Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489576
• Subject: NM_007692.6
• Aligned Length: 1186
• Identities: 1011
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCGAGGCGACAGCTGTGGCCGGAAGCGGGGCTGTTGGCGGCTGCCTGGCCAAAGACGGCTTGCAGCA  74
            ||||||||.||.|.|||||..||.|.||||.|.||||||||.||||||.|||||.||||.|||||.||||||.|
Sbjct    1  ATGGCGGCAGACGGGACAGGGGTAGTCGGAGGAGGGGCTGTCGGCGGCGGCCTGCCCAAGGACGGTTTGCAGGA  74

Query   75  GTCTAAGTGCCCGGACACTACCCCAAAACGGCGGCGCGCCTCGTCGCTGTCGCGTGACGCCGAGCGCCGAGCCT  148
            ..||||||||||.||..|.|.|||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||..||||||||||||
Sbjct   75  TGCTAAGTGCCCAGAGCCAATCCCCAATCGGCGGCGCGCTTCCTCGCTGTCCCGTGACGCGCAGCGCCGAGCCT  148

Query  149  ACCAATGGTGCCGGGAGTACTTGGGCGGGGCCTGGCGCCGAGTGCAGCCCGAGGAGCTGAGGGTTTACCCCGTG  222
            |.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||.||||..||||||
Sbjct  149  ATCAGTGGTGCCGGGAGTACCTGGGCGGGGCCTGGCGCCGAGCGCGGCCGGAGGAGCTGAGCGTTTGTCCCGTG  222

Query  223  AGCGGAGGCCTCAGCAACCTGCTCTTCCGCTGCTCGCTCCCGGACCACCTGCCCAGCGTTGGCGAGGAGCCCCG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||.|.|||||.||.||||.|||||||||
Sbjct  223  AGCGGAGGCCTCAGCAACCTGCTCTTCCGATGCTCACTACCGAACCACGTACCCAGTGTGGGCGGGGAGCCCCG  296

Query  297  GGAGGTGCTTCTGCGGCTGTACGGAGCCATCTTGCAGGGCGTGGACTCCCTGGTGCTAGAAAGCGTGATGTTCG  370
            |||||||||.||.||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||.||||..||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGGTGCTGCTACGACTCTACGGGGCCATCCTGCAGGGTGTAGACTCCTTGGTATTAGAAAGCGTGATGTTCG  370

Query  371  CCATACTTGCGGAGCGGTCGCTGGGGCCCCAGCTGTACGGAGTCTTCCCAGAGGGCCGGCTGGAACAGTACATC  444
            ||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct  371  CCATTCTCGCAGAGCGGTCTCTAGGGCCCCAGCTTTACGGAGTGTTTCCAGAGGGCCGCTTGGAACAGTACCTC  444

Query  445  CCAAGTCGGCCATTGAAAACTCAAGAGCTTCGAGAGCCAGTGTTGTCAGCAGCCATTGCCACGAAGATGGCGCA  518
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||||.||||||.|.
Sbjct  445  CCAAGCCGGCCGTTGAAAACTCAAGAGCTCCGGGACCCAGTGTTGTCGGGAGCCATTGCAACGAGGATGGCCCG  518

Query  519  ATTTCATGGCATGGAGATGCCTTTCACCAAGGAGCCCCACTGGCTGTTTGGGACCATGGAGCGGTACCTAAAAC  592
            .||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  TTTCCATGGTATGGAGATGCCCTTCACTAAGGAGCCCCGATGGTTGTTTGGGACCATGGAGCGGTACCTGAAGC  592

Query  593  AGATCCAGGACCTGCCCCCAACTGGCCTCCCTGAGATGAACCTGCTGGAGATGTACAGCCTGAAGGATGAGATG  666
            |||||||||||.||||..|.||..||||.||..|||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  593  AGATCCAGGACTTGCCTTCCACCAGCCTTCCCCAGATGAACCTGGTAGAGATGTACAGCCTCAAGGACGAGATG  666

Query  667  GGCAACCTCAGGAAGTTACTAGAGTCTACCCCATCGCCAGTCGTCTTCTGCCACAATGACATCCAGGAAGGGAA  740
            ..||.||||||||||||||||||...||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AACAGCCTCAGGAAGTTACTAGACGATACCCCGTCACCAGTGGTCTTCTGCCACAATGACATCCAGGAAGGAAA  740

Query  741  CATCTTGCTGCTCTCAGAGCCAGAAAATGCTGACAGCCTCATGCTGGTGGACTTCGAGTACAGCAGTTATAACT  814
            |||||||.||||.|||||||||||.|.||.|||.|.|||||||.||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CATCTTGTTGCTTTCAGAGCCAGACAGTGATGATAACCTCATGTTGGTTGATTTTGAGTACAGTAGTTATAACT  814

Query  815  ATAGGGGCTTTGACATTGGGAACCATTTTTGTGAGTGGGTTTATGATTATACTCACGAGGAATGGCCTTTCTAC  888
            |.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  ACAGGGGCTTTGACATTGGGAATCATTTTTGTGAGTGGGTTTATGATTATACTTATGAAGAATGGCCTTTCTAC  888

Query  889  AAAGCAAGGCCCACAGACTACCCCACTCAAGAACAGCAGTTGCATTTTATTCGTCATTACCTGGCAGAGGCAAA  962
            ||||||||.|||||.||||||||||||..||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||||...|
Sbjct  889  AAAGCAAGACCCACGGACTACCCCACTAGAGAACAGCAGCTCCATTTTATTCGCCATTATCTGGCAGAGGTTCA  962

Query  963  GAAAGGTGAGACCCTCTCCCAAGAGGAGCAGAGAAAACTGGAAGAAGATTTGCTGGTAGAAGTCAGTCGGTATG  1036
            |||.|||||||.|||||||.|||||||.||||..||||.|||||||||.||||||.||||..||||||||||..
Sbjct  963  GAAGGGTGAGATCCTCTCCGAAGAGGAACAGAAGAAACGGGAAGAAGAATTGCTGCTAGAGATCAGTCGGTACT  1036

Query 1037  CTCTGGCATCCCATTTCTTCTGGGGTCTGTGGTCCATCCTCCAGGCATCCATGTCCACCATAGAATTTGGTTAC  1110
            |.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 1037  CCCTGGCATCTCACTTTTTCTGGGGTCTGTGGTCCACCCTGCAGGCTTCGATGTCCACTATAGAGTTCGGCTAC  1110

Query 1111  TTGGACTATGCCCAGTCTCGGTTCCAGTTCTACTTCCAGCAGAAGGGGCAGCTGACCAGTGTCCACTCC-TCAT  1183
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||| |||   || ||||
Sbjct 1111  TTGGAGTATGCCCAATCTCGGTTCCAGTTCTACTTCCAGCAGAAGGGCCAGCTGACGAGT-TCC---CCATCAT  1180

Query 1184  CC  1185
            ||
Sbjct 1181  CC  1182