Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489808
• Subject: XM_017006223.1
• Aligned Length: 1203
• Identities: 1017
• Gaps: 169

Alignment

Query    1  ATGAAAGACTCTCCATTTCAAGTGACAAAACTGTACTGGCTTAATGAAAAGTGGGACTTTATTGCCTCAGCTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAGACTCTCCATTTCAAGTGACAAAACTGTACTGGCTTAATGAAAAGTGGGACTTTATTGCCTCAGCTTC  74

Query   75  TGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCA  148

Query  149  TCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAG  222

Query  223  AGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGA  296

Query  297  AGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTG  370

Query  371  GGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATT  444

Query  445  AAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTT  518

Query  519  TGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGT  592

Query  593  TTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCT  666

Query  667  TTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTC  740

Query  741  CTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCA  814

Query  815  TGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTA  888

Query  889  GTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACT-G  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  889  GTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTAG  962

Query  962  ACCTCTTCCA-AACTC-TAACA---------CTTAACCTCTGCT--------AT--TCTGCATAAATTCTGAGA  1014
            ||     ||| ||.|| .||||         |..||   |||.|        ||  ||||.|.|..||.||.||
Sbjct  963  AC-----CCACAAATCACAACAAAGAGCAATCAGAA---CTGGTTAAAGAAGATGGTCTGGAAAGCTTGTGTGA  1028

Query 1015  AAAG-------CCAAATTTTCTG----TCGGT------------CTAA----GAAGACA---------------  1046
            ..||       |||   ..||||    | |||            ||.|    |||||.|               
Sbjct 1029  GCAGTGCGAGTCCA---GCTCTGGTTAT-GGTACTGGACTGGTCCTCATGTGGAAGAGAAACAGAAGGGCCATG  1098

Query 1047  --------------------------------------------------------------------------  1046
                                                                                      
Sbjct 1099  GGAGCCAGTGGCCAGACCAGAAAGCAATGTGACAAGAGAGATAACCCTCCAACAGTGAGTCTTTCAGAGCCCCG  1172

Query 1047  -------------------  1046
                               
Sbjct 1173  TTTAAAAATCCTATACATG  1191