Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489763
• Subject: NM_001040106.2
• Aligned Length: 2916
• Identities: 2577
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCAGGCGGGAGCAGGGGAGCTCTGGCCTGGGTTCAGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            |||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CAGCAGCTCAGGCCTGGGCAGTGGTTACATCGGAAGGGTCTTCGGCATCGGGAGGCAGCAGGTCACCGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTCGCTCTTGTCTTTCTGGTGAGAACAAGCAATGGGGTGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  CGTATGTTTGTCAACAATGAACATGACCTCCAGGTGTGCAAGAGGGAGATCCAGATCATGAGAGACCTATCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCACAAGAACATTGTGGGCTACATTGATTCTAGTATCAACAATGTGAGCAGCGGCGACGTCTGGGAAGTTCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TTCTCATGGACTTCTGCAGAGGAGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGTCTCCAGACAGGCTTCACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTGCAGATATTCTGTGACACCTGTGAAGCTGTGGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCCATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAATATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCTTGTGTGACTTTGGAAGTG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            |||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAGGCCGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTCTCCTATCGAGCCCCAGAAATGGTCAACTTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGATATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  TCTAGGCTGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCGTTTGGGGAGAGCCAGGTGGCGATTTGTGACG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            |||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGCTTCACAATTCCTGATAACTCTCGTTATTCTCAAGATATGCACTGCCTTATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTTTCATACTTCTCATTTAAACTACTCAAGAAAGAATGCCCCGT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAACTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAAGCAGCTGTGAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACCGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATCGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCAAACCCAGGCATCCTTCCCATCCAGCCAGCCCTGACTCCTCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||.|||.
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCTACCTCAGGCTGCAGGACCCAGCAATCAGCCTGGACTTCTACCCAGTGTTTCCCAACCTAAAG  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||.|||||||.||.|||||.|.|..|.||||..|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCACACCCAGTCAACCTCTTCAGTCATCTCAACCCAAGCAACCACAAGCTCCACCCACCCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406
            ||.|||.||||.|||.|.||.|||.|||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1333  ACACCTGCTACCCAGACACAAGGTTTGCCCACCCAGGCCCAGGCCACTCCCCAGCACCAGCAGCAACACCTCCT  1406

Query 1407  CAAG---CAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGC--ACAGCA-----GCAGCCGGCAGGCACGTTTTAC  1470
            ||||   |||||.||.||||||||||||||.|.| ||||  ||||||     .|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAACAGCCTCAG-CAGCCTACAGCACCACCACAGCCTGCAGGCACCTTTTAC  1479

Query 1471  ------------------CAGCAGCAGCAGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGCA  1526
                              ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1480  CAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGGCTCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAGCCCAGCA  1553

Query 1527  ACCAGCAATTGCTCAGTTCCCTGTGGTGTCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGC  1600
            |||||..|.|||||||||||||||||.||||||.|||||..||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1554  ACCAGTCACTGCTCAGTTCCCTGTGGGGTCCCAGGGAGGTGCTCAGCAACAGCTGATGCAGAACTTCTACCACC  1627

Query 1601  AGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACT  1674
            |||||||.||||||         |||||.|||||.|||                        |||||||||.||
Sbjct 1628  AGCAGCAACAGCAG---------CAGCAGCAGCAGCAG------------------------CAGCTGATGGCT  1668

Query 1675  CAGCAGGCTGCCTTGCAGCAAAAGCCCACTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCC  1748
            ||||||||||||.|||||||.|||.|..||.||   |.||.||..|||.|.|||.|||||||.||..|||||||
Sbjct 1669  CAGCAGGCTGCCCTGCAGCAGAAGACTGCTGTG---GTAGTACCACAGTCTCAGGCACAGCCCGCCACAGCCCC  1739

Query 1749  ACAGCCAGCCCCTGCCCAGGAACCAG---CGATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCC  1819
            ||||.||||..||||||||||.||.|   .|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1740  ACAGGCAGCTGCTGCCCAGGAGCCTGGGCAGATTCAAGCCCCAGTGAGACAACAGCCAAAAGTTCAGACCACTC  1813

Query 1820  CACCTCCTGCCGTCCAGGGGCAGAAAGTTGGATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGG  1893
            |||||||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1814  CACCTCCAACCATCCAGGGACAGAAAGTTGGATCTCTCACTCCTCCATCATCACCCAAAACCCAACGTGCTGGG  1887

Query 1894  CACAGGCGTATTCTCAGTGACGTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCT  1967
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  CACAGACGGATTCTCAGTGATGTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTTCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCT  1961

