCTTTATATTTTTTTCTAACTCCC 148
Query 149 TGGTCATCGCGGCAGTGATCAAAAACAGAAAATTTCATTTCCCCTTCTACTACCTGTTGGCTAATTTAGCTGCT 222
|||||||.||.||.|||||||.||||.|.||.||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 149 TGGTCATTGCTGCGGTGATCACAAACCGGAAGTTCCACTTTCCCTTCTACTACCTGCTGGCTAACTTAGCTGCT 222
Query 223 GCCGATTTCTTCGCTGGAATTGCCTATGTATTCCTGATGTTTAACACAGGCCCAGTTTCAAAAACTTTGACTGT 296
||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 223 GCGGATTTCTTCGCCGGAATCGCTTACGTGTTCCTGATGTTTAACACTGGCCCGGTGTCGAAAACGTTGACCGT 296
Query 297 CAACCGCTGGTTTCTCCGTCAGGGGCTTCTGGACAGTAGCTTGACTGCTTCCCTCACCAACTTGCTGGTTATCG 370
||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||.|||||||.|||||..||||.|||||||||||.|
Sbjct 297 CAACCGCTGGTTCCTCCGCCAGGGGCTCCTAGACACCAGCCTGACTGCCTCCCTGGCCAATTTGCTGGTTATTG 370
Query 371 CCGTGGAGAGGCACATGTCAATCATGAGGATGCGGGTCCATAGCAACCTGACCAAAAAGAGGGTGACACTGCTC 444
|.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 371 CTGTGGAAAGACACATGTCCATCATGAGGATGAGAGTCCACAGCAACTTGACCAAAAAGCGGGTGACGCTGCTC 444
Query 445 ATTTTGCTTGTCTGGGCCATCGCCATTTTTATGGGGGCGGTCCCCACACTGGGCTGGAATTGCCTCTGCAACAT 518
|||.||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCTGCTGGTGTGGGCCATCGCCATCTTCATGGGGGCCGTCCCCACGCTGGGATGGAATTGCCTCTGCAACAT 518
Query 519 CTCTGCCTGCTCTTCCCTGGCCCCCATTTACAGCAGGAGTTACCTTGTTTTCTGGACAGTGTCCAACCTCATGG 592
|||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 519 CTCGGCCTGCTCTTCTCTGGCTCCCATTTACAGTAGGAGTTACCTCATTTTCTGGACTGTGTCCAACCTCCTGG 592
Query 593 CCTTCCTCATCATGGTTGTGGTGTACCTGCGGATCTACGTGTACGTCAAGAGGAAAACCAACGTCTTGTCTCCG 666
|||||.||||||||||.|.|||.|||.|.||.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 593 CCTTCTTCATCATGGTGGCGGTATACGTACGCATCTACATGTATGTTAAAAGGAAAACCAACGTCTTATCTCCA 666
Query 667 CATACAAGTGGGTCCATCAGCCGCCGGAGGACACCCATGAAGCTAATGAAGACGGTGATGACTGTCTTAGGGGC 740
||.||.|||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CACACCAGTGGCTCCATCAGCCGCCGGAGGGCTCCCATGAAGCTAATGAAGACAGTGATGACCGTCTTAGGCGC 740
Query 741 GTTTGTGGTATGCTGGACCCCGGGCCTGGTGGTTCTGCTCCTCGACGGCCTGAACTGCAGGCAGTGTGGCGTGC 814
.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 741 CTTCGTGGTGTGCTGGACCCCGGGTCTGGTGGTTCTGCTGCTGGACGGCCTGAACTGCAAGCAGTGTAACGTGC 814
Query 815 AGCATGTGAAAAGGTGGTTCCTGCTGCTGGCGCTGCTCAACTCCGTCGTGAACCCCATCATCTACTCCTACAAG 888
|.||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 AACACGTGAAGCGCTGGTTCCTGCTGCTCGCACTGCTCAACTCCGTCATGAACCCCATCATCTACTCGTACAAG 888
Query 889 GACGAGGACATGTATGGCACCATGAAGAAGATGATCTGCTGCTTCTCT-CAGGAGA-----ACCCAGAGAGGCG 956
||||||||||||||...|||||||..||||||||||||||| |.|.|| |||||.| ||| ||||||||
Sbjct 889 GACGAGGACATGTACAACACCATGCGGAAGATGATCTGCTG-TGCCCTGCAGGACAGCAATACC--GAGAGGCG 959
Query 957 TCCCTCTCGCATCCCCTCCACAGTCCTCAGCAGGAGTGACACAGGCAGCCAGTACATAGAGGATAGTATTAGCC 1030
.|||||.||||.|||||||||..|||.|||||||||.||.||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||||
Sbjct 960 CCCCTCCCGCAACCCCTCCACCATCCACAGCAGGAGCGAGACGGGCAGCCAGTACCTGGAGGACAGCATCAGCC 1033
Query 1031 AAGGTGCAGTCTGCAATAAAAGCACTTCC 1059
|.||..|.||.||||||||||.|...|||
Sbjct 1034 AGGGCCCGGTGTGCAATAAAAACGGCTCC 1062