Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489641
• Subject: NM_212452.1
• Aligned Length: 2278
• Identities: 1957
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT  74
            ||||||||||||.|..|||||||||.||||||.|||.|||||||||||||..|||..||..|||.|||||||||
Sbjct    1  ATGACATCTGGTCCATTCTTCTTCTGCATCTTCATTATTGGAAAATATTTCACTCTCGGAAGTGCACAGGATGT  74

Query   75  CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG  148
            ||..||..||||.||||..|||||||||||||||||.|..|.||||.||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CAGTTGTCCCCTCGGCTCCTTCCCCTGTGGGAACATGAGCAGGTGCCTGCCTCAGCTGCTTCACTGCAATGGTG  148

Query  149  TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA  222
            ||||||||||||||||.|..||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||
Sbjct  149  TGGACGACTGCGGGAACCGAGCTGATGAGGACCACTGCGGAGACAACAATGGGTGGTCTCTGCAACTGGACAAA  222

Query  223  TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATA--TCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGT  294
            ||||||||.|.||||||.|||.||.||| |||.||  ||| ||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.
Sbjct  223  TATTTTGCTAATTACTATAAACTGGCTT-CCACTAACTCC-TTTGAGGCAGAAACTTCCGAATGCTTGGTTGGC  294

Query  295  TCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATC  368
            ||||||||..||||.|||.|.||||.||.|||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct  295  TCTGTGCCCATGCATTGTTTGTGCCGAGATCTAGAACTTGACTGTGATGAAGCCAATTTACGAGCTGTCCCATC  368

Query  369  GGTTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGA  442
            .||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||.|||||..|..||||||.||
Sbjct  369  AGTTTCTTCCAATGTGACTGTAATGTCCCTGCAGAGGAACTTCATAAGAACACTCCCTCCCAACGGCTTCAGGA  442

Query  443  ATTATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACA-TCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGG  515
            |.||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||.|||| || |||.|...|.|||.|||.||||||||
Sbjct  443  AGTACCATGAGCTGCAGAAGCTGTGCCTGCAAAACAATAGGATT-CACTCCGTGAGCGTCTCTGCCTTCAGAGG  515

Query  516  ACTGAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATC  589
            ||||...|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  516  ACTGCGCAGCCTCACTAAACTGTACCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTAAAGCCAGGAGTTTTTGAAGATC  589

Query  590  TTCACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTA  663
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct  590  TCCACAGACTGGAATGGCTGATAATTGAAGACAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACTCACATTTTACGGACTA  663

Query  664  AATTCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACAT  737
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  664  AATTCTCTTATTCTCTTAGTGCTGATGAATAATGCCCTCACCCGTTTGCCTGACAAACCCCTCTGTCAGCACAT  737

Query  738  GCCAAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA  811
            |||..|.||.||.|||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GCCCCGCCTGCACTGGCTGGACTTTGAAGGCAACCGTATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCA  811

Query  812  GTAATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAG  885
            .|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.||.|.|||.|||..||||||
Sbjct  812  ATAATTTAACTGTTTTGGTAATGAGGAAGAACAAAATCAATTACTTAAATGAACATGCATTTACACACCTCCAG  885

Query  886  AAACTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGA  959
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  AAACTAGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGAACATATTTAAGGATCTGAAGGA  959

Query  960  GCTGTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAAC  1033
            ||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  960  GCTGTCGCAATTGAATATTTCTTATAACCCAATCCAGAAAATTGAAGTAAATCAATTCGATTGTCTTGCCAAAC  1033

Query 1034  TCAAGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTC  1107
            ||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1034  TCAAGTCTCTCAGCCTTGAAGGAATAGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCGCTCATAAATCTC  1107

Query 1108  TCTCACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGA  1181
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1108  TCTCACATCTATTTTAAGAAATTTCAGTACTGTGGATACGCACCACATGTGCGCAGCTGTAAGCCCAACACGGA  1181

