Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489587
• Subject: NM_207655.2
• Aligned Length: 3650
• Identities: 3093
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGCGACCCTCCGGGACGGCCGGGGCAGCGCTCCTGGCGCTGCTGGCTGCGCTCTGCCCGGCGAGTCGGGCTCT  74
            |||||||||||.|||||.||..|..|..|.||.||||.|.|||||.|.|||||||||.|.||..||.||||..|
Sbjct    1  ATGCGACCCTCAGGGACCGCGAGAACCACACTGCTGGTGTTGCTGACCGCGCTCTGCGCCGCAGGTGGGGCGTT  74

Query   75  GGAGGAAAAGAAAGTTTGCCAAGGCACGAGTAACAAGCTCACGCAGTTGGGCACTTTTGAAGATCATTTTCTCA  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||.||..||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct   75  GGAGGAAAAGAAAGTCTGCCAAGGCACAAGTAACAGGCTCACCCAACTGGGCACTTTTGAAGACCACTTTCTGA  148

Query  149  GCCTCCAGAGGATGTTCAATAACTGTGAGGTGGTCCTTGGGAATTTGGAAATTACCTATGTGCAGAGGAATTAT  222
            ||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  GCCTGCAGAGGATGTACAACAACTGTGAAGTGGTCCTTGGGAACTTGGAAATTACCTATGTGCAAAGGAATTAC  222

Query  223  GATCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCTGGTTATGTCCTCATTGCCCTCAACACAGTGGAGCGAAT  296
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  GACCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCCGGCTATGTCCTCATTGCCCTCAACACCGTGGAGAGAAT  296

Query  297  TCCTTTGGAAAACCTGCAGATCATCAGAGGAAATATGTAC--TACGAAAATTCCTATGCCTTAGCAGTCTTATC  368
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||  |||..|  ||.|||||..|||||||||||||..||.|.||
Sbjct  297  CCCTTTGGAGAACCTGCAGATCATCAGGGGAA--ATGCTCTTTATGAAAACACCTATGCCTTAGCCATCCTGTC  368

Query  369  TAACTATGATGCAAATAAAACCGGACTGAAGGAGCTGCCCATGAGAAATTTACAGGAAATCCTGCATGGCGCCG  442
            .|||||||...||||.|.|||.||.||.|.|||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||..|||.||.|
Sbjct  369  CAACTATGGGACAAACAGAACTGGGCTTAGGGAACTGCCCATGCGGAACTTACAGGAAATCCTGATTGGTGCTG  442

Query  443  TGCGGTTCAGCAACAACCCTGCCCTGTGCAACGTGGAGAGCATCCAGTGGCGGGACATAGTCAGCA----GTGA  512
            ||||.||||||||||||||...|||.|||||..||||.|..|||||||||.|||||||.|||  ||    ||  
Sbjct  443  TGCGATTCAGCAACAACCCCATCCTCTGCAATATGGATACTATCCAGTGGAGGGACATCGTC--CAAAACGT--  512

Query  513  CTTTCTCAGCAACATGTCGATGGACTTCCAGAACCACCTGGGCAGCTGCCAAAAGTGTGATCCAAGCTGTCCCA  586
            ||||.|.|||||||||||.||||||||.||||.|||.|.|.||||.||||..||.|||||||||||||||||||
Sbjct  513  CTTTATGAGCAACATGTCAATGGACTTACAGAGCCATCCGAGCAGTTGCCCCAAATGTGATCCAAGCTGTCCCA  586

Query  587  ATGGGAGCTGCTGGGGTGCAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAACTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAGTGCTCC  660
            ||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  587  ATGGAAGCTGCTGGGGAGGAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAATTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAATGTTCC  660

Query  661  GGGCGCTGCCGTGGCAAGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAGTGTGCTGCAGGCTGCACAGGCCCCCGGGA  734
            ...|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  661  CATCGCTGTCGTGGCAGGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAATGTGCTGCGGGGTGTACAGGGCCCCGAGA  734

Query  735  GAGCGACTGCCTGGTCTGCCGCAAATTCCGAGACGAAGCCACGTGCAAGGACACCTGCCCCCCACTCATGCTCT  808
            |||.|||||.||||||||||..||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  735  GAGTGACTGTCTGGTCTGCCAAAAGTTCCAAGATGAGGCCACATGCAAAGACACCTGCCCACCACTCATGCTGT  808

Query  809  ACAACCCCACCACGTACCAGATGGATGTGAACCCCGAGGGCAAATACAGCTTTGGTGCCACCTGCGTGAAGAAG  882
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  809  ACAACCCCACCACCTATCAGATGGATGTCAACCCTGAAGGGAAGTACAGCTTTGGTGCCACCTGTGTGAAGAAG  882

Query  883  TGTCCCCGTAATTATGTGGTGACAGATCACGGCTCGTGCGTCCGAGCCTGTGGGGCCGACAGCTATGAGATGGA  956
            ||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|||..|||.||..||||
Sbjct  883  TGCCCCCGAAACTACGTGGTGACAGATCATGGCTCATGTGTCCGAGCCTGTGGGCCTGACTACTACGAAGTGGA  956

Query  957  GGAAGACGGCGTCCGCAAGTGTAAGAAGTGCGAAGGGCCTTGCCGCAAAGTGTGTAACGGAATAGGTATTGGTG  1030
            .|||||.|||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  957  AGAAGATGGCATCCGCAAGTGTAAAAAATGTGATGGGCCCTGTCGCAAAGTTTGTAATGGCATAGGCATTGGTG  1030

Query 1031  AATTTAAAGACTCACTCTCCATAAATGCTACGAATATTAAACACTTCAAAAACTGCACCTCCATCAGTGGCGAT  1104
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||..|||||||.||.||.
Sbjct 1031  AATTTAAAGACACACTCTCCATAAATGCTACAAACATCAAACACTTCAAATACTGCACTGCCATCAGCGGGGAC  1104

Query 1105  CTCCACATCCTGCCGGTGGCATTTAGGGGTGACTCCTTCACACATACTCCTCCTCTGGATCCACAGGAACTGGA  1178
            ||.|||||||||||.|||||.||||.|||.||.||.|||||.|..|||||||||||.||.||||..|||||.||
Sbjct 1105  CTTCACATCCTGCCAGTGGCCTTTAAGGGGGATTCTTTCACGCGCACTCCTCCTCTAGACCCACGAGAACTAGA  1178

Query 1179  TATTCTGAAAACCGTAAAGGAAATCACAGGGTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGAAAACAGGACGGACCTCC  1252
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1179  AATTCTAAAAACCGTAAAGGAAATAACAGGCTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGATAACTGGACTGACCTCC  1252

Query 1253  ATGCCTTTGAGAACCTAGAAATCATACGCGGCAGGACCAAGCAACATGGTCAGTTTTCTCTTGCAGTCGTCAGC  1326
            ||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||..||
Sbjct 1253  ATGCTTTCGAGAACCTAGAAATAATACGTGGCAGAACAAAGCAACATGGTCAGTTTTCTTTGGCGGTCGTTGGC  1326

Query 1327  CTGAACATAACATCCTTGGGATTACGCTCCCTCAAGGAGATAAGTGATGGAGATGTGATAATTTCAGGAAACAA  1400
            ||||||||.|||||..||||..|.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||..
Sbjct 1327  CTGAACATCACATCACTGGGGCTGCGTTCCCTCAAGGAGATCAGTGATGGGGATGTGATCATTTCTGGAAACCG  1400

Query 1401  AAATTTGTGCTATGCAAATACAATAAACTGGAAAAAACTGTTTGGGACCTCCGGTCAGAAAACCAAAATTATAA  1474
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||..||..|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1401  AAATTTGTGCTACGCAAACACAATAAACTGGAAAAAACTCTTCGGGACACCCAATCAGAAAACCAAAATCATGA  1474

Query 1475  GCAACAGAGGTGAAAACAG-CTGCAAGGCCACAGG----CCAGGTCTGCCATGCCTTGTGCTCCCCCGAGGGCT  1543
            .||||||||.|||.|| || ||||||||||    |    |||.||||||.||.|.||.||||||.|.||.||||
Sbjct 1475  ACAACAGAGCTGAGAA-AGACTGCAAGGCC----GTGAACCACGTCTGCAATCCTTTATGCTCCTCGGAAGGCT  1543

Query 1544  GCTGGGGCCCGGAGCCCAGGGACTGCGTCTCTTGCCGGAATGTCAGCCGAGGCAGGGAATGCGTGGACAAGTGC  1617
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||||.|||.||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1544  GCTGGGGCCCTGAGCCCAGGGACTGTGTCTCCTGCCAGAATGTGAGCAGAGGCAGGGAGTGCGTGGAGAAATGC  1617

Query 1618  AACCTTCTGGAGGGTGAGCCAAGGGAGTTTGTGGAGAACTCTGAGTGCATACAGTGCCACCCAGAGTGCCTGCC  1691
            |||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1618  AACATCCTGGAGGGGGAACCAAGGGAGTTTGTGGAAAATTCTGAATGCATCCAGTGCCATCCAGAATGTCTGCC  1691

Query 1692  TCAGGCCATGAACATCACCTGCACAGGACGGGGACCAGACAACTGTATCCAGTGTGCCCACTACATTGACGGCC  1765
            .||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1692  CCAGGCCATGAACATCACCTGTACAGGCAGGGGACCAGACAACTGCATCCAGTGTGCCCACTACATTGATGGCC  1765

