Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489763
• Subject: XM_017321597.1
• Aligned Length: 2895
• Identities: 2390
• Gaps: 275

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCCGGCGAGAGCAGGGCGGCTCTGGCCTGGGCTCCGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAGTTTTTCGACTCCAGGCGGGAGCAGGGGAGCTCTGGCCTGGGTTCAGGCTCCAGCGGAGGAGGGGG  74

Query   75  CAGCACCTCGGGCCTGGGCAGTGGCTACATCGGAAGAGTCTTCGGCATCGGGCGACAGCAGGTCACAGTGGACG  148
            |||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CAGCAGCTCAGGCCTGGGCAGTGGTTACATCGGAAGGGTCTTCGGCATCGGGAGGCAGCAGGTCACCGTGGACG  148

Query  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTTGCTATTGTATTTCTGGTGAGGACAAGCAATGGGATGAAATGTGCCTTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGTGTTGGCGGAAGGTGGATTCGCTCTTGTCTTTCTGGTGAGAACAAGCAATGGGGTGAAATGTGCCTTGAAA  222

Query  223  CGCATGTTTGTCAACAATGAGCATGATCTCCAGGTGTGCAAGAGAGAAATCCAGATAATGAGGGATCTTTCAGG  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  CGTATGTTTGTCAACAATGAACATGACCTCCAGGTGTGCAAGAGGGAGATCCAGATCATGAGAGACCTATCAGG  296

Query  297  GCACAAGAATATTGTGGGTTACATTGATTCTAGTATCAACAACGTGAGTAGCGGTGATGTATGGGAAGTGCTCA  370
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCACAAGAACATTGTGGGCTACATTGATTCTAGTATCAACAATGTGAGCAGCGGCGACGTCTGGGAAGTTCTCA  370

Query  371  TTCTGATGGACTTTTGTAGAGGTGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGCCTGCAAACAGGCTTTACAGAG  444
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct  371  TTCTCATGGACTTCTGCAGAGGAGGCCAGGTGGTAAACCTGATGAACCAGCGTCTCCAGACAGGCTTCACAGAG  444

Query  445  AATGAAGTGCTCCAGATATTTTGTGATACCTGTGAAGCTGTTGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCTATTAT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AATGAAGTGCTGCAGATATTCTGTGACACCTGTGAAGCTGTGGCCCGCCTGCATCAGTGCAAAACTCCCATTAT  518

Query  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAACATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCCTGTGTGACTTTGGAAGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACCGGGACCTGAAGGTTGAAAATATCCTCTTGCATGACCGAGGCCACTATGTCTTGTGTGACTTTGGAAGTG  592

Query  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAAACTGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666
            |||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAACAAATTCCAGAATCCACAGGCCGAGGGAGTCAATGCAGTAGAAGATGAGATTAAGAAATACACAACG  666

Query  667  CTGTCCTATCGAGCACCAGAAATGGTCAACCTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGACATTTGGGC  740
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CTCTCCTATCGAGCCCCAGAAATGGTCAACTTGTACAGTGGCAAAATCATCACTACGAAGGCAGATATTTGGGC  740

Query  741  TCTTGGATGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCATTTGGGGAAAGTCAGGTGGCAATTTGTGATG  814
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  TCTAGGCTGTTTGTTGTATAAATTATGCTACTTCACTTTGCCGTTTGGGGAGAGCCAGGTGGCGATTTGTGACG  814

Query  815  GAAACTTCACAATTCCTGATAATTCTCGATATTCTCAAGACATGCACTGCCTAATTAGGTATATGTTGGAACCA  888
            |||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGCTTCACAATTCCTGATAACTCTCGTTATTCTCAAGATATGCACTGCCTTATTAGGTATATGTTGGAACCA  888

Query  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTGTCCTACTTCTCATTTAAGCTACTCAAGAAAGAGTGCCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  889  GACCCTGACAAAAGGCCGGATATTTACCAGGTTTCATACTTCTCATTTAAACTACTCAAGAAAGAATGCCCCGT  962

Query  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAGCTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAGGCAGCTGCAAAAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||
Sbjct  963  TCCAAATGTACAGAACTCTCCCATTCCTGCAAAACTTCCTGAACCAGTGAAAGCCAGTGAAGCAGCTGTGAAAA  1036

Query 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACAGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATTGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCCAGCCAAAGGCCAGACTGACCGATCCCATTCCCACCACAGAGACTTCAATCGCACCCCGCCAGAGGCCT  1110

