Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489783
• Subject: XM_006520747.1
• Aligned Length: 1194
• Identities: 1078
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAAACGAGACAGTCAGTGAACTGAACCAAACACAGCTTCAGCCACGAGCAGTGGTGGCCTTAGAATACCA  74
            |||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||..||||.|||||||.|||||..||||||.|.||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGAATGATACTGTCAGTGAAATGAACCAAACCGAGCTCCAGCCACAAGCAGCTGTGGCCCTCGAGTACCA  74

Query   75  GGTGGTCACCATCTTACTTGTACTCATTATTTGTGGCCTGGGCATTGTAGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTTG  148
            ||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGTGGTTACCATCTTACTTGTGGTCATTATTTGTGGACTGGGCATTGTGGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTGG  148

Query  149  TCATGAGAACCAAGCACATGAGGACCCCCACAAACTGCTACCTGGTGAGCCTGGCAGTAGCTGATCTCATGGTC  222
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGAGAACAAAGCACATGAGAACCCCTACAAACTGTTACCTGGTAAGTCTGGCTGTGGCAGATCTCATGGTT  222

Query  223  TTGGTGGCCGCAGGCCTCCCCAACATAACAGACAGTATCTACGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGATGCCT  296
            .|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CTGGTGGCTGCAGGCCTCCCCAACATAACCGACAGTATCTATGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGCTGCCT  296

Query  297  CTGCATTACTTACCTCCAGTATTTGGGAATTAATGCATCCTCTTGTTCAATAACAGCCTTTACCATTGAGAGGT  370
            |||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CTGCATTACATATCTCCAGTACCTAGGCATTAATGCATCTTCATGTTCAATAACGGCCTTTACCATTGAAAGGT  370

Query  371  ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACATTTTCCAGAGCCAAAAAGATTATCATCTTT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACGTTTTCCAGAGCCAAAAAAATCATCATCTTT  444

Query  445  GTCTGGGCTTTCACATCTCTTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCTTGCTGGATCTCAATATTAGCACCTACAAAGA  518
            ||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||.|
Sbjct  445  GTCTGGGCCTTCACATCCATTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCCTGCTGGATCTCAACATCAGCACCTACAAAAA  518

Query  519  TGCTATTGTGATATCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAATTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG  592
            .|||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCTGTTGTGGTTTCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAACTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG  592

Query  593  TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCTACCGTCCTCTATGGATTCATAGCTAGAATCCTTTTCTTAAATCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCCACTGTGCTTTATGGATTTATAGCTAGAATCCTCTTCTTAAACCCC  666

Query  667  ATTCCTTCAGATCCTAAAGAAAACTCTAAGACATGGAAAAATGATTCAACCCATCAGAACACAAATCTGAATGT  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||||.|||||||||||..|||.|||||.|
Sbjct  667  ATTCCTTCAGACCCTAAAGAAAACTCTAAGATGTGGAAAAATGACTCAATCCATCAGAACAAGAATTTGAATTT  740

Query  741  AAATACCTCTAATAGATGTTTCAACAGCACAGTATCTTCAAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTGGCAGTGGTTG  814
            ||||.||.|.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  AAATGCCACCAACAGATGCTTCAACAGCACTGTATCTTCCAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTCGCAGTGGTTG  814

Query  815  TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTAGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGTCCTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTTGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGCCCTTTC  888

Query  889  CAAGAAAATTGGTTTTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCGGTGATTTACAA  962
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  CAGGAAAATTGGTTCTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCAGTGATTTACAA  962

Query  963  TCTCATGTCCCAGAAATTCCGTGCAGCCTTCAGAAAGCTCTGCAACTGCAAGCAGAAGCCAACAGAGAAACCTG  1036
            .||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct  963  CCTCATGTCTCAGAAATTTCGTGCAGCCTTCAGGAAGCTCTGCAATTGCAAGCAGAAGCCCACAGAAAAAGCTG  1036

Query 1037  CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGCGTCATCAAGGAGTCAGACCATTTCAGCACAGAGCTTGATGATATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGTGTCATCAAGGAGTCAGACCGCTTCAGCACAGAGCTAGAAGATATC  1110

Query 1111  ACTGTCACTGACACTTACCTGTCTGCCACAAAAGTGTCTTTTGATGACACCTGCTTGGCTTCTGAGGTATCCTT  1184
            ||.|||||.||.||.||..||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1111  ACCGTCACCGATACGTATGTGTCAACCACAAAAGTGTCCTTTGATGACACCTGCTTGGCCTCTGAGGTAACCTT  1184

Query 1185  TAGCCAAAGT  1194
            |||.||.||.
Sbjct 1185  TAGTCAGAGC  1194