Query 1968  CCAGGCAGCTGCAGCTGAGGCCAGTCTCAATAAGTCCAAGTCTGCAACCACCACTCCATCAGGCTCTCCTCGGA  2041
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1962  CCAGGCAGCTGCAGCTGAGGCCAGTCTCAATAAATCTAAGTCTGCAACCACCACTCCCTCAGGCTCTCCACGGA  2035

Query 2042  CCTCTCAACAAAACGTTTATAATCCTTCAGAAGGGTCTACGTGGAATCCCTTTGATGACGATAATTTCTCCAAA  2115
            |.||.||.||.||.||.|..|||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2036  CTTCACAGCAGAATGTCTCCAATGCTTCAGAAGGCTCCACATGGAATCCTTTTGATGACGACAACTTCTCCAAA  2109

Query 2116  CTCACAGCTGAAGAACTGCTAAACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGCAAACATCCCGAGAAGCTTGGAGG  2189
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|||||||||||.||
Sbjct 2110  CTCACAGCTGAAGAGCTGCTAAACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGAAAGCTGCCTGAGAAGCTTGGTGG  2183

Query 2190  CTCAGCTGAGAGTTTGATCCCAGGCTTTCAATCAACCCAAGGTGATGCTTTTGCTACGACCTCATTTTCTGCTG  2263
            |||.||.||||||||||||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||..|.||..|.||.||||||||||
Sbjct 2184  CTCTGCAGAGAGTTTGATCCCAGGCTTCCAGCCAACACAAGGAGATGCCTTCACCACTCCTTCTTTTTCTGCTG  2257

Query 2264  GAACTGCTGAAAAAAGGAAGGGTGGGCAGACTGTGGACTCTGGCCTCCCGCTTCTAAGCGTGTCTGATCCTTTC  2337
            ||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2258  GAACTGCTGAAAAAAGGAAGGGGGGCCAGGCTGTGGACTCTGGCATCCCACTTCTAAGTGTGTCTGATCCCTTC  2331

Query 2338  ATTCCTCTTCAAGTACCTGATGCACCAGAAAAACTAATTGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCT  2411
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332  ATTCCTCTTCAAGTACCTGATGCTCCAGAAAAACTAATCGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCT  2405

Query 2412  CCCTGACCTCTTGCCTATGACAGATCCTTTTGGTAGCACTTCTGATGCTGTAATTGAAAAAGCTGATGTTGCTG  2485
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2406  CCCTGACCTCTTGCCTATGACAGATCCTTTTGGCAGCACTTCTGATGCTGTTATTGACAAAGCTGATGTTGCTG  2479

Query 2486  TTGAGAGTCTCATACCAGGACTGGAGCCCCCAGTTCCCCAGCGCCTCCCATCTCAGACGGAATCTGTGACCTCG  2559
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2480  TTGAGAGTCTCATACCTGGACTGGAGCCACCTGTTGCTCAGCGCCTCCCATCTCAAACGGAATCTGTGACCTCG  2553

Query 2560  AATCGCACAGATTCTCTCACCGGGGAAGATTCCCTGCTTGATTGCTCTCTGCTCTCTAACCCTACTACTGACCT  2633
            ||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||.|||
Sbjct 2554  AACCGCACAGACTCTCTCACGGGGGAAGACTCTCTGCTTGACTGCTCTCTGCTTTCTAACCCTACTGCTGGCCT  2627

Query 2634  TCTGGAAGAGTTTGCCCCCACAGCAATCTCTGCT-CCAGTCCATAAAGCTGCAGAAGATAGTAATCTCATCTCA  2706
            ||||||.|||||||||||||.||||.|||||||| |||.| ||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2628  TCTGGAGGAGTTTGCCCCCATAGCACTCTCTGCTCCCACT-CATAAAGCTGCAGAAGATAGCAATCTCATCTCA  2700

Query 2707  GGTTTTGATGTCCCTGAGGGCTCGGACAAGGTGGCTGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTATTGATAACCAA  2780
            |||||||.|||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||
Sbjct 2701  GGTTTTGGTGTTGCTGAGGGCTCCGAAAAGGTGGCAGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTACTAATTACCAA  2774

Query 2781  AAACCCACAAGGTGGGCACTCTAGAAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTT  2854
            ||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775  AAACACACAAGGTGGGCACTCTAGGAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTT  2848

Query 2855  TACTGCTGGTGGATCAGCTCATAGACCTGG  2884
            |.||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2849  TGCTGCTGGTGGATCAGCTCATAGACCTG-  2877