Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489808
• Subject: NM_001278300.2
• Aligned Length: 1238
• Identities: 1002
• Gaps: 236

Alignment

Query    1  ATGAAAGACTCTCCATTTCAAGTGACAAAACTGTACTGGCTTAATGAAAAGTGGGACTTTATTGCCTCAGCTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAGACTCTCCATTTCAAGTGACAAAACTGTACTGGCTTAATGAAAAGTGGGACTTTATTGCCTCAGCTTC  74

Query   75  TGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCA  148

Query  149  TCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAG  222

Query  223  AGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGA  296

Query  297  AGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTG  370

Query  371  GGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATT  444

Query  445  AAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTT  518

Query  519  TGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGT  592

Query  593  TTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCT  666

Query  667  TTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTC  740

Query  741  CTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCA  814

Query  815  TGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTA  888

Query  889  GTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACT--  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  889  GTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTAG  962

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct  963  ACCCACAAATCACAACAAAGAGCAATCAGAACTGGTTAAAGAAGATGGTCTGGAAAGCTTGTGTGAGCAGTGCG  1036

Query  961  --------------------------------------------------------------------------  960
                                                                                      
Sbjct 1037  AGTCCAGCTCTGGTTATGGTACTGGACTGGTCCTCATGTGGAAGAGAAACAGAAGGGCCATGGGAGCCAGTGGC  1110

Query  961  ------------------------------------------GACCTCTTCCAAACTCTAACACTTAACCTCTG  992
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACCAGAAAGCAATGTGACAAGAGAGATAACCCTCCAACAGACCTCTTCCAAACTCTAACACTTAACCTCTG  1184

Query  993  CTATTCTGCATAAATTCTGAGAAAAGCCAAATTTTCTGTCGGTCTAAGAAGACA  1046
            ||||||||||                                            
Sbjct 1185  CTATTCTGCA--------------------------------------------  1194