Query 1766  CCCACTGCGTCAAGACCTGCCCGGCAGGAGTCATGGGAGAAAACAACACCCTGGTCTGGAAGTACGCAGACGCC  1839
            |.|||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1766  CACACTGTGTCAAGACCTGCCCAGCTGGCATCATGGGAGAGAACAACACTCTGGTCTGGAAGTATGCAGATGCC  1839

Query 1840  GGCCATGTGTGCCACCTGTGCCATCCAAACTGCACCTACGGATGCACTGGGCCAGGTCTTGAAGGCTGT-----  1908
            ....||||.||||||||.|||||..|.|||||.|||||.|||||..||||||||||||||.||||.|||     
Sbjct 1840  AATAATGTCTGCCACCTATGCCACGCCAACTGTACCTATGGATGTGCTGGGCCAGGTCTTCAAGGATGTGAAGT  1913

Query 1909  ----CCAACGAATGGGCCTAAGATCCCGTCCATCGCCACTGGGATGGTGGGGGCCCTCCTCTTGCTGCTGGTGG  1978
                |||.|   ||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|.|||||||||..|..||||||
Sbjct 1914  GTGGCCATC---TGGGCCAAAGATACCATCTATTGCCACTGGGATTGTGGGTGGCCTCCTCTTCATAGTGGTGG  1984

Query 1979  TGGCCCTGGGGATCGGCCTCTTCATGCGAAGGCGCCACATCGTTCGGAAGCGCACGCTGCGGAGGCTGCTGCAG  2052
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||..|.|||||.||.
Sbjct 1985  TGGCCCTTGGGATTGGCCTATTCATGCGAAGACGTCACATTGTTCGAAAGCGTACACTACGCCGCCTGCTTCAA  2058

Query 2053  GAGAGGGAGCTTGTGGAGCCTCTTACACCCAGTGGAGAAGCTCCCAACCAAGCTCTCTTGAGGATCTTGAAGGA  2126
            |||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.|||||||||.||.|||||
Sbjct 2059  GAGAGAGAGCTCGTGGAACCTCTCACACCCAGCGGAGAAGCTCCAAACCAAGCCCACTTGAGGATATTAAAGGA  2132

Query 2127  AACTGAATTCAAAAAGATCAAAGTGCTGGGCTCCGGTGCGTTCGGCACGGTGTATAAGGGACTCTGGATCCCAG  2200
            |||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2133  AACAGAATTCAAAAAGATCAAAGTTCTGGGTTCGGGAGCATTTGGCACAGTGTATAAGGGTCTCTGGATCCCAG  2206

Query 2201  AAGGTGAGAAAGTTAAAATTCCCGTCGCTATCAAGGAATTAAGAGAAGCAACATCTCCGAAAGCCAACAAGGAA  2274
            |||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2207  AAGGTGAGAAAGTAAAAATCCCGGTGGCCATCAAGGAGTTAAGAGAAGCCACATCTCCAAAAGCCAACAAAGAA  2280

Query 2275  ATCCTCGATGAAGCCTACGTGATGGCCAGCGTGGACAACCCCCACGTGTGCCGCCTGCTGGGCATCTGCCTCAC  2348
            |||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2281  ATCCTTGACGAAGCCTATGTGATGGCTAGTGTGGACAACCCTCATGTATGCCGCCTCCTGGGCATCTGTCTGAC  2354

Query 2349  CTCCACCGTGCAACTCATCACGCAGCTCATGCCCTTCGGCTGCCTCCTGGACTATGTCCGGGAACACAAAGACA  2422
            ||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2355  CTCCACTGTCCAGCTCATTACACAGCTCATGCCCTACGGTTGCCTCCTGGACTACGTCCGAGAACACAAGGACA  2428

Query 2423  ATATTGGCTCCCAGTACCTGCTCAACTGGTGTGTGCAGATCGCAAAGGGCATGAACTACTTGGAGGACCGTCGC  2496
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||.||.
Sbjct 2429  ACATTGGCTCCCAGTACCTCCTCAACTGGTGTGTGCAGATTGCAAAGGGCATGAACTACCTGGAAGATCGGCGT  2502

Query 2497  TTGGTGCACCGCGACCTGGCAGCCAGGAACGTACTGGTGAAAACACCGCAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG  2570
            |||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503  TTGGTGCACCGTGACTTGGCAGCCAGGAATGTACTGGTGAAGACACCACAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG  2576

Query 2571  GCTGGCCAAACTGCTGGGTGCGGAAGAGAAAGAATACCATGCAGAAGGAGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG  2644
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577  GCTGGCCAAACTGCTTGGTGCTGAAGAGAAAGAATATCATGCCGAGGGGGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG  2650

