Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489800
- Subject:
- NM_001122892.1
- Aligned Length:
- 1634
- Identities:
- 1433
- Gaps:
- 55
Alignment
Query 1 ATGGGCTGTGTACAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG 74
|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG 74
Query 75 CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT 148
Query 149 ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG 222
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 149 ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG 222
Query 223 ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA 296
|||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA 296
Query 297 TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT 370
Query 371 CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG 444
||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG 444
Query 445 TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT 518
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT 518
Query 519 TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG 592
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG 592
Query 593 ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA 666
||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA 666
Query 667 ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAGAGCTGCAGGT----------------CTCTGCTGCCGCC 724
|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||..||| ||.||.|..|..|
Sbjct 667 ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAAAGCTGATGGTTTGTGTTTTAACTTAACTGTGGTTTCATC 740
Query 725 TAGTAGTTCCCTGTCACAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATC 798
.|||.||.||| |||||| |||...||| ||.|| |||||||..||||||.|.
Sbjct 741 AAGTTGTACCC---CACAAA------------CTTCTGGAT-TGGCT---------AAAGATGCTTGGGAAGTT 789
Query 799 CCTCGAGAATCCCTGCAGTTGAT------CAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTT-GGGGAAGTATGGATGGGTA 865
.|.||.||.|| ||||.| .||||..|||||..| |||..|||| |..|||||.|||.|.||||
Sbjct 790 GCACGTGACTC------GTTGTTTCTGGAGAAGAAGCTGGGGCA-GGGGTGTTTCGCTGAAGTGTGGCTTGGTA 856
Query 866 CCTGGAATGGAAACACAAAAGTAGCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAG 939
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 857 CCTGGAATGGAAATACAAAAGTAGCCATAAAGACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAG 930
Query 940 GAAGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCAT 1013
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 931 GAGGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCATGACAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCAT 1004
Query 1014 CTACATCGTCACCGAGTATATGAACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGA 1087
.|||||||||||.|||||.||||.||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1005 TTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAAGGAAGTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGA 1078
Query 1088 AATTACCAAATCTTGTGGACATGGCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATC 1161
|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 AGTTGCCAAACCTTGTGGACATGGCGGCACAGGTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATC 1152
Query 1162 CATAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGC 1235
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1153 CACAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGC 1226
Query 1236 CCGATTGATAGAAGACAATGAGTACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGG 1309
.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1227 TCGGTTGATTGAAGACAATGAATACACAGCAAGACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAG 1300
Query 1310 CAGCCCTGTACGGGAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACC 1383
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 CGGCCCTGTATGGAAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACC 1374
Query 1384 AAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCC 1457
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct 1375 AAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCC 1448
Query 1458 CTGCCCGCAGGACTGCCCCATCTCTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCC 1531
||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1449 CTGCCCACAGGACTGCCCGATCTCCCTGCACGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCC 1522
Query 1532 CCACTTTTGAGTACTTGCAGAGCTTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAA 1605
|.||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1523 CGACCTTCGAGTACTTGCAGGGCTTCCTGGAGGACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAA 1596
Query 1606 AACCTG 1611
||||||
Sbjct 1597 AACCTG 1602