Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489782
• Subject: NM_001287218.2
• Aligned Length: 2562
• Identities: 1407
• Gaps: 1155

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTTCCAATCAAAATTCTCCCATTAGAACTTTTGGTCTCAATCTTTCTTCGGATTCTTCAGCACTAGGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTTGCTTCTGACAGTGAACAGAGCAAAACAGAAGAAGAACGGGAAAGTCGTAGCCTCTTTCCTGGCAGTTTAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCCGAAGCTTGGCAAGAGAGATTATTTGGAGAAAGCAGGAGAATTAATAAAGCTGGCTTTAAAAAAGGAAGAA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAAGACGACTATGAAGCTGCTTCTGATTTTTATAGGAAGGGAGTTGATTTACTCCTAGAAGGTGTTCAAGGAGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GTCAAGCCCTACCCGTCGAGAAGCTGTGAAGAGAAGAACAGCCGAGTACCTCATGCGGGCAGAAAGTATCTCTA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GTCTTTATGGGAAACCTCAGCTTGATGATGTATCTCAGGTTTTACTTGTAATGGACACAAGGACAGAACAGACT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  TTCATTTTAAAAGGTCTAAGGAAAAGCAGTGAATACAGCAGGAACAGAAAGACCATCATCCCCCGCTGTGTGCC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CAACATGGTGTGTCTGCATAAGTACATCATCTCTGAGGAGTCAGTATTTCTTGTGCTGCAGCATGCGGAAGGTG  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  GCAAACTGTGGTCATATATCAGTAAATTTCTAAACAGAAGTCCTGAAGAAAGCTTTGACATCAAGGAAGTGAAA  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  AAACCTACACTTGCAAAAGTTCACCTGCAGCAGCCAACTTCTAGTCCTCAGGACAGCAGTAGCTTTGAATCCAG  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  AGGAAGTGATGGTGGAAGCATGCTTAAAGCTCTGCCTTTGAAGAGTAGTCTTACTCCAAGTTCTCAAGATGACA  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  GCAACCAGGAAGATGATGGCCAAGATAGCTCTCCAAAGTGGCCAGATTCTGGTTCAAGTTCAGAAGAAGAATGT  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  ACTACTAGTTATTTAACATTATGCAATGAATATGGGCAAGAAAAGATTGAACCAGGGTCTTTGAATGAGGAGCC  962

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  963  CTTCATGAAGACTGAAGGGAATGGTGTTGATACAAAAGCTATTAAAAGCTTCCCAGCACACCTTGCTGCTGACA  1036

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct 1037  GTGACAGCCCCAGCACACAGCTGAGAGCTCACGAGCTGAAGTTCTTCCCCAACGATGACCCAGAAGCAGTTAGT  1110

Query    1  ---------------------------------------------ATGGAATTCTTTAGGATAGACAGTAAGGA  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCCAAGAACATCAGATTCCCTCAGTAGATCAAAAAATAGCCCCATGGAATTCTTTAGGATAGACAGTAAGGA  1184

Query   30  TAGCGCAAGTGAACTCCTGGGACTTGACTTTGGAGAAAAATTGTATAGTCTAAAATCAGAACCTTTGAAACCAT  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGCGCAAGTGAACTCCTGGGACTTGACTTTGGAGAAAAATTGTATAGTCTAAAATCAGAACCTTTGAAACCAT  1258

Query  104  TCTTTACTCTTCCAGATGGAGACAGTGCTTCTAGGAGTTTTAATACTAGTGAAAGCAAGGTAGAGTTTAAAGCT  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTTACTCTTCCAGATGGAGACAGTGCTTCTAGGAGTTTTAATACTAGTGAAAGCAAGGTAGAGTTTAAAGCT  1332

Query  178  CAGGACACCATTAGCAGGGGCTCAGATGACTCAGTGCCAGTTATTTCATTTAAAGATGCTGCTTTTGATGATGT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGACACCATTAGCAGGGGCTCAGATGACTCAGTGCCAGTTATTTCATTTAAAGATGCTGCTTTTGATGATGT  1406

Query  252  CAGTGGTACTGATGAAGGAAGACCTGATCTTCTTGTAAATTTACCTGGTGAATTGGAGTCAACAAGAGAAGCTG  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGTGGTACTGATGAAGGAAGACCTGATCTTCTTGTAAATTTACCTGGTGAATTGGAGTCAACAAGAGAAGCTG  1480

Query  326  CAGCAATGGGACCTACTAAGTTTACACAAACTAATATAGGGATAATAGAAAATAAACTCTTGGAAGCCCCTGAT  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCAATGGGACCTACTAAGTTTACACAAACTAATATAGGGATAATAGAAAATAAACTCTTGGAAGCCCCTGAT  1554

