Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489584
• Subject: XM_006713451.3
• Aligned Length: 1738
• Identities: 1339
• Gaps: 394

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCATGCCTCTTGTCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCCTGCCTCTTGTCA  74

Query   75  CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG  148

Query  149  ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT  222

Query  223  TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT  296

Query  297  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA  370

Query  371  AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA  444

Query  445  ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC  518

Query  519  TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  592

Query  593  TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA  666

Query  667  GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA  740

Query  741  TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC  814

Query  815  AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCAAGAGAGGAGAACGGATTCGCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA  888

Query  889  AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA  962

Query  963  GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT  1036

Query 1037  TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT  1110

Query 1111  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGATCCTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGATCCTCA  1184

Query 1185  TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG  1258

Query 1259  CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG  1332

Query 1333  GTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGAAATA  1406
                  ||.|          |||         ||.||                                     
Sbjct 1333  ------ATCG----------ATC---------TGGAA-------------------------------------  1344

Query 1407  TAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAGCTAA  1480
                                                                                      
Sbjct 1345  --------------------------------------------------------------------------  1344

Query 1481  ATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA  1554
                                                                                      
Sbjct 1345  --------------------------------------------------------------------------  1344

Query 1555  ATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA  1628
                                                                                      
Sbjct 1345  --------------------------------------------------------------------------  1344

Query 1629  CCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC  1702
                                                                                      
Sbjct 1345  --------------------------------------------------------------------------  1344

Query 1703  ACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCTG  1738
                                                
Sbjct 1345  ------------------------------------  1344