Query 1182  TGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTA  1255
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1182  TGGGATTTCATCTCTAGAGAACCTCTTGGCAAGCATCATCCAGAGAGTCTTTGTCTGGGTTGTATCTGCCATTA  1255

Query 1256  CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCA  1329
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1256  CCTGCTTTGGAAACATTTTTGTTATTTGTATGCGACCATACATCAGATCTGAGAACAAGCTGCATGCCATGTCG  1329

Query 1330  ATCATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTT  1403
            ||||||||||||||||||||.||||||.|||||||..|.|||.||||.|||||.||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 1330  ATCATTTCTCTCTGCTGTGCTGACTGCCTAATGGGGGTGTATCTATTTGTGATTGGTGCCTTTGACCTCAAGTT  1403

Query 1404  TCGTGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCA  1477
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||..||||||||||.|..|.||.||.|||||||
Sbjct 1404  TCGGGGAGAGTACAATAAGCACGCACAGCCGTGGATGGAGAGTGTTCATTGTCAGTTCATGGGGTCGTTGGCCA  1477

Query 1478  TTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCT  1551
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1478  TTCTGTCCACAGAAGTATCCGTTTTACTTTTAACATTTCTGACATTGGAAAAGTACATCTGCATTGTGTATCCT  1551

Query 1552  TTTAGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGT  1625
            |||.|.|||.|.||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1552  TTTCGGTGTTTAAGGCCTCGAAAATGCAGAACAATCACGGTTCTGATTTTCATTTGGATTATTGGGTTTATAGT  1625

Query 1626  GGCTTTCATTCCA-TTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTT  1698
            ||||||...|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1626  GGCTTTTGCTCCACTTG-GCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTTCCTCTT  1698

Query 1699  CATTCAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGC  1772
            |||||||||||.||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||..||
Sbjct 1699  CATTCAGAAGACACGGGAAGTACTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGTAATTTTTCTTGGTATTAACCTGGTGGC  1772

Query 1773  ATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAA  1846
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||.||||||.|||.||||
Sbjct 1773  ATTTATCATCATTGTGTTCTCCTATGGAAGCATGTTTTACAGTGTTCATCAAAGCTCCGTAACAGTAACCGAAA  1846

Query 1847  TACGGAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGC  1920
            |||.|||.|||||.||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||..|.|||
Sbjct 1847  TACAGAAGCAAGTGAAGAAGGAGGTGGTTCTCGCCAAACGCTTTTTCTTTATCGTTTTCACCGACGCGCTGTGC  1920

Query 1921  TGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGT  1994
            |||||.|||||.||..||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|.||.|||||||||||
Sbjct 1921  TGGATTCCCATCTTCATACTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTGGAAATACCAGATTCTATTACCTCTTGGGT  1994

Query 1995  AGTGATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAG  2068
            .|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||..|||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1995  GGTGATTTTTATTCTGCCTATCAACAGTGCTTTGAACCCAATTATCTACACGTTGACCACTAGACCTTTCAAGG  2068

Query 2069  AAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAG---GTCAGAAAACATAT  2139
            |||||||.||||...|.|||.|.||||||||||||||||..|||.|.|||||.||||   .||||||..|||||
Sbjct 2069  AAATGATCCATCAACTCTGGCACAACTACAGACAAAGAAGGTCTGTTGACAGGAAAGAGACTCAGAAGGCATAT  2142

Query 2140  GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTT  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|..|||.|||.||||||||.|.|..|||
Sbjct 2143  GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCCTTGCAGGAGATGTCCTCTGGGTTCATGAAGCCAGGCGCTTT  2216

Query 2214  CACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA  2271
            ||||.||||||||||..||||.||..|||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct 2217  CACAGACCCCTGTGATCTGTCGCTAGTTTCTCAGTCATCTAGACTCAATTCTTATTCG  2274