Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489763
• Subject: NM_177762.6
• Aligned Length: 2895
• Identities: 2393
• Gaps: 272

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCAGGCGGGAGCAGGGGAGCTCTGGCCTGGGTTCAGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            |||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CAGCAGCTCAGGCCTGGGCAGTGGTTACATCGGAAGGGTCTTCGGCATCGGGAGGCAGCAGGTCACCGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTCGCTCTTGTCTTTCTGGTGAGAACAAGCAATGGGGTGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  CGTATGTTTGTCAACAATGAACATGACCTCCAGGTGTGCAAGAGGGAGATCCAGATCATGAGAGACCTATCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCACAAGAACATTGTGGGCTACATTGATTCTAGTATCAACAATGTGAGCAGCGGCGACGTCTGGGAAGTTCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TTCTCATGGACTTCTGCAGAGGAGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGTCTCCAGACAGGCTTCACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTGCAGATATTCTGTGACACCTGTGAAGCTGTGGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCCATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAATATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCTTGTGTGACTTTGGAAGTG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            |||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAGGCCGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTCTCCTATCGAGCCCCAGAAATGGTCAACTTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGATATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  TCTAGGCTGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCGTTTGGGGAGAGCCAGGTGGCGATTTGTGACG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            |||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGCTTCACAATTCCTGATAACTCTCGTTATTCTCAAGATATGCACTGCCTTATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTTTCATACTTCTCATTTAAACTACTCAAGAAAGAATGCCCCGT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAACTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAAGCAGCTGTGAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACCGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATCGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCAAACCCAGGCATCCTTCCCATCCAGCCAGCCCTGACTCCTCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||.|||.
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCTACCTCAGGCTGCAGGACCCAGCAATCAGCCTGGACTTCTACCCAGTGTTTCCCAACCTAAAG  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||.|||||||.||.|||||.|.|..|.||||..|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCACACCCAGTCAACCTCTTCAGTCATCTCAACCCAAGCAACCACAAGCTCCACCCACCCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406
            ||.|||.||||.|||.|.||.|||.|||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1333  ACACCTGCTACCCAGACACAAGGTTTGCCCACCCAGGCCCAGGCCACTCCCCAGCACCAGCAGCAACACCTCCT  1406

Query 1407  CAAG---CAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGC--ACAGCA-----GCAGCCGGCAGGCACGTTTTAC  1470
            ||||   |||||.||.||||||||||||||.|.| ||||  ||||||     .|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAACAGCCTCAG-CAGCCTACAGCACCACCACAGCCTGCAGGCACCTTTTAC  1479

Query 1471  CAGCAGCAGCAGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGCAACCAGCAATTGCTCAGTT  1544
            ||||||||||||                                                              
Sbjct 1480  CAGCAGCAGCAG--------------------------------------------------------------  1491

Query 1545  CCCTGTGGTGTCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAC  1618
                                                                ||.|||||||||||||||    
Sbjct 1492  ----------------------------------------------------CAACAGCAGCAGCAGCAG----  1509

Query 1619  AACAACAGCAACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACTCAGCAGGCTGCCTTGCAG  1692
                                                          |||.| |||||||||         ||| 
Sbjct 1510  ----------------------------------------------GCTCA-GACTCAGCA---------GCA-  1526

Query 1693  CAAAAGCCCACTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCCACAGCCAGCCCCTGCCCA  1766
                                                                                      
Sbjct 1527  --------------------------------------------------------------------------  1526

Query 1767  GGAACCAGCGATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCACCTCCTGCCGTCCAGGGGC  1840
                     |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..||.|||||||.|
Sbjct 1527  ---------GATTCAAGCCCCAGTGAGACAACAGCCAAAAGTTCAGACCACTCCACCTCCAACCATCCAGGGAC  1591

Query 1841  AGAAAGTTGGATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGGCGTATTCTCAGTGAC  1914
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1592  AGAAAGTTGGATCTCTCACTCCTCCATCATCACCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGACGGATTCTCAGTGAT  1665

Query 1915  GTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGGC  1988
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  GTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTTCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGGC  1739

