Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489653
• Subject: XM_006532408.3
• Aligned Length: 1238
• Identities: 946
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGA----  218
            |||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||    
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGAC  189

Query  219  --------------------------------------------------------------------------  218
                                                                                      
Sbjct  190  GTGACTGCGCCCCTAGTGGATGAGAGAGCTCCCGACAAGCAGGCCGCTGCCCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  263

Query  219  ---------AGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC  283
                     |||.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  264  AGGAATTACAGCCGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTC  337

Query  284  AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAA  357
            |||||||..|||.|      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  338  AAGCTCGTGTGGCC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAA  405

Query  358  A------CGAAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGAT  425
            |      ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGAT  479

Query  426  TCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGC  498
            .||.||.||.|||.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  480  CCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGC  552

Query  499  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCAC  572
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  553  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCAC  626

Query  573  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGA  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....||||||||||||||||
Sbjct  627  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGA  700

Query  647  CAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAG  720
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG  774

Query  721  CCGGGAGGCGGGAAGGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATT  794
            ||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  775  CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGGCTCGTT  848

Query  795  AGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAG  868
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  849  AGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGGACAGAG  922

Query  869  TCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCAC  942
            ||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  923  TCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAAACCCAC  996

Query  943  AAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGT  1016
            ||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  997  AAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACCCGTGGT  1070

Query 1017  GTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCC  1090
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1071  GTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACTCACCAC  1144

Query 1091  AGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTGG  1144
            ||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||| 
Sbjct 1145  AGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG-  1197