Query 2645  CATTGGAATCAATTTTACACAGAATCTATACCCACCAGAGTGATGTCTGGAGCTACGGGGTGACCGTTTGGGAG  2718
            |.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 2651  CTTTGGAATCAATTTTACACCGAATTTATACACACCAAAGTGATGTCTGGAGCTATGGTGTCACTGTGTGGGAA  2724

Query 2719  TTGATGACCTTTGGATCCAAGCCATATGACGGAATCCCTGCCAGCGAGATCTCCTCCATCCTGGAGAAAGGAGA  2792
            .|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2725  CTGATGACCTTTGGGTCCAAGCCTTATGATGGAATCCCAGCAAGTGACATCTCATCCATCCTAGAGAAAGGAGA  2798

Query 2793  ACGCCTCCCTCAGCCACCCATATGTACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGACGCAG  2866
            .|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2799  GCGCCTTCCACAGCCACCTATCTGCACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGATGCTG  2872

Query 2867  ATAGTCGCCCAAAGTTCCGTGAGTTGATCATCGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCCCAGCGCTACCTTGTC  2940
            ||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2873  ATAGCCGCCCAAAGTTCCGAGAGTTGATTCTTGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCACAGCGCTACCTTGTT  2946

Query 2941  ATTCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGTCCTACAGACTCCAACTTCTACCGTGCCCTGATGGATGAAGA  3014
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2947  ATCCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGCCCTACAGACTCCAACTTTTACCGAGCCCTGATGGATGAAGA  3020

Query 3015  AGACATGGACGACGTGGTGGATGCCGACGAGTACCTCATCCCACAGCAGGGCTTCTTCAGCAGCCCCTCCACGT  3088
            .||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 3021  GGACATGGAGGATGTAGTTGATGCTGATGAGTATCTTATCCCACAGCAAGGCTTCTTCAACAGCCCGTCCACGT  3094

Query 3089  CACGGACTCCCCTCCTGAGCTCTCTGAGTGCAACCAGCAACAATTCCACCGTGGCTTGCATTGATAGAAATGGG  3162
            |..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 3095  CGAGGACTCCCCTCTTGAGTTCTCTGAGTGCAACTAGCAACAATTCCACTGTGGCTTGCATTAATAGAAATGGG  3168

Query 3163  CTGCAAAGCTGTCCCATCAAGGAAGACAGCTTCTTGCAGCGATACAGCTCAGACCCCACAGGCGCCTTGACTGA  3236
                  |||||.|...||||.||||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.||
Sbjct 3169  ------AGCTGCCGTGTCAAAGAAGACGCCTTCTTGCAGCGGTACAGCTCCGACCCCACAGGTGCTGTAACAGA  3236

Query 3237  GGACAGCATAGACGACACCTTCCTCCCAGTGCCTGAATACATAAACCAGTCCGTTCCCAAAAGGCCCGCTGGCT  3310
            |||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||..|||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 3237  GGACAACATAGATGACGCATTCCTCCCTGTACCTGAATATGTAAACCAATCTGTTCCCAAGAGGCCAGCAGGCT  3310

Query 3311  CTGTGCAGAATCCTGTCTATCACAATCAGCCTCTGAACCCCGCGCCCAGCAGAGACCCACACTACCAGGACCCC  3384
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||..|.|||||||..||.||.||..|.|||
Sbjct 3311  CTGTGCAGAACCCTGTCTATCACAATCAGCCCCTGCATCCAGCTCCTGGAAGAGACCTGCATTATCAAAATCCC  3384

Query 3385  CACAGCACTGCAGTGGGCAACCCCGAGTATCTCAACACTGTCCAGCCCACCTGTGTCAACAGCACATTCGACAG  3458
            |||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||.|||..||....||..||||
Sbjct 3385  CACAGCAATGCAGTGGGCAACCCTGAGTATCTCAACACTGCCCAGCCTACCTGTCTCAGTAGTGGGTTTAACAG  3458

Query 3459  CCCTGCCCACTGGGCCCAGAAAGGCAGCCACCAAATTAGCCTGGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTTC  3532
            ||||||.|.||||..||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3459  CCCTGCACTCTGGATCCAGAAAGGCAGTCACCAAATGAGCCTAGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTCC  3532

Query 3533  CCAAGGAAGCCAAGCCAAATGGCATCTTTAAGGGCTCCACAGCTGAAAATGCAGAATACCTAAGGGTCGCGCCA  3606
            ||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.
Sbjct 3533  CCAAGGAAACCAAGCCAAATGGCATATTTAAGGGCCCCACAGCTGAAAATGCAGAGTACCTACGGGTGGCACCT  3606

Query 3607  CAAAGCAGTGAATTTATTGGAGCA  3630
            |.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 3607  CCAAGCAGTGAGTTTATTGGAGCA  3630