Query 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCGAACCCAGGAATCCTTCCCATCCAGCCAGCGCTGACACCCCGGAAGAGGGCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCTGGGCAGACTCAGCCAAACCCAGGCATCCTTCCCATCCAGCCAGCCCTGACTCCTCGGAAGAGGGCCAC  1184

Query 1185  TGTTCAGCCCCCACCTCAGGCTGCAGGATCCAGCAATCAGCCTGGCCTTTTAGCCAGTGTTCCCCAACCAAAAC  1258
            |||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||.|||.
Sbjct 1185  TGTTCAGCCCCTACCTCAGGCTGCAGGACCCAGCAATCAGCCTGGACTTCTACCCAGTGTTTCCCAACCTAAAG  1258

Query 1259  CCCAAGCCCCACCCAGCCAGCCTCTGCCGCAAACTCAGGCCAAGCAGCCACAGGCTCCTCCCACTCCACAGCAG  1332
            ||||||||.|||||||.||.|||||.|.|..|.||||..|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1259  CCCAAGCCACACCCAGTCAACCTCTTCAGTCATCTCAACCCAAGCAACCACAAGCTCCACCCACCCCACAGCAG  1332

Query 1333  ACGCCTTCTACTCAGGCCCAGGGTCTGCCCGCTCAGGCCCAGGCCACACCCCAGCACCAGCAGCAACTCTTCCT  1406
            ||.|||.||||.|||.|.||.|||.|||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1333  ACACCTGCTACCCAGACACAAGGTTTGCCCACCCAGGCCCAGGCCACTCCCCAGCACCAGCAGCAACACCTCCT  1406

Query 1407  CAAG---CAGCAACAGCAGCAGCAACAGCCACCGCCAGC--ACAGCA-----GCAGCCGGCAGGCACGTTTTAC  1470
            ||||   |||||.||.||||||||||||||.|.| ||||  ||||||     .|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGCAGCAACAGCAGCAACAGCCTCAG-CAGCCTACAGCACCACCACAGCCTGCAGGCACCTTTTAC  1479

Query 1471  CAGCAGCAGCAGGCCCAGACTCAGCAGTTTCAGGCAGTACATCCAGCAACCCAGCAACCAGCAATTGCTCAGTT  1544
            ||||||||||||                                                              
Sbjct 1480  CAGCAGCAGCAG--------------------------------------------------------------  1491

Query 1545  CCCTGTGGTGTCCCAAGGAGGCTCTCAACAGCAGCTAATGCAGAATTTCTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAC  1618
                                                                ||.|||||||||||||||    
Sbjct 1492  ----------------------------------------------------CAACAGCAGCAGCAGCAG----  1509

Query 1619  AACAACAGCAACAGCAACAGCTGGCCACAGCCCTGCATCAACAACAGCTGATGACTCAGCAGGCTGCCTTGCAG  1692
                                                          |||.| |||||||||             
Sbjct 1510  ----------------------------------------------GCTCA-GACTCAGCA-------------  1523

Query 1693  CAAAAGCCCACTATGGCAGCAGGACAGCAGCCCCAGCCACAGCCAGCTGCAGCCCCACAGCCAGCCCCTGCCCA  1766
                                                                                      
Sbjct 1524  --------------------------------------------------------------------------  1523

Query 1767  GGAACCAGCGATTCAAGCCCCAGTAAGACAACAGCCAAAGGTTCAGACAACCCCACCTCCTGCCGTCCAGGGGC  1840
                     |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..||.|||||||.|
Sbjct 1524  ---------GATTCAAGCCCCAGTGAGACAACAGCCAAAAGTTCAGACCACTCCACCTCCAACCATCCAGGGAC  1588

Query 1841  AGAAAGTTGGATCTCTCACTCCACCCTCATCCCCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGGCGTATTCTCAGTGAC  1914
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1589  AGAAAGTTGGATCTCTCACTCCTCCATCATCACCCAAAACCCAACGTGCTGGGCACAGACGGATTCTCAGTGAT  1662

Query 1915  GTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTCCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGGC  1988
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663  GTAACCCACAGTGCAGTCTTTGGGGTTCCTGCCAGCAAATCAACCCAGCTGCTCCAGGCAGCTGCAGCTGAGGC  1736

