Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489763
• Subject: XM_006506192.1
• Aligned Length: 2913
• Identities: 2577
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCAGGCGGGAGCAGGGGAGCTCTGGCCTGGGTTCAGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            |||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CAGCAGCTCAGGCCTGGGCAGTGGTTACATCGGAAGGGTCTTCGGCATCGGGAGGCAGCAGGTCACCGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTCGCTCTTGTCTTTCTGGTGAGAACAAGCAATGGGGTGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  CGTATGTTTGTCAACAATGAACATGACCTCCAGGTGTGCAAGAGGGAGATCCAGATCATGAGAGACCTATCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCACAAGAACATTGTGGGCTACATTGATTCTAGTATCAACAATGTGAGCAGCGGCGACGTCTGGGAAGTTCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TTCTCATGGACTTCTGCAGAGGAGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGTCTCCAGACAGGCTTCACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTGCAGATATTCTGTGACACCTGTGAAGCTGTGGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCCATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAATATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCTTGTGTGACTTTGGAAGTG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            |||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAGGCCGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTCTCCTATCGAGCCCCAGAAATGGTCAACTTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGATATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  TCTAGGCTGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCGTTTGGGGAGAGCCAGGTGGCGATTTGTGACG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            |||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGCTTCACAATTCCTGATAACTCTCGTTATTCTCAAGATATGCACTGCCTTATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTTTCATACTTCTCATTTAAACTACTCAAGAAAGAATGCCCCGT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAACTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAAGCAGCTGTGAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACCGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATCGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCAAACCCAGGCATCCTTCCCATCCAGCCAGCCCTGACTCCTCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||.|||.
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCTACCTCAGGCTGCAGGACCCAGCAATCAGCCTGGACTTCTACCCAGTGTTTCCCAACCTAAAG  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||.|||||||.||.|||||.|.|..|.||||..|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCACACCCAGTCAACCTCTTCAGTCATCTCAACCCAAGCAACCACAAGCTCCACCCACCCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406
            ||.|||.||||.|||.|.||.|||.|||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1333  ACACCTGCTACCCAGACACAAGGTTTGCCCACCCAGGCCCAGGCCACTCCCCAGCACCAGCAGCAACACCTCCT  1406

Query 1407  CAAG---CAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGC--ACAGCA-----GCAGCCGGCAGGCACGTTTTAC  1470
            ||||   |||||.||.||||||||||||||.|.| ||||  ||||||     .|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAACAGCCTCAG-CAGCCTACAGCACCACCACAGCCTGCAGGCACCTTTTAC  1479

Query 1471  ------------------CAGCAGCAGCAGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGCA  1526
                              ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1480  CAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGGCTCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAGCCCAGCA  1553

Query 1527  ACCAGCAATTGCTCAGTTCCCTGTGGTGTCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGC  1600
            |||||..|.|||||||||||||||||.||||||.|||||..||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1554  ACCAGTCACTGCTCAGTTCCCTGTGGGGTCCCAGGGAGGTGCTCAGCAACAGCTGATGCAGAACTTCTACCACC  1627

Query 1601  AGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAGCAACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACT  1674
            |||||||.||||||         |||||.|||||.|||                        |||||||||.||
Sbjct 1628  AGCAGCAACAGCAG---------CAGCAGCAGCAGCAG------------------------CAGCTGATGGCT  1668

Query 1675  CAGCAGGCTGCCTTGCAGCAAAAGCCCACTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCC  1748
            ||||||||||||.|||||||.|||.|..||.||   |.||.||..|||.|.|||.|||||||.||..|||||||
Sbjct 1669  CAGCAGGCTGCCCTGCAGCAGAAGACTGCTGTG---GTAGTACCACAGTCTCAGGCACAGCCCGCCACAGCCCC  1739

Query 1749  ACAGCCAGCCCCTGCCCAGGAACCAGCGATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCAC  1822
            ||||.||||..||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1740  ACAGGCAGCTGCTGCCCAGGAGCCTGGGATTCAAGCCCCAGTGAGACAACAGCCAAAAGTTCAGACCACTCCAC  1813

Query 1823  CTCCTGCCGTCCAGGGGCAGAAAGTTGGATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCAC  1896
            ||||..||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814  CTCCAACCATCCAGGGACAGAAAGTTGGATCTCTCACTCCTCCATCATCACCCAAAACCCAACGTGCTGGGCAC  1887

