Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000489782
Subject:
NM_001349668.1
Aligned Length:
1803
Identities:
1407
Gaps:
396

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTAAAGCTCTGCCTTTGAAGAGTAGTCTTACTCCAAGTTCTCAAGATGACAGCAACCAGGAAGATGATGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCAAGATAGCTCTCCAAAGTGGCCAGATTCTGGTTCAAGTTCAGAAGAAGAATGTACTACTAGTTATTTAACAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TATGCAATGAATATGGGCAAGAAAAGATTGAACCAGGGTCTTTGAATGAGGAGCCCTTCATGAAGACTGAAGGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AATGGTGTTGATACAAAAGCTATTAAAAGCTTCCCAGCACACCTTGCTGCTGACAGTGACAGCCCCAGCACACA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCTGAGAGCTCACGAGCTGAAGTTCTTCCCCAACGATGACCCAGAAGCAGTTAGTTCTCCAAGAACATCAGATT  370

Query    1  --------------------------ATGGAATTCTTTAGGATAGACAGTAAGGATAGCGCAAGTGAACTCCTG  48
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCAGTAGATCAAAAAATAGCCCCATGGAATTCTTTAGGATAGACAGTAAGGATAGCGCAAGTGAACTCCTG  444

Query   49  GGACTTGACTTTGGAGAAAAATTGTATAGTCTAAAATCAGAACCTTTGAAACCATTCTTTACTCTTCCAGATGG  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGACTTGACTTTGGAGAAAAATTGTATAGTCTAAAATCAGAACCTTTGAAACCATTCTTTACTCTTCCAGATGG  518

Query  123  AGACAGTGCTTCTAGGAGTTTTAATACTAGTGAAAGCAAGGTAGAGTTTAAAGCTCAGGACACCATTAGCAGGG  196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAGTGCTTCTAGGAGTTTTAATACTAGTGAAAGCAAGGTAGAGTTTAAAGCTCAGGACACCATTAGCAGGG  592

Query  197  GCTCAGATGACTCAGTGCCAGTTATTTCATTTAAAGATGCTGCTTTTGATGATGTCAGTGGTACTGATGAAGGA  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCAGATGACTCAGTGCCAGTTATTTCATTTAAAGATGCTGCTTTTGATGATGTCAGTGGTACTGATGAAGGA  666

Query  271  AGACCTGATCTTCTTGTAAATTTACCTGGTGAATTGGAGTCAACAAGAGAAGCTGCAGCAATGGGACCTACTAA  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACCTGATCTTCTTGTAAATTTACCTGGTGAATTGGAGTCAACAAGAGAAGCTGCAGCAATGGGACCTACTAA  740

Query  345  GTTTACACAAACTAATATAGGGATAATAGAAAATAAACTCTTGGAAGCCCCTGATGTTTTATGCCTCAGGCTTA  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTTACACAAACTAATATAGGGATAATAGAAAATAAACTCTTGGAAGCCCCTGATGTTTTATGCCTCAGGCTTA  814

Query  419  GTACTGAACAATGCCAAGCACATGAGGAGAAAGGCATAGAGGAACTGAGTGATCCCTCTGGGCCCAAATCCTAT  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTACTGAACAATGCCAAGCACATGAGGAGAAAGGCATAGAGGAACTGAGTGATCCCTCTGGGCCCAAATCCTAT  888

Query  493  AGTATAACAGAGAAACACTATGCACAGGAGGATCCCAGGATGTTATTTGTAGCAGCTGTTGATCATAGTAGTTC  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTATAACAGAGAAACACTATGCACAGGAGGATCCCAGGATGTTATTTGTAGCAGCTGTTGATCATAGTAGTTC  962

Query  567  AGGAGATATGTCTTTGTTACCCAGCTCAGATCCTAAGTTTCAAGGACTTGGAGTGGTTGAGTCAGCAGTAACTG  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGAGATATGTCTTTGTTACCCAGCTCAGATCCTAAGTTTCAAGGACTTGGAGTGGTTGAGTCAGCAGTAACTG  1036

