Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489805
• Subject: NM_201367.3
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1323
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGGACATAACGGGAGCTGGATCTCTCCAAATGCCAGCGAGCCGCACAACGCGTCCGGCGCCGAGGCTGCGGG  74
            |||||.||.|||.|.||||||.|.||.||.||..|||||.|.||||.||||.||||.||||||||||||   ||
Sbjct    1  ATGGGGCACAACAGCAGCTGGGTGTCACCGAACACCAGCCACCCGCGCAACACGTCGGGCGCCGAGGCT---GG  71

Query   75  TGTGAACCGCAGCGCGCTCGGGGAGTTCGGCGAGGCGCAGCTGTACCGCCAGTTCACCACCACCGTGCAGGTCG  148
            .|..||||.|||||||.||||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  CGCCAACCTCAGCGCGTTCGGGGAGCTGAGCGAGGCTCAGCTGTACCGCCAGTTCACCACCACCGTGCAGGTCG  145

Query  149  TCATCTTCATAGGCTCGCTGCTCGAGTTTGGCAA----CATGG-----AGGTCACTAGAAAACTTG----ATAA  209
            ||||||||||.||||||||.|       |||.||    |||||     .||||       ||||||    |.||
Sbjct  146  TCATCTTCATTGGCTCGCTAC-------TGGGAAACTTCATGGTGTTATGGTC-------AACTTGCCGCACAA  205

Query  210  GAG----CAGA-CTG---CCTGGGATTAGGTTCATTAAAAACCTGGCCTGCTCGGGGATTTGTGCCAGCCTGGT  275
            .||    ||.| |||   ||    |..||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||
Sbjct  206  CAGTGTTCAAATCTGTCACC----AACAGGTTCATTAAAAACCTGGCCTGCTCCGGGATTTGTGCCAGTGTGGT  275

Query  276  CTGTGTGCCCTTCGACATCATCCTCAGCACCAGTCCTCACTGTTGCTGGTGGATCTACACCATGCTCTTCTGCA  349
            ||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  276  CTGTGTGCCCTTCGACATCATCCTGAGCAGCAGCCCTCACTGTTGCTGGTGGATCTATACGATGCTCTTCTGCA  349

Query  350  AGGTCGTCAAATTTTTGCACAAAGTATTCTGCTCTGTGACCATCCTCAGCTTCCCTGCTATTGCTTTGGACAGG  423
            ||||..|||||||..|.|||||.||.||||||||||||||..|||||||.||.|||||||||||..||||||||
Sbjct  350  AGGTGCTCAAATTCCTACACAAGGTGTTCTGCTCTGTGACTGTCCTCAGTTTTCCTGCTATTGCCCTGGACAGG  423

Query  424  TACTACTCAGTCCTCTATCCACTGGAGAGGAAAATATCTGATGCCAAGTCCCGTGAACTGGTGATGTACATCTG  497
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  424  TACTATTCAGTCCTTTATCCTCTGGAGAGAAAAATATCTGATGCCAAGTCTCGGGAGCTAGTGATGTACATCTG  497

Query  498  GGCCCATGCAGTGGTGGCCAGTGTCCCTGTGTTTGCAGTAACCAATGTGGCTGACATCTATGCCACGTCCACCT  571
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  498  GGCTCATGCAGTGGTGGCCAGTGTCCCTGTGTTTGCTGTGACCAATGTCGCTGACATCTATGCTATGTCCACCT  571

Query  572  GCACGGAAGTCTGGAGCAACTCCTTGGGCCACCTGGTGTACGTTCTGGTGTATAACATCACCACGGTCATTGTG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||..|||||||.|||||||||
Sbjct  572  GCACGGAAGTCTGGAGCAACTCCTTGGGCCACCTGGTGTATGTTCTGATCTACAATGTCACCACAGTCATTGTG  645

Query  646  CCTGTGGTGGTGGTGTTCCTCTTCTTGATACTGATCCGACGGGCCCTGAGTGCCAGCCAGAAGAAGAAGGTCAT  719
            ||.||||..|||||.||.|||||..|.||.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  646  CCCGTGGCTGTGGTATTTCTCTTTCTCATCCTGATCCGGAGGGCCCTGAGTGCCAGCCAGAAGAAGAAAGTCAT  719

Query  720  CATAGCAGCGCTCCGGACCCCACAGAACACCATCTCTATTCCCTATGCCTCCCAGCGGGAGGCCGAGCTGCACG  793
            .||.||.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  720  AATTGCTGCACTGAGGACCCCACAGAACACCATCTCTATCCCCTATGCTTCCCAGCGAGAGGCAGAGCTACATG  793

Query  794  CCACCCTGCTCTCCATGGTGATGGTCTTCATCTTGTGTAGCGTGCCCTATGCCACCCTGGTCGTCTACCAGACT  867
            |||||||||||||||||||||..||.|||||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  794  CCACCCTGCTCTCCATGGTGACAGTTTTCATTCTCTGCAGTGTACCCTATGCCACCCTGGTTGTCTACCAGACT  867

Query  868  GTGCTCAATGTCCCTGACACTTCCGTCTTCTTGCTGCTCACTGCTGTTTGGCTGCCCAAAGTCTCCCTGCTGGC  941
            |||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  868  GTGCTCAATGTACCTAACACCTCTGTCTTCTTGCTTCTCACGGCCATTTGGCTGCCCAAAGTCTCTCTGTTGGC  941

Query  942  AAACCCTGTTCTCTTTCTT-ACTGTGAACAAATCTGTCCGCAAGTGCTTGATAGGGACCCTGGTGCAACTACAC  1014
            .||||||||.||| ||||| ||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||||||||||||||..|.|||
Sbjct  942  CAACCCTGTGCTC-TTCTTAACTGTGAACAAATCGGTACGCAAGTGCTTGGTGGGGACCCTGGTGCAGTTGCAC  1014

Query 1015  CACCGGTACAGTCGCCGTAATGTGGTCAGTACAGGGAGTGGCATGGCTGAGGCCAGCCTGGAACCCAGCATACG  1088
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1015  CACCGGTACAGTCGCCGCAATGTGGTTAGTACAGGGAGTGGGGTGGCTGAGCCCAGCCTTGAGCCCAGCATGCG  1088

Query 1089  CTCGGGTAGCCAGCTCCTGGAGATGTTCCACATTGGGCAGCAGCAGATCTTTAAGCCCACAGAGGATGAGGAAG  1162
            |||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1089  CTCTGGTAGCCAGCTCTTGGAGATGTTCCACATTGGGCAGCAACAGATCTTTAAGCCCTCGGAGGATGAGGAAG  1162

Query 1163  AGAGTGAGGCCAAGTACATTGGCTCAGCTGACTTCCAGGCCAAGGAGAT----ATTTAGCACCTGCCTGGAGGG  1232
            |.||||||||||||||..|.||||||||.||.||||||||.||||||.|    |.||    ||||||..|||||
Sbjct 1163  AAAGTGAGGCCAAGTATCTCGGCTCAGCCGATTTCCAGGCAAAGGAGGTGCTCACTT----CCTGCCCAGAGGG  1232

Query 1233  AGAGCAGGGG---CCACAGTTTGCGCCCTCTGCCCCACC-CCTGAGCACAGTGGACTCTGTATCCCAGGTGGCA  1302
            .|||||||.|   ||||||.||||.||.||||..||||| ||.| |||||||||||||||.|.|.|.||||.|.
Sbjct 1233  CGAGCAGGAGCCACCACAGCTTGCACCGTCTGTGCCACCTCCAG-GCACAGTGGACTCTGAACCTCGGGTGTCC  1305

Query 1303  CCGGCAGCCCCTGTGGAACCTGAAACATTCCCTGATAAGTATTCCCTGCAGTTTGGCTTTGGGCCTTTTGAGTT  1376
            ||.|.|||.||..|||||.|||..|.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  CCAGTAGCTCCCATGGAATCTGGGATATTTCCTGATAAGTATTCCCTGCAGTTTGGCTTTGGGCCTTTTGAGTT  1379

Query 1377  GCCTCCTCAGTGGCTCTCAGAGACCCGAAACAGCAAGAAGCGGCTGCTTCCCCCCTTGGGCAACACCCCAGAAG  1450
            .||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..|||||||.||||||||||
Sbjct 1380  ACCCCCTCAGTGGCTCTCTGAGACCCGAAATAGCAAGAAGAGGCTGCTTCCCCCACTGGGCAATACCCCAGAAG  1453

Query 1451  AGCTGATCCAGACAAAGGTGCCCAAGGTAGGCAGGGTGGAGCGGAAGATGAGCAGAAACAATAAAGTGAGCATT  1524
            ||||||||||||||||||||||||..||...|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  AGCTGATCCAGACAAAGGTGCCCAGAGTGAACAGGGTGGAACGGAAGATGAGCAGAAACAATAAAGTGAGCATT  1527

Query 1525  TTTCCAAAGGTGGATTCC  1542
            |||||||||||.||.|||
Sbjct 1528  TTTCCAAAGGTAGACTCC  1545