Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489759
• Subject: NM_001305875.1
• Aligned Length: 1979
• Identities: 1636
• Gaps: 100

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAG--GAAGCGAGTTG---CCC  69
                                                      ||||    |||||  .|.||.||  |   |||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGG----GGAAGCTTAGGCCAG--GCCACCC  26

Query   70  GTGTG----TGCA-------AG---CTGCGGCCAGAGGATCT----ATGATG--GCCAGTACCTCCAGGCCCTG  123
            .||.|    |.||       ||   ||.|||.|||||   ||    |.||||  |||||  |||  .|||||||
Sbjct   27  ATGGGCTCCTCCAGACCTCCAGAGTCTCCGGACAGAG---CTGCAGAGGATGCAGCCAG--CCT--TGGCCCTG  93

Query  124  AACGCGGACTGGCACGCAGACT-------------GCTTCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACC  184
            |     ||..|.|.|||.|.||             |||  |.|||.||.||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct   94  A-----GAAGGACCCGCTGCCTCCACCTCCGTGGGGCT--AAGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACC  160

Query  185  AGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGG  258
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  161  AGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGG  234

Query  259  TGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTG  332
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  235  TGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTG  308

Query  333  CCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGC  406
            ||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  309  CCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCTACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCC  382

Query  407  ACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCC  480
            |.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  383  AGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAACAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCC  456

Query  481  CACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCC  554
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  457  CACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCATGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCC  530

Query  555  GCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCGGGCTGCATGA  628
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  531  TCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACACTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGACCCAGGCTGCATGA  604

Query  629  GCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTG  702
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  605  GCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGTG  678

Query  703  CCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCA  776
            ||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  679  CCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCCA  752

Query  777  CGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGG  850
            .||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||||||||||||.||||...|.|||||||||||..|||
Sbjct  753  TGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCCCCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAGG  826

Query  851  CGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTG  924
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||.
Sbjct  827  CAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACTA  900

Query  925  GGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCAT  998
            |.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  901  GCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCCGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAAT  974

Query  999  CTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACAC  1072
            |||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  975  CTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGGGCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACAC  1048

Query 1073  ACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTC  1146
            ||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1049  ACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTTATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCTC  1122

Query 1147  AAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAA  1220
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1123  AAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAACGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACAA  1196

Query 1221  GAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGT  1294
            |.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1197  GCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATCAAGGGCGGCACCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCCAGT  1270

Query 1295  ACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATC  1368
            ||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1271  ACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATTGCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAACATC  1344

Query 1369  ATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCT  1442
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1345  ATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCGTGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGGGCT  1418

Query 1443  GGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGC  1516
            |||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|.|.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1419  GGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAGACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGAAGC  1492

Query 1517  GCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTG  1590
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1493  GGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCAGAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAGGTG  1566

Query 1591  GATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCG  1664
            ||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1567  GACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTATCGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCCCCG  1640

Query 1665  CACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCT  1738
            |||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1641  CACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGGACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTTTCT  1714

Query 1739  TCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTG  1812
            ||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1715  TCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAAAAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGGCTA  1788

Query 1813  GAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTG  1886
            ||.||.||.|||||||||.||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.|||||
Sbjct 1789  GAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACTGGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTTCTG  1862

Query 1887  GGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC  1941
            |||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1863  GGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCCACCCCGAGGTCCCTGAC  1917