Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489653
• Subject: NM_001285456.1
• Aligned Length: 1151
• Identities: 876
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|                  
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAA------------------  97

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGCT  222
                                                                                 ||||.
Sbjct   98  ---------------------------------------------------------------------AAGCC  102

Query  223  GAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.
Sbjct  103  GAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGC  176

Query  297  CAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGA  364
            |      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||      ||||||
Sbjct  177  C------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGA  244

Query  365  TCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACC  438
            ||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  245  TCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACC  318

Query  439  CCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCC  511
            .||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  319  ACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCC  391

Query  512  CCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAG  585
            |||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  392  CCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAG  465

Query  586  AAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCC  659
            |||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  466  AAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCC  539

Query  660  CATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGA  733
            ||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  540  CATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCA  613

Query  734  AGGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCAT  807
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  614  AGGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAACATCCAT  687

Query  808  CATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGAT  881
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  CACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGAT  761

Query  882  TGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCC  955
            |||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  762  TGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCA  835

Query  956  GCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACACG  1029
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  836  GGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGGGACACA  909

Query 1030  TCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCT  1103
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  910  TCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACTCACCACAGCTTGCCACACT  983

Query 1104  AGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTGG  1144
            |||.||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||| 
Sbjct  984  AGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG-  1023