Query 1989  CAGTCTCAATAAGTCCAAGTCTGCAACCACCACTCCATCAGGCTCTCCTCGGACCTCTCAACAAAACGTTTATA  2062
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|..|
Sbjct 1740  CAGTCTCAATAAATCTAAGTCTGCAACCACCACTCCCTCAGGCTCTCCACGGACTTCACAGCAGAATGTCTCCA  1813

Query 2063  ATCCTTCAGAAGGGTCTACGTGGAATCCCTTTGATGACGATAATTTCTCCAAACTCACAGCTGAAGAACTGCTA  2136
            ||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1814  ATGCTTCAGAAGGCTCCACATGGAATCCTTTTGATGACGACAACTTCTCCAAACTCACAGCTGAAGAGCTGCTA  1887

Query 2137  AACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGCAAACATCCCGAGAAGCTTGGAGGCTCAGCTGAGAGTTTGATCCC  2210
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1888  AACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGAAAGCTGCCTGAGAAGCTTGGTGGCTCTGCAGAGAGTTTGATCCC  1961

Query 2211  AGGCTTTCAATCAACCCAAGGTGATGCTTTTGCTACGACCTCATTTTCTGCTGGAACTGCTGAAAAAAGGAAGG  2284
            ||||||.||..||||.|||||.|||||.||..|.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962  AGGCTTCCAGCCAACACAAGGAGATGCCTTCACCACTCCTTCTTTTTCTGCTGGAACTGCTGAAAAAAGGAAGG  2035

Query 2285  GTGGGCAGACTGTGGACTCTGGCCTCCCGCTTCTAAGCGTGTCTGATCCTTTCATTCCTCTTCAAGTACCTGAT  2358
            |.||.|||.||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036  GGGGCCAGGCTGTGGACTCTGGCATCCCACTTCTAAGTGTGTCTGATCCCTTCATTCCTCTTCAAGTACCTGAT  2109

Query 2359  GCACCAGAAAAACTAATTGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCCTGACCTCTTGCCTATGAC  2432
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110  GCTCCAGAAAAACTAATCGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCCTGACCTCTTGCCTATGAC  2183

Query 2433  AGATCCTTTTGGTAGCACTTCTGATGCTGTAATTGAAAAAGCTGATGTTGCTGTTGAGAGTCTCATACCAGGAC  2506
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2184  AGATCCTTTTGGCAGCACTTCTGATGCTGTTATTGACAAAGCTGATGTTGCTGTTGAGAGTCTCATACCTGGAC  2257

Query 2507  TGGAGCCCCCAGTTCCCCAGCGCCTCCCATCTCAGACGGAATCTGTGACCTCGAATCGCACAGATTCTCTCACC  2580
            |||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2258  TGGAGCCACCTGTTGCTCAGCGCCTCCCATCTCAAACGGAATCTGTGACCTCGAACCGCACAGACTCTCTCACG  2331

Query 2581  GGGGAAGATTCCCTGCTTGATTGCTCTCTGCTCTCTAACCCTACTACTGACCTTCTGGAAGAGTTTGCCCCCAC  2654
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 2332  GGGGAAGACTCTCTGCTTGACTGCTCTCTGCTTTCTAACCCTACTGCTGGCCTTCTGGAGGAGTTTGCCCCCAT  2405

Query 2655  AGCAATCTCTGCT-CCAGTCCATAAAGCTGCAGAAGATAGTAATCTCATCTCAGGTTTTGATGTCCCTGAGGGC  2727
            ||||.|||||||| |||.| ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||||||
Sbjct 2406  AGCACTCTCTGCTCCCACT-CATAAAGCTGCAGAAGATAGCAATCTCATCTCAGGTTTTGGTGTTGCTGAGGGC  2478

Query 2728  TCGGACAAGGTGGCTGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTATTGATAACCAAAAACCCACAAGGTGGGCACTC  2801
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2479  TCCGAAAAGGTGGCAGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTACTAATTACCAAAAACACACAAGGTGGGCACTC  2552

Query 2802  TAGAAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTACTGCTGGTGGATCAGCTCA  2875
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2553  TAGGAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTGCTGCTGGTGGATCAGCTCA  2626

Query 2876  TAGACCTGG  2884
            |||||||| 
Sbjct 2627  TAGACCTG-  2634