Query 1897  AGGCGTATTCTCAGTGACGTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCA  1970
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  AGACGGATTCTCAGTGATGTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTTCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCA  1961

Query 1971  GGCAGCTGCAGCTGAGGCCAGTCTCAATAAGTCCAAGTCTGCAACCACCACTCCATCAGGCTCTCCTCGGACCT  2044
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1962  GGCAGCTGCAGCTGAGGCCAGTCTCAATAAATCTAAGTCTGCAACCACCACTCCCTCAGGCTCTCCACGGACTT  2035

Query 2045  CTCAACAAAACGTTTATAATCCTTCAGAAGGGTCTACGTGGAATCCCTTTGATGACGATAATTTCTCCAAACTC  2118
            |.||.||.||.||.|..|||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2036  CACAGCAGAATGTCTCCAATGCTTCAGAAGGCTCCACATGGAATCCTTTTGATGACGACAACTTCTCCAAACTC  2109

Query 2119  ACAGCTGAAGAACTGCTAAACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGCAAACATCCCGAGAAGCTTGGAGGCTC  2192
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2110  ACAGCTGAAGAGCTGCTAAACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGAAAGCTGCCTGAGAAGCTTGGTGGCTC  2183

Query 2193  AGCTGAGAGTTTGATCCCAGGCTTTCAATCAACCCAAGGTGATGCTTTTGCTACGACCTCATTTTCTGCTGGAA  2266
            .||.||||||||||||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||..|.||..|.||.|||||||||||||
Sbjct 2184  TGCAGAGAGTTTGATCCCAGGCTTCCAGCCAACACAAGGAGATGCCTTCACCACTCCTTCTTTTTCTGCTGGAA  2257

Query 2267  CTGCTGAAAAAAGGAAGGGTGGGCAGACTGTGGACTCTGGCCTCCCGCTTCTAAGCGTGTCTGATCCTTTCATT  2340
            |||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2258  CTGCTGAAAAAAGGAAGGGGGGCCAGGCTGTGGACTCTGGCATCCCACTTCTAAGTGTGTCTGATCCCTTCATT  2331

Query 2341  CCTCTTCAAGTACCTGATGCACCAGAAAAACTAATTGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCC  2414
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332  CCTCTTCAAGTACCTGATGCTCCAGAAAAACTAATCGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCC  2405

Query 2415  TGACCTCTTGCCTATGACAGATCCTTTTGGTAGCACTTCTGATGCTGTAATTGAAAAAGCTGATGTTGCTGTTG  2488
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2406  TGACCTCTTGCCTATGACAGATCCTTTTGGCAGCACTTCTGATGCTGTTATTGACAAAGCTGATGTTGCTGTTG  2479

Query 2489  AGAGTCTCATACCAGGACTGGAGCCCCCAGTTCCCCAGCGCCTCCCATCTCAGACGGAATCTGTGACCTCGAAT  2562
            |||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2480  AGAGTCTCATACCTGGACTGGAGCCACCTGTTGCTCAGCGCCTCCCATCTCAAACGGAATCTGTGACCTCGAAC  2553

Query 2563  CGCACAGATTCTCTCACCGGGGAAGATTCCCTGCTTGATTGCTCTCTGCTCTCTAACCCTACTACTGACCTTCT  2636
            ||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2554  CGCACAGACTCTCTCACGGGGGAAGACTCTCTGCTTGACTGCTCTCTGCTTTCTAACCCTACTGCTGGCCTTCT  2627

Query 2637  GGAAGAGTTTGCCCCCACAGCAATCTCTGCT-CCAGTCCATAAAGCTGCAGAAGATAGTAATCTCATCTCAGGT  2709
            |||.|||||||||||||.||||.|||||||| |||.| ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2628  GGAGGAGTTTGCCCCCATAGCACTCTCTGCTCCCACT-CATAAAGCTGCAGAAGATAGCAATCTCATCTCAGGT  2700

Query 2710  TTTGATGTCCCTGAGGGCTCGGACAAGGTGGCTGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTATTGATAACCAAAAA  2783
            ||||.|||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 2701  TTTGGTGTTGCTGAGGGCTCCGAAAAGGTGGCAGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTACTAATTACCAAAAA  2774

Query 2784  CCCACAAGGTGGGCACTCTAGAAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTAC  2857
            |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2775  CACACAAGGTGGGCACTCTAGGAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTGC  2848

Query 2858  TGCTGGTGGATCAGCTCATAGACCTGG  2884
            |||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2849  TGCTGGTGGATCAGCTCATAGACCTG-  2874