Query  400  GTTTTATGCCTCAGGCTTAGTACTGAACAATGCCAAGCACATGAGGAGAAAGGCATAGAGGAACTGAGTGATCC  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTTTATGCCTCAGGCTTAGTACTGAACAATGCCAAGCACATGAGGAGAAAGGCATAGAGGAACTGAGTGATCC  1628

Query  474  CTCTGGGCCCAAATCCTATAGTATAACAGAGAAACACTATGCACAGGAGGATCCCAGGATGTTATTTGTAGCAG  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCTGGGCCCAAATCCTATAGTATAACAGAGAAACACTATGCACAGGAGGATCCCAGGATGTTATTTGTAGCAG  1702

Query  548  CTGTTGATCATAGTAGTTCAGGAGATATGTCTTTGTTACCCAGCTCAGATCCTAAGTTTCAAGGACTTGGAGTG  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGTTGATCATAGTAGTTCAGGAGATATGTCTTTGTTACCCAGCTCAGATCCTAAGTTTCAAGGACTTGGAGTG  1776

Query  622  GTTGAGTCAGCAGTAACTGCAAACAACACAGAAGAAAGCTTATTCCGTATTTGTAGTCCACTCTCAGGTGCTAA  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTTGAGTCAGCAGTAACTGCAAACAACACAGAAGAAAGCTTATTCCGTATTTGTAGTCCACTCTCAGGTGCTAA  1850

Query  696  TGAATATATTGCAAGCACAGACACTTTAAAAACAGAAGAAGTATTGCTGTTTACAGATCAGACTGATGATTTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAATATATTGCAAGCACAGACACTTTAAAAACAGAAGAAGTATTGCTGTTTACAGATCAGACTGATGATTTGG  1924

Query  770  CTAAAGAGGAACCAACTTCTTTATTCCAGAGAGACTCTGAGACTAAGGGTGAAAGTGGTTTAGTGCTAGAAGGA  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTAAAGAGGAACCAACTTCTTTATTCCAGAGAGACTCTGAGACTAAGGGTGAAAGTGGTTTAGTGCTAGAAGGA  1998

Query  844  GACAAGGAAATACATCAGATTTTTGAGGACCTTGATAAAAAATTAGCACTAGCCTCCAGGTTTTACATCCCAGA  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACAAGGAAATACATCAGATTTTTGAGGACCTTGATAAAAAATTAGCACTAGCCTCCAGGTTTTACATCCCAGA  2072

Query  918  GGGCTGCATTCAAAGATGGGCAGCTGAAATGGTGGTAGCCCTTGATGCTTTACATAGAGAGGGAATTGTGTGCC  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGGCTGCATTCAAAGATGGGCAGCTGAAATGGTGGTAGCCCTTGATGCTTTACATAGAGAGGGAATTGTGTGCC  2146

Query  992  GCGATTTGAACCCAAACAACATCTTATTGAATGATAGAGGACACATTCAGCTAACGTATTTTAGCAGGTGGAGT  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCGATTTGAACCCAAACAACATCTTATTGAATGATAGAGGACACATTCAGCTAACGTATTTTAGCAGGTGGAGT  2220

Query 1066  GAGGTTGAAGATTCCTGTGACAGCGATGCCATAGAGAGAATGTACTGTGCCCCAGAGGTTGGAGCAATCACTGA  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGGTTGAAGATTCCTGTGACAGCGATGCCATAGAGAGAATGTACTGTGCCCCAGAGGTTGGAGCAATCACTGA  2294

Query 1140  AGAAACTGAAGCCTGTGATTGGTGGAGTTTGGGTGCTGTCCTCTTTGAACTTCTCACTGGCAAGACTCTGGTTG  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGAAACTGAAGCCTGTGATTGGTGGAGTTTGGGTGCTGTCCTCTTTGAACTTCTCACTGGCAAGACTCTGGTTG  2368

Query 1214  AATGCCATCCAGCAGGAATAAATACTCACACTACTTTGAACATGCCAGAATGTGTCTCTGAAGAGGCTCGCTCA  1287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AATGCCATCCAGCAGGAATAAATACTCACACTACTTTGAACATGCCAGAATGTGTCTCTGAAGAGGCTCGCTCA  2442

Query 1288  CTCATTCAACAGCTCTTGCAGTTCAATCCTCTGGAACGACTTGGTGCTGGAGTTGCTGGTGTTGAAGATATCAA  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTCATTCAACAGCTCTTGCAGTTCAATCCTCTGGAACGACTTGGTGCTGGAGTTGCTGGTGTTGAAGATATCAA  2516

Query 1362  ATCTCATCCATTTTTTACCCCTGTGGATTGGGCAGAACTGATGAGA  1407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ATCTCATCCATTTTTTACCCCTGTGGATTGGGCAGAACTGATGAGA  2562