Query  641  CAAACAACACAGAAGAAAGCTTATTCCGTATTTGTAGTCCACTCTCAGGTGCTAATGAATATATTGCAAGCACA  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAACAACACAGAAGAAAGCTTATTCCGTATTTGTAGTCCACTCTCAGGTGCTAATGAATATATTGCAAGCACA  1110

Query  715  GACACTTTAAAAACAGAAGAAGTATTGCTGTTTACAGATCAGACTGATGATTTGGCTAAAGAGGAACCAACTTC  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACACTTTAAAAACAGAAGAAGTATTGCTGTTTACAGATCAGACTGATGATTTGGCTAAAGAGGAACCAACTTC  1184

Query  789  TTTATTCCAGAGAGACTCTGAGACTAAGGGTGAAAGTGGTTTAGTGCTAGAAGGAGACAAGGAAATACATCAGA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTATTCCAGAGAGACTCTGAGACTAAGGGTGAAAGTGGTTTAGTGCTAGAAGGAGACAAGGAAATACATCAGA  1258

Query  863  TTTTTGAGGACCTTGATAAAAAATTAGCACTAGCCTCCAGGTTTTACATCCCAGAGGGCTGCATTCAAAGATGG  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTTGAGGACCTTGATAAAAAATTAGCACTAGCCTCCAGGTTTTACATCCCAGAGGGCTGCATTCAAAGATGG  1332

Query  937  GCAGCTGAAATGGTGGTAGCCCTTGATGCTTTACATAGAGAGGGAATTGTGTGCCGCGATTTGAACCCAAACAA  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAGCTGAAATGGTGGTAGCCCTTGATGCTTTACATAGAGAGGGAATTGTGTGCCGCGATTTGAACCCAAACAA  1406

Query 1011  CATCTTATTGAATGATAGAGGACACATTCAGCTAACGTATTTTAGCAGGTGGAGTGAGGTTGAAGATTCCTGTG  1084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCTTATTGAATGATAGAGGACACATTCAGCTAACGTATTTTAGCAGGTGGAGTGAGGTTGAAGATTCCTGTG  1480

Query 1085  ACAGCGATGCCATAGAGAGAATGTACTGTGCCCCAGAGGTTGGAGCAATCACTGAAGAAACTGAAGCCTGTGAT  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACAGCGATGCCATAGAGAGAATGTACTGTGCCCCAGAGGTTGGAGCAATCACTGAAGAAACTGAAGCCTGTGAT  1554

Query 1159  TGGTGGAGTTTGGGTGCTGTCCTCTTTGAACTTCTCACTGGCAAGACTCTGGTTGAATGCCATCCAGCAGGAAT  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGTGGAGTTTGGGTGCTGTCCTCTTTGAACTTCTCACTGGCAAGACTCTGGTTGAATGCCATCCAGCAGGAAT  1628

Query 1233  AAATACTCACACTACTTTGAACATGCCAGAATGTGTCTCTGAAGAGGCTCGCTCACTCATTCAACAGCTCTTGC  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAATACTCACACTACTTTGAACATGCCAGAATGTGTCTCTGAAGAGGCTCGCTCACTCATTCAACAGCTCTTGC  1702

Query 1307  AGTTCAATCCTCTGGAACGACTTGGTGCTGGAGTTGCTGGTGTTGAAGATATCAAATCTCATCCATTTTTTACC  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGTTCAATCCTCTGGAACGACTTGGTGCTGGAGTTGCTGGTGTTGAAGATATCAAATCTCATCCATTTTTTACC  1776

Query 1381  CCTGTGGATTGGGCAGAACTGATGAGA  1407
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCTGTGGATTGGGCAGAACTGATGAGA  1803