Query 1989  CAGTCTCAATAAGTCCAAGTCTGCAACCACCACTCCATCAGGCTCTCCTCGGACCTCTCAACAAAACGTTTATA  2062
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|..|
Sbjct 1737  CAGTCTCAATAAATCTAAGTCTGCAACCACCACTCCCTCAGGCTCTCCACGGACTTCACAGCAGAATGTCTCCA  1810

Query 2063  ATCCTTCAGAAGGGTCTACGTGGAATCCCTTTGATGACGATAATTTCTCCAAACTCACAGCTGAAGAACTGCTA  2136
            ||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1811  ATGCTTCAGAAGGCTCCACATGGAATCCTTTTGATGACGACAACTTCTCCAAACTCACAGCTGAAGAGCTGCTA  1884

Query 2137  AACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGCAAACATCCCGAGAAGCTTGGAGGCTCAGCTGAGAGTTTGATCCC  2210
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1885  AACAAGGACTTTGCCAAGCTTGGGGAAGGAAAGCTGCCTGAGAAGCTTGGTGGCTCTGCAGAGAGTTTGATCCC  1958

Query 2211  AGGCTTTCAATCAACCCAAGGTGATGCTTTTGCTACGACCTCATTTTCTGCTGGAACTGCTGAAAAAAGGAAGG  2284
            ||||||.||..||||.|||||.|||||.||..|.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959  AGGCTTCCAGCCAACACAAGGAGATGCCTTCACCACTCCTTCTTTTTCTGCTGGAACTGCTGAAAAAAGGAAGG  2032

Query 2285  GTGGGCAGACTGTGGACTCTGGCCTCCCGCTTCTAAGCGTGTCTGATCCTTTCATTCCTCTTCAAGTACCTGAT  2358
            |.||.|||.||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033  GGGGCCAGGCTGTGGACTCTGGCATCCCACTTCTAAGTGTGTCTGATCCCTTCATTCCTCTTCAAGTACCTGAT  2106

Query 2359  GCACCAGAAAAACTAATTGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCCTGACCTCTTGCCTATGAC  2432
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2107  GCTCCAGAAAAACTAATCGAGGGACTCAAATCTCCTGACACTTCTCTTCTGCTCCCTGACCTCTTGCCTATGAC  2180

Query 2433  AGATCCTTTTGGTAGCACTTCTGATGCTGTAATTGAAAAAGCTGATGTTGCTGTTGAGAGTCTCATACCAGGAC  2506
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2181  AGATCCTTTTGGCAGCACTTCTGATGCTGTTATTGACAAAGCTGATGTTGCTGTTGAGAGTCTCATACCTGGAC  2254

Query 2507  TGGAGCCCCCAGTTCCCCAGCGCCTCCCATCTCAGACGGAATCTGTGACCTCGAATCGCACAGATTCTCTCACC  2580
            |||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2255  TGGAGCCACCTGTTGCTCAGCGCCTCCCATCTCAAACGGAATCTGTGACCTCGAACCGCACAGACTCTCTCACG  2328

Query 2581  GGGGAAGATTCCCTGCTTGATTGCTCTCTGCTCTCTAACCCTACTACTGACCTTCTGGAAGAGTTTGCCCCCAC  2654
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 2329  GGGGAAGACTCTCTGCTTGACTGCTCTCTGCTTTCTAACCCTACTGCTGGCCTTCTGGAGGAGTTTGCCCCCAT  2402

Query 2655  AGCAATCTCTGCT-CCAGTCCATAAAGCTGCAGAAGATAGTAATCTCATCTCAGGTTTTGATGTCCCTGAGGGC  2727
            ||||.|||||||| |||.| ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||||||
Sbjct 2403  AGCACTCTCTGCTCCCACT-CATAAAGCTGCAGAAGATAGCAATCTCATCTCAGGTTTTGGTGTTGCTGAGGGC  2475

Query 2728  TCGGACAAGGTGGCTGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTATTGATAACCAAAAACCCACAAGGTGGGCACTC  2801
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2476  TCCGAAAAGGTGGCAGAAGATGAGTTTGACCCTATTCCTGTACTAATTACCAAAAACACACAAGGTGGGCACTC  2549

Query 2802  TAGAAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTACTGCTGGTGGATCAGCTCA  2875
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2550  TAGGAACAGCAGTGGGAGCTCTGAGTCCAGTCTTCCCAACCTAGCCAGGTCTTTGCTGCTGGTGGATCAGCTCA  2623

Query 2876  TAGACCTGG  2884
            |||||||| 
Sbjct 2624  TAGACCTG-  2631