Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489760
- Subject:
- NM_001271370.1
- Aligned Length:
- 2067
- Identities:
- 1630
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGGCCGCTCGCCCACCGCACTGGGGTCCCCATCGCGCTCCAGCCCCCCGTGGGCCCAGCGCCATCCCTGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGGGTCTCAGCGGCGGTGGCAGCCGAGGTGCAGGATGCGAGAAGGCGCCCCCCGGCCGGGCTCCCGCTCCAG 148
Query 1 --------------------------------ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCA 42
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 GCCTCACGCCCCTGCGGCCCTCTGAGCCCACCATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCG 222
Query 43 GGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGATGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 116
|||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGATGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 296
Query 117 TGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 190
|||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 370
Query 191 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCGCCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTG 264
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCGCCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTG 444
Query 265 AACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTACATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAAT 338
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 AACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTACATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGAT 518
Query 339 TGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGG 412
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 519 TGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGG 592
Query 413 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTCCTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATG 486
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 593 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTCCTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATG 666
Query 487 AACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATATAGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTG 560
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACATAGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTG 740
Query 561 CCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGA 634
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 CCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGA 814
Query 635 ACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGCACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATT 708
|||||||..||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 815 ACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGCACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATC 888
Query 709 CACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCTGTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGG 782
|||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCTCTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGG 962
Query 783 CAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCC 856
|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 CAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCC 1036
Query 857 TGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAG 930
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAG 1110
Query 931 CCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCAGATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGC 1004
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..|
Sbjct 1111 CCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCAGATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACC 1184
Query 1005 CATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGTACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1078
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGTACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1258
Query 1079 CGAAAGAACTCAGGA----------------------------------------------------------- 1093
|.||.||||||||||
Sbjct 1259 CAAAGGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCTGGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGC 1332
Query 1094 -------------------------------------------------------------AGGACCTGGTGCT 1106
|||||||||||||
Sbjct 1333 GGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCCGGCCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCT 1406
Query 1107 GCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCA 1180
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCTCTGGGCGCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCA 1480
Query 1181 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGC 1254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1481 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGC 1554
Query 1255 CCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTA 1328
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||||.|..||||
Sbjct 1555 CCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGCTCTGGAGGTTCCAGTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTA 1628
Query 1329 CCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1402
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAGGGCCCCCCATCACTGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1702
Query 1403 CACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCC 1476
.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1703 TACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCC 1776
Query 1477 TCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTC 1550
||..||.||||.|||||.|||||.|||||||||||...||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1777 TCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACCCCCATTGCCCCGTTGCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATC 1850
Query 1551 ACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGC 1624
||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||.|||||||..|||||.|
Sbjct 1851 ACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCAGCCCTCCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCAC 1924
Query 1625 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCT 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1925 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACAGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCT 1998
Query 1699 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG 1767
|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1999 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGGTCTCCATGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA 2067