Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489763
• Subject: NM_001371577.1
• Aligned Length: 2897
• Identities: 2000
• Gaps: 888

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406

Query 1407  CAAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGCACAGCAGCAGCCGGCAGGCACGTTTTACCAGCAGCAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGCACAGCAGCAGCCGGCAGGCACGTTTTACCAGCAGCAGC  1480

Query 1481  AGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGCAACCAGCAATTGCTCAGTTCCCTGTGGTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGAAACCAGCAATTGCTCAGTTCCCTGTGGTG  1554

Query 1555  TCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCA  1628

Query 1629  ACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACTCAGCAGGCTGCCTTGCAGCAAAAGCCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACTCAGCAGGCTGCCTTGCAGCAAAAGCCCA  1702

Query 1703  CTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCCACAGCCAGCCCCTGCCCAGGAACCAGCG  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  CTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCCACAGCCAGCCCCTGCCCAGGAGCCAGCG  1776

Query 1777  ATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCACCTCCTGCCGTCCAGGGGCAGAAAGTTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCACCTCCTGCCGTCCAGGGGCAGAAAGTTGG  1850

Query 1851  ATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGGCGTATTCTCAGTGACGTAACCCACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGGCGTATTCTCAGTGACGTAACCCACA  1924

Query 1925  GTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGGCCAGTCTCAAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||
Sbjct 1925  GTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGG-CAG----AAT  1993

Query 1999  -------------AAGTCCAAGTCTGCAACCACCACTCCATCAGGCTCTCCTCGGACCTCTCAACAAAACGTTT  2059
                         .||.|..|.|.||||.                                             
Sbjct 1994  TGCTTGACCCAGGGAGGCAGACTTTGCAG---------------------------------------------  2022

Query 2060  ATAATCCTTCAGAAGGGTCTACGTGGAATCCCTTTGATGACGATAATTTCTCCAAACTCACAGCTGAAGAACTG  2133
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2134  CTAAACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGCAAACATCCCGAGAAGCTTGGAGGCTCAGCTGAGAGTTTGAT  2207
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2208  CCCAGGCTTTCAATCAACCCAAGGTGATGCTTTTGCTACGACCTCATTTTCTGCTGGAACTGCTGAAAAAAGGA  2281
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2282  AGGGTGGGCAGACTGTGGACTCTGGCCTCCCGCTTCTAAGCGTGTCTGATCCTTTCATTCCTCTTCAAGTACCT  2355
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2356  GATGCACCAGAAAAACTAATTGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCCTGACCTCTTGCCTAT  2429
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2430  GACAGATCCTTTTGGTAGCACTTCTGATGCTGTAATTGAAAAAGCTGATGTTGCTGTTGAGAGTCTCATACCAG  2503
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2504  GACTGGAGCCCCCAGTTCCCCAGCGCCTCCCATCTCAGACGGAATCTGTGACCTCGAATCGCACAGATTCTCTC  2577
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2578  ACCGGGGAAGATTCCCTGCTTGATTGCTCTCTGCTCTCTAACCCTACTACTGACCTTCTGGAAGAGTTTGCCCC  2651
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2652  CACAGCAATCTCTGCTCCAGTCCATAAAGCTGCAGAAGATAGTAATCTCATCTCAGGTTTTGATGTCCCTGAGG  2725
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2726  GCTCGGACAAGGTGGCTGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTATTGATAACCAAAAACCCACAAGGTGGGCAC  2799
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2800  TCTAGAAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTACTGCTGGTGGATCAGCT  2873
                                                                                      
Sbjct 2023  --------------------------------------------------------------------------  2022

Query 2874  CATAGACCTGG  2884
                       
Sbjct